Ejemplos de HealthLake que utilizan la AWS CLI

Ejemplo 1: creación de un almacén de datos de HealthLake compatible con SigV4

En el siguiente ejemplo de create-fhir-datastore, se muestra cómo crear un nuevo almacén de datos en AWS HealthLake.

aws healthlake create-fhir-datastore \
    --datastore-type-version R4 \
    --datastore-name "FhirTestDatastore"

Salida:

{
    "DatastoreEndpoint": "https://healthlake.us-east-1.amazonaws.com/datastore/(Data store ID)/r4/",
    "DatastoreArn": "arn:aws:healthlake:us-east-1:(AWS Account ID):datastore/(Data store ID)",
    "DatastoreStatus": "CREATING",
    "DatastoreId": "(Data store ID)"
}

Ejemplo 2: creación de SMART en un almacén de datos de HealthLake compatible con FHIR

En el siguiente ejemplo de create-fhir-datastore, se muestra cómo crear un nuevo SMART en el almacén de datos habilitado por FHIR en AWS HealthLake.

aws healthlake create-fhir-datastore \
    --datastore-name "your-data-store-name" \
    --datastore-type-version R4 \
    --preload-data-config PreloadDataType="SYNTHEA" \
    --sse-configuration '{ "KmsEncryptionConfig": {  "CmkType": "CUSTOMER_MANAGED_KMS_KEY", "KmsKeyId": "arn:aws:kms:us-east-1:your-account-id:key/your-key-id" } }' \
    --identity-provider-configuration  file://identity_provider_configuration.json

Contenido de identity_provider_configuration.json:

{
    "AuthorizationStrategy": "SMART_ON_FHIR_V1",
    "FineGrainedAuthorizationEnabled": true,
    "IdpLambdaArn": "arn:aws:lambda:your-region:your-account-id:function:your-lambda-name",
    "Metadata": "{\"issuer\":\"https://ehr.example.com\", \"jwks_uri\":\"https://ehr.example.com/.well-known/jwks.json\",\"authorization_endpoint\":\"https://ehr.example.com/auth/authorize\",\"token_endpoint\":\"https://ehr.token.com/auth/token\",\"token_endpoint_auth_methods_supported\":[\"client_secret_basic\",\"foo\"],\"grant_types_supported\":[\"client_credential\",\"foo\"],\"registration_endpoint\":\"https://ehr.example.com/auth/register\",\"scopes_supported\":[\"openId\",\"profile\",\"launch\"],\"response_types_supported\":[\"code\"],\"management_endpoint\":\"https://ehr.example.com/user/manage\",\"introspection_endpoint\":\"https://ehr.example.com/user/introspect\",\"revocation_endpoint\":\"https://ehr.example.com/user/revoke\",\"code_challenge_methods_supported\":[\"S256\"],\"capabilities\":[\"launch-ehr\",\"sso-openid-connect\",\"client-public\"]}"
}

Salida:

{
    "DatastoreEndpoint": "https://healthlake.us-east-1.amazonaws.com/datastore/(Data store ID)/r4/",
    "DatastoreArn": "arn:aws:healthlake:us-east-1:(AWS Account ID):datastore/(Data store ID)",
    "DatastoreStatus": "CREATING",
    "DatastoreId": "(Data store ID)"
}

Para obtener más información, consulte Creación y supervisión de un almacén de datos de FHIR en la Guía para desarrolladores de AWS HealthLake.

Eliminación de un almacén de datos de FHIR

En el siguiente ejemplo de delete-fhir-datastore, se muestra cómo eliminar un almacén de datos y todo su contenido en AWS HealthLake.

aws healthlake delete-fhir-datastore \
    --datastore-id (Data store ID)

Salida:

{
    "DatastoreEndpoint": "https://healthlake.us-east-1.amazonaws.com/datastore/(Data store ID)/r4/",
    "DatastoreArn": "arn:aws:healthlake:us-east-1:(AWS Account ID):datastore/(Data store ID)",
    "DatastoreStatus": "DELETING",
    "DatastoreId": "(Data store ID)"
}

Para obtener más información, consulte Creación y supervisión de un almacén de datos de FHIR <https://docs.aws.amazon.com/healthlake/latest/devguide/working-with-FHIR-healthlake.html> en la Guía para desarrolladores de AWS HealthLake.

