Weitere AWS SDK Beispiele sind im Repo AWS Doc SDK Examples
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HealthLake Anwendungsbeispiele SDK für Python (Boto3)
Die folgenden Codebeispiele zeigen Ihnen, wie Sie mithilfe von AWS SDK for Python (Boto3) with Aktionen ausführen und allgemeine Szenarien implementieren HealthLake.
Aktionen sind Codeauszüge aus größeren Programmen und müssen im Kontext ausgeführt werden. Aktionen zeigen Ihnen zwar, wie Sie einzelne Servicefunktionen aufrufen, aber Sie können Aktionen im Kontext der zugehörigen Szenarien sehen.
Jedes Beispiel enthält einen Link zum vollständigen Quellcode, in dem Sie Anweisungen zum Einrichten und Ausführen des Codes im Kontext finden.
Themen
Aktionen
Das folgende Codebeispiel zeigt die VerwendungCreateFHIRDatastore
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- SDKfür Python (Boto3)
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Anmerkung
Es gibt noch mehr dazu. GitHub Sie sehen das vollständige Beispiel und erfahren, wie Sie das AWS -Code-Beispiel-Repository
einrichten und ausführen. @classmethod def from_client(cls) -> "HealthLakeWrapper": """ Creates a HealthLakeWrapper instance with a default AWS HealthLake client. :return: An instance of HealthLakeWrapper initialized with the default HealthLake client. """ health_lake_client = boto3.client("healthlake") return cls(health_lake_client) def create_fhir_datastore( self, datastore_name: str, sse_configuration: dict[str, any] = None, identity_provider_configuration: dict[str, any] = None, ) -> dict[str, str]: """ Creates a new HealthLake datastore. When creating a SMART on FHIR datastore, the following parameters are required: - sse_configuration: The server-side encryption configuration for a SMART on FHIR-enabled data store. - identity_provider_configuration: The identity provider configuration for a SMART on FHIR-enabled data store. :param datastore_name: The name of the data store. :param sse_configuration: The server-side encryption configuration for a SMART on FHIR-enabled data store. :param identity_provider_configuration: The identity provider configuration for a SMART on FHIR-enabled data store. :return: A dictionary containing the data store information. """ try: parameters = {"DatastoreName": datastore_name, "DatastoreTypeVersion": "R4"} if ( sse_configuration is not None and identity_provider_configuration is not None ): # Creating a SMART on FHIR-enabled data store parameters["SseConfiguration"] = sse_configuration parameters[ "IdentityProviderConfiguration" ] = identity_provider_configuration response = self.health_lake_client.create_fhir_datastore(**parameters) return response except ClientError as err: logger.exception( "Couldn't create datastore %s. Here's why %s", datastore_name, err.response["Error"]["Message"], ) raise
Der folgende Code zeigt ein Beispiel für Parameter für einen SMART HealthLake Datenspeicher mit FHIR aktivierter Option.
sse_configuration = { "KmsEncryptionConfig": {"CmkType": "AWS_OWNED_KMS_KEY"} } # TODO: Update the metadata to match your environment. metadata = { "issuer": "https://ehr.example.com", "jwks_uri": "https://ehr.example.com/.well-known/jwks.json", "authorization_endpoint": "https://ehr.example.com/auth/authorize", "token_endpoint": "https://ehr.token.com/auth/token", "token_endpoint_auth_methods_supported": [ "client_secret_basic", "foo", ], "grant_types_supported": ["client_credential", "foo"], "registration_endpoint": "https://ehr.example.com/auth/register", "scopes_supported": ["openId", "profile", "launch"], "response_types_supported": ["code"], "management_endpoint": "https://ehr.example.com/user/manage", "introspection_endpoint": "https://ehr.example.com/user/introspect", "revocation_endpoint": "https://ehr.example.com/user/revoke", "code_challenge_methods_supported": ["S256"], "capabilities": [ "launch-ehr", "sso-openid-connect", "client-public", ], } # TODO: Update the IdpLambdaArn. identity_provider_configuration = { "AuthorizationStrategy": "SMART_ON_FHIR_V1", "FineGrainedAuthorizationEnabled": True, "IdpLambdaArn": "arn:aws:lambda:your-region:your-account-id:function:your-lambda-name", "Metadata": json.dumps(metadata), } data_store = self.create_fhir_datastore( datastore_name, sse_configuration, identity_provider_configuration )
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APIEinzelheiten finden Sie unter C reateFHIRDatastore in AWS SDKfor Python (Boto3) API Reference.
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Das folgende Codebeispiel zeigt, wie man. DeleteFHIRDatastore
- SDKfür Python (Boto3)
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Anmerkung
Es gibt noch mehr dazu. GitHub Sie sehen das vollständige Beispiel und erfahren, wie Sie das AWS -Code-Beispiel-Repository
einrichten und ausführen. @classmethod def from_client(cls) -> "HealthLakeWrapper": """ Creates a HealthLakeWrapper instance with a default AWS HealthLake client. :return: An instance of HealthLakeWrapper initialized with the default HealthLake client. """ health_lake_client = boto3.client("healthlake") return cls(health_lake_client) def delete_fhir_datastore(self, datastore_id: str) -> None: """ Deletes a HealthLake datastore. :param datastore_id: The datastore ID. """ try: self.health_lake_client.delete_fhir_datastore(DatastoreId=datastore_id) except ClientError as err: logger.exception( "Couldn't delete datastore with ID %s. Here's why %s", datastore_id, err.response["Error"]["Message"], ) raise
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APIEinzelheiten finden Sie unter D eleteFHIRDatastore in AWS SDKfor Python (Boto3) API Reference.
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Das folgende Codebeispiel zeigt, wie man. DescribeFHIRDatastore
- SDKfür Python (Boto3)
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Anmerkung
Es gibt noch mehr dazu. GitHub Sie sehen das vollständige Beispiel und erfahren, wie Sie das AWS -Code-Beispiel-Repository
einrichten und ausführen. @classmethod def from_client(cls) -> "HealthLakeWrapper": """ Creates a HealthLakeWrapper instance with a default AWS HealthLake client. :return: An instance of HealthLakeWrapper initialized with the default HealthLake client. """ health_lake_client = boto3.client("healthlake") return cls(health_lake_client) def describe_fhir_datastore(self, datastore_id: str) -> dict[str, any]: """ Describes a HealthLake datastore. :param datastore_id: The datastore ID. :return: The datastore description. """ try: response = self.health_lake_client.describe_fhir_datastore( DatastoreId=datastore_id ) return response["DatastoreProperties"] except ClientError as err: logger.exception( "Couldn't describe datastore with ID %s. Here's why %s", datastore_id, err.response["Error"]["Message"], ) raise
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APIEinzelheiten finden Sie unter D escribeFHIRDatastore in AWS SDKfor Python (Boto3) API Reference.
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Das folgende Codebeispiel zeigt, wie man. DescribeFHIRExportJob
- SDKfür Python (Boto3)
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Anmerkung
Es gibt noch mehr dazu. GitHub Sie sehen das vollständige Beispiel und erfahren, wie Sie das AWS -Code-Beispiel-Repository
einrichten und ausführen. @classmethod def from_client(cls) -> "HealthLakeWrapper": """ Creates a HealthLakeWrapper instance with a default AWS HealthLake client. :return: An instance of HealthLakeWrapper initialized with the default HealthLake client. """ health_lake_client = boto3.client("healthlake") return cls(health_lake_client) def describe_fhir_export_job( self, datastore_id: str, job_id: str ) -> dict[str, any]: """ Describes a HealthLake export job. :param datastore_id: The datastore ID. :param job_id: The export job ID. :return: The export job description. """ try: response = self.health_lake_client.describe_fhir_export_job( DatastoreId=datastore_id, JobId=job_id ) return response["ExportJobProperties"] except ClientError as err: logger.exception( "Couldn't describe export job with ID %s. Here's why %s", job_id, err.response["Error"]["Message"], ) raise
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APIEinzelheiten finden Sie unter D escribeFHIRExport Job in AWS SDKfor Python (Boto3) API Reference.