Descripción de un almacén de datos de FHIR

En el siguiente ejemplo de describe-fhir-datastore, se muestra cómo encontrar las propiedades de un almacén de datos en AWS HealthLake.

aws healthlake describe-fhir-datastore \
    --datastore-id "1f2f459836ac6c513ce899f9e4f66a59"

Salida:

{
    "DatastoreProperties": {
        "PreloadDataConfig": {
            "PreloadDataType": "SYNTHEA"
        },
        "SseConfiguration": {
            "KmsEncryptionConfig": {
                "CmkType": "CUSTOMER_MANAGED_KMS_KEY",
                "KmsKeyId": "arn:aws:kms:us-east-1:123456789012:key/a1b2c3d4-5678-90ab-cdef-EXAMPLE11111"
            }
        },
        "DatastoreName": "Demo",
        "DatastoreArn": "arn:aws:healthlake:us-east-1:<AWS Account ID>:datastore/<Data store ID>",
        "DatastoreEndpoint": "https://healthlake.us-east-1.amazonaws.com/datastore/<Data store ID>/r4/",
        "DatastoreStatus": "ACTIVE",
        "DatastoreTypeVersion": "R4",
        "CreatedAt": 1603761064.881,
        "DatastoreId": "<Data store ID>",
        "IdentityProviderConfiguration": {
            "AuthorizationStrategy": "AWS_AUTH",
            "FineGrainedAuthorizationEnabled": false
        }
    }
}

Para obtener más información, consulte Creación y supervisión de un almacén de datos de FHIR en la Guía para desarrolladores de AWS HealthLake.

Para describir un trabajo de exportación de FHIR

En el siguiente ejemplo de describe-fhir-export-job, se muestra cómo encontrar las propiedades de un trabajo de exportación de FHIR en AWS HealthLake.

aws healthlake describe-fhir-export-job \
    --datastore-id (Data store ID) \
    --job-id 9b9a51943afaedd0a8c0c26c49135a31

Salida:

{
    "ExportJobProperties": {
        "DataAccessRoleArn": "arn:aws:iam::(AWS Account ID):role/(Role Name)",
        "JobStatus": "IN_PROGRESS",
        "JobId": "9009813e9d69ba7cf79bcb3468780f16",
        "SubmitTime": "2024-11-20T11:31:46.672000-05:00",
        "EndTime": "2024-11-20T11:34:01.636000-05:00",
        "OutputDataConfig": {
            "S3Configuration": {
            "S3Uri": "s3://(Bucket Name)/(Prefix Name)/",
            "KmsKeyId": "arn:aws:kms:us-east-1:012345678910:key/d330e7fc-b56c-4216-a250-f4c43ef46e83"
        }

        },
        "DatastoreId": "(Data store ID)"
    }
}

Para obtener más información, consulte Exportación de archivos de un almacén de datos de FHIR en la Guía para desarrolladores de AWS HealthLake.

Para describir un trabajo de importación de FHIR

En el siguiente ejemplo de describe-fhir-import-job, se muestra cómo obtener información sobre las propiedades de un trabajo de importación de FHIR mediante AWS HealthLake.

aws healthlake describe-fhir-import-job \
    --datastore-id (Data store ID) \
    --job-id c145fbb27b192af392f8ce6e7838e34f

Salida:

{
    "ImportJobProperties": {
    "InputDataConfig": {
        "S3Uri": "s3://(Bucket Name)/(Prefix Name)/"
        { "arrayitem2": 2 }
    },
    "DataAccessRoleArn": "arn:aws:iam::(AWS Account ID):role/(Role Name)",
    "JobStatus": "COMPLETED",
    "JobId": "c145fbb27b192af392f8ce6e7838e34f",
    "SubmitTime": 1606272542.161,
    "EndTime": 1606272609.497,
    "DatastoreId": "(Data store ID)"
    }
}

Para obtener más información, consulte Importación de archivos a un almacén de datos de FHIR en la Guía para desarrolladores de AWS HealthLake.