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Das folgende Codebeispiel zeigt, wie man. DescribeFHIRImportJob
- SDKfür Python (Boto3)
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Anmerkung
Es gibt noch mehr dazu. GitHub Sie sehen das vollständige Beispiel und erfahren, wie Sie das AWS -Code-Beispiel-Repository
einrichten und ausführen. @classmethod def from_client(cls) -> "HealthLakeWrapper": """ Creates a HealthLakeWrapper instance with a default AWS HealthLake client. :return: An instance of HealthLakeWrapper initialized with the default HealthLake client. """ health_lake_client = boto3.client("healthlake") return cls(health_lake_client) def describe_fhir_import_job( self, datastore_id: str, job_id: str ) -> dict[str, any]: """ Describes a HealthLake import job. :param datastore_id: The datastore ID. :param job_id: The import job ID. :return: The import job description. """ try: response = self.health_lake_client.describe_fhir_import_job( DatastoreId=datastore_id, JobId=job_id ) return response["ImportJobProperties"] except ClientError as err: logger.exception( "Couldn't describe import job with ID %s. Here's why %s", job_id, err.response["Error"]["Message"], ) raise
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APIEinzelheiten finden Sie unter D escribeFHIRImport Job in AWS SDKfor Python (Boto3) API Reference.
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Das folgende Codebeispiel zeigt, wie man. ListFHIRDatastoreImportJobs
- SDKfür Python (Boto3)
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Anmerkung
Es gibt noch mehr dazu. GitHub Sie sehen das vollständige Beispiel und erfahren, wie Sie das AWS -Code-Beispiel-Repository
einrichten und ausführen. @classmethod def from_client(cls) -> "HealthLakeWrapper": """ Creates a HealthLakeWrapper instance with a default AWS HealthLake client. :return: An instance of HealthLakeWrapper initialized with the default HealthLake client. """ health_lake_client = boto3.client("healthlake") return cls(health_lake_client) def list_fhir_import_jobs( self, datastore_id: str, job_name: str = None, job_status: str = None, submitted_before: datetime = None, submitted_after: datetime = None, ) -> list[dict[str, any]]: """ Lists HealthLake import jobs satisfying the conditions. :param datastore_id: The datastore ID. :param job_name: The import job name. :param job_status: The import job status. :param submitted_before: The import job submitted before the specified date. :param submitted_after: The import job submitted after the specified date. :return: A list of import jobs. """ try: parameters = {"DatastoreId": datastore_id} if job_name is not None: parameters["JobName"] = job_name if job_status is not None: parameters["JobStatus"] = job_status if submitted_before is not None: parameters["SubmittedBefore"] = submitted_before if submitted_after is not None: parameters["SubmittedAfter"] = submitted_after next_token = None jobs = [] # Loop through paginated results. while True: if next_token is not None: parameters["NextToken"] = next_token response = self.health_lake_client.list_fhir_import_jobs(**parameters) jobs.extend(response["ImportJobPropertiesList"]) if "NextToken" in response: next_token = response["NextToken"] else: break return jobs except ClientError as err: logger.exception( "Couldn't list import jobs. Here's why %s", err.response["Error"]["Message"], ) raise
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APIEinzelheiten finden Sie unter L istFHIRDatastore ImportJobs in AWS SDKfor Python (Boto3) API Reference.
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Das folgende Codebeispiel zeigt die Verwendung. ListFHIRDatastores
- SDKfür Python (Boto3)
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Anmerkung
Es gibt noch mehr dazu. GitHub Sie sehen das vollständige Beispiel und erfahren, wie Sie das AWS -Code-Beispiel-Repository
einrichten und ausführen. @classmethod def from_client(cls) -> "HealthLakeWrapper": """ Creates a HealthLakeWrapper instance with a default AWS HealthLake client. :return: An instance of HealthLakeWrapper initialized with the default HealthLake client. """ health_lake_client = boto3.client("healthlake") return cls(health_lake_client) def list_fhir_datastores(self) -> list[dict[str, any]]: """ Lists all HealthLake datastores. :return: A list of datastore descriptions. """ try: next_token = None datastores = [] # Loop through paginated results. while True: parameters = {} if next_token is not None: parameters["NextToken"] = next_token response = self.health_lake_client.list_fhir_datastores(**parameters) datastores.extend(response["DatastorePropertiesList"]) if "NextToken" in response: next_token = response["NextToken"] else: break return datastores except ClientError as err: logger.exception( "Couldn't list datastores. Here's why %s", err.response["Error"]["Message"] ) raise
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APIEinzelheiten finden Sie unter L istFHIRDatastores in AWS SDKfor Python (Boto3) API Reference.
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Das folgende Codebeispiel zeigt, wie man. ListFHIRExportJobs
- SDKfür Python (Boto3)
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Anmerkung
Es gibt noch mehr dazu. GitHub Sie sehen das vollständige Beispiel und erfahren, wie Sie das AWS -Code-Beispiel-Repository
einrichten und ausführen. @classmethod def from_client(cls) -> "HealthLakeWrapper": """ Creates a HealthLakeWrapper instance with a default AWS HealthLake client. :return: An instance of HealthLakeWrapper initialized with the default HealthLake client. """ health_lake_client = boto3.client("healthlake") return cls(health_lake_client) def list_fhir_export_jobs( self, datastore_id: str, job_name: str = None, job_status: str = None, submitted_before: datetime = None, submitted_after: datetime = None, ) -> list[dict[str, any]]: """ Lists HealthLake export jobs satisfying the conditions. :param datastore_id: The datastore ID. :param job_name: The export job name. :param job_status: The export job status. :param submitted_before: The export job submitted before the specified date. :param submitted_after: The export job submitted after the specified date. :return: A list of export jobs. """ try: parameters = {"DatastoreId": datastore_id} if job_name is not None: parameters["JobName"] = job_name if job_status is not None: parameters["JobStatus"] = job_status if submitted_before is not None: parameters["SubmittedBefore"] = submitted_before if submitted_after is not None: parameters["SubmittedAfter"] = submitted_after next_token = None jobs = [] # Loop through paginated results. while True: if next_token is not None: parameters["NextToken"] = next_token response = self.health_lake_client.list_fhir_export_jobs(**parameters) jobs.extend(response["ExportJobPropertiesList"]) if "NextToken" in response: next_token = response["NextToken"] else: break return jobs except ClientError as err: logger.exception( "Couldn't list export jobs. Here's why %s", err.response["Error"]["Message"], ) raise
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APIEinzelheiten finden Sie unter L istFHIRExport Jobs in AWS SDKfor Python (Boto3) API Reference.
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Das folgende Codebeispiel zeigt, wie man. ListTagsForResource
- SDKfür Python (Boto3)
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Anmerkung
Es gibt noch mehr dazu. GitHub Sie sehen das vollständige Beispiel und erfahren, wie Sie das AWS -Code-Beispiel-Repository
einrichten und ausführen. @classmethod def from_client(cls) -> "HealthLakeWrapper": """ Creates a HealthLakeWrapper instance with a default AWS HealthLake client. :return: An instance of HealthLakeWrapper initialized with the default HealthLake client. """ health_lake_client = boto3.client("healthlake") return cls(health_lake_client) def list_tags_for_resource(self, resource_arn: str) -> dict[str, str]: """ Lists the tags for a HealthLake resource. :param resource_arn: The resource ARN. :return: The tags for the resource. """ try: response = self.health_lake_client.list_tags_for_resource( ResourceARN=resource_arn ) return response["Tags"] except ClientError as err: logger.exception( "Couldn't list tags for resource %s. Here's why %s", resource_arn, err.response["Error"]["Message"], ) raise
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APIEinzelheiten finden Sie unter ListTagsForResourcePython (Boto3) API -Referenz.AWS SDK
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Das folgende Codebeispiel zeigt, wie man es benutzt. StartFHIRExportJob
- SDKfür Python (Boto3)
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Anmerkung
Es gibt noch mehr dazu. GitHub Sie sehen das vollständige Beispiel und erfahren, wie Sie das AWS -Code-Beispiel-Repository
einrichten und ausführen. @classmethod def from_client(cls) -> "HealthLakeWrapper": """ Creates a HealthLakeWrapper instance with a default AWS HealthLake client. :return: An instance of HealthLakeWrapper initialized with the default HealthLake client. """ health_lake_client = boto3.client("healthlake") return cls(health_lake_client) def start_fhir_export_job( self, job_name: str, datastore_id: str, output_s3_uri: str, kms_key_id: str, data_access_role_arn: str, ) -> dict[str, str]: """ Starts a HealthLake export job. :param job_name: The export job name. :param datastore_id: The datastore ID. :param output_s3_uri: The output S3 URI. :param kms_key_id: The KMS key ID associated with the output S3 bucket. :param data_access_role_arn: The data access role ARN. :return: The export job. """ try: response = self.health_lake_client.start_fhir_export_job( OutputDataConfig={ "S3Configuration": {"S3Uri": output_s3_uri, "KmsKeyId": kms_key_id} }, DataAccessRoleArn=data_access_role_arn, DatastoreId=datastore_id, JobName=job_name, ) return response except ClientError as err: logger.exception( "Couldn't start export job. Here's why %s", err.response["Error"]["Message"], ) raise
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APIEinzelheiten finden Sie unter S tartFHIRExport Job in AWS SDKfor Python (Boto3) API Reference.
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Das folgende Codebeispiel zeigt, wie man. StartFHIRImportJob
- SDKfür Python (Boto3)
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Anmerkung
Es gibt noch mehr dazu. GitHub Sie sehen das vollständige Beispiel und erfahren, wie Sie das AWS -Code-Beispiel-Repository
einrichten und ausführen. @classmethod def from_client(cls) -> "HealthLakeWrapper": """ Creates a HealthLakeWrapper instance with a default AWS HealthLake client. :return: An instance of HealthLakeWrapper initialized with the default HealthLake client. """ health_lake_client = boto3.client("healthlake") return cls(health_lake_client) def start_fhir_import_job( self, job_name: str, datastore_id: str, input_s3_uri: str, job_output_s3_uri: str, kms_key_id: str, data_access_role_arn: str, ) -> dict[str, str]: """ Starts a HealthLake import job. :param job_name: The import job name. :param datastore_id: The datastore ID. :param input_s3_uri: The input S3 URI. :param job_output_s3_uri: The job output S3 URI. :param kms_key_id: The KMS key ID associated with the output S3 bucket. :param data_access_role_arn: The data access role ARN. :return: The import job. """ try: response = self.health_lake_client.start_fhir_import_job( JobName=job_name, InputDataConfig={"S3Uri": input_s3_uri}, JobOutputDataConfig={ "S3Configuration": { "S3Uri": job_output_s3_uri, "KmsKeyId": kms_key_id, } }, DataAccessRoleArn=data_access_role_arn, DatastoreId=datastore_id, ) return response except ClientError as err: logger.exception( "Couldn't start import job. Here's why %s", err.response["Error"]["Message"], ) raise
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APIEinzelheiten finden Sie unter S tartFHIRImport Job in AWS SDKfor Python (Boto3) API Reference.
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Das folgende Codebeispiel zeigt, wie man. TagResource
- SDKfür Python (Boto3)
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Anmerkung
Es gibt noch mehr dazu. GitHub Sie sehen das vollständige Beispiel und erfahren, wie Sie das AWS -Code-Beispiel-Repository
einrichten und ausführen. @classmethod def from_client(cls) -> "HealthLakeWrapper": """ Creates a HealthLakeWrapper instance with a default AWS HealthLake client. :return: An instance of HealthLakeWrapper initialized with the default HealthLake client. """ health_lake_client = boto3.client("healthlake") return cls(health_lake_client) def tag_resource(self, resource_arn: str, tags: list[dict[str, str]]) -> None: """ Tags a HealthLake resource. :param resource_arn: The resource ARN. :param tags: The tags to add to the resource. """ try: self.health_lake_client.tag_resource(ResourceARN=resource_arn, Tags=tags) except ClientError as err: logger.exception( "Couldn't tag resource %s. Here's why %s", resource_arn, err.response["Error"]["Message"], ) raise
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APIEinzelheiten finden Sie unter TagResourcePython (Boto3) API -Referenz.AWS SDK
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Das folgende Codebeispiel zeigt, wie man es benutzt. UntagResource
- SDKfür Python (Boto3)
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Anmerkung
Es gibt noch mehr dazu. GitHub Sie sehen das vollständige Beispiel und erfahren, wie Sie das AWS -Code-Beispiel-Repository
einrichten und ausführen. @classmethod def from_client(cls) -> "HealthLakeWrapper": """ Creates a HealthLakeWrapper instance with a default AWS HealthLake client. :return: An instance of HealthLakeWrapper initialized with the default HealthLake client. """ health_lake_client = boto3.client("healthlake") return cls(health_lake_client) def untag_resource(self, resource_arn: str, tag_keys: list[str]) -> None: """ Untags a HealthLake resource. :param resource_arn: The resource ARN. :param tag_keys: The tag keys to remove from the resource. """ try: self.health_lake_client.untag_resource( ResourceARN=resource_arn, TagKeys=tag_keys ) except ClientError as err: logger.exception( "Couldn't untag resource %s. Here's why %s", resource_arn, err.response["Error"]["Message"], ) raise
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APIEinzelheiten finden Sie unter UntagResourcePython (Boto3) API -Referenz.AWS SDK
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