Muestra de los almacenes de datos de FHIR

En el siguiente ejemplo de list-fhir-datastores, se muestra cómo utilizar el comando y de qué manera los usuarios pueden filtrar los resultados en función del estado del almacén de datos en AWS HealthLake.

aws healthlake list-fhir-datastores \
    --filter DatastoreStatus=ACTIVE

Salida:

{
    "DatastorePropertiesList": [
    {
        "PreloadDataConfig": {
            "PreloadDataType": "SYNTHEA"
        },
        "SseConfiguration": {
            "KmsEncryptionConfig": {
                "CmkType": "CUSTOMER_MANAGED_KMS_KEY",
                "KmsKeyId": "arn:aws:kms:us-east-1:123456789012:key/a1b2c3d4-5678-90ab-cdef-EXAMPLE11111"
            }
        },
        "DatastoreName": "Demo",
        "DatastoreArn": "arn:aws:healthlake:us-east-1:<AWS Account ID>:datastore/<Data store ID>",
        "DatastoreEndpoint": "https://healthlake.us-east-1.amazonaws.com/datastore/<Data store ID>/r4/",
        "DatastoreStatus": "ACTIVE",
        "DatastoreTypeVersion": "R4",
        "CreatedAt": 1603761064.881,
        "DatastoreId": "<Data store ID>",
        "IdentityProviderConfiguration": {
            "AuthorizationStrategy": "AWS_AUTH",
            "FineGrainedAuthorizationEnabled": false
        }
    }
    ]
}

Para obtener más información, consulte Creación y supervisión de un almacén de datos de FHIR en la Guía para desarrolladores de AWS HealthLake.

Para enumerar todos los trabajos de exportación de FHIR

En el siguiente ejemplo de list-fhir-export-jobs, se muestra cómo utilizar el comando para ver una lista de trabajos de exportación asociados a una cuenta.

aws healthlake list-fhir-export-jobs \
    --datastore-id (Data store ID) \
    --submitted-before (DATE like 2024-10-13T19:00:00Z)\
    --submitted-after (DATE like 2020-10-13T19:00:00Z )\
    --job-name "FHIR-EXPORT" \
    --job-status SUBMITTED  \
    --max-results (Integer between 1 and 500)

Salida:

{
    "ExportJobPropertiesList": [
        {
            "ExportJobProperties": {
                "OutputDataConfig": {
                    "S3Uri": "s3://(Bucket Name)/(Prefix Name)/",
                    "S3Configuration": {
                        "S3Uri": "s3://(Bucket Name)/(Prefix Name)/",
                        "KmsKeyId": "(KmsKey Id)"
                    }
                },
                "DataAccessRoleArn": "arn:aws:iam::(AWS Account ID):role/(Role Name)",
                "JobStatus": "COMPLETED",
                "JobId": "c145fbb27b192af392f8ce6e7838e34f",
                "JobName": "FHIR-EXPORT",
                "SubmitTime": "2024-11-20T11:31:46.672000-05:00",
                "EndTime": "2024-11-20T11:34:01.636000-05:00",
                "DatastoreId": "(Data store ID)"
            }
        }
    ]
}

Para obtener más información, consulte Exportación de archivos de un almacén de datos de FHIR en la Guía para desarrolladores de AWS HealthLake.

Para enumerar todos los trabajos de importación de FHIR

En el siguiente ejemplo de list-fhir-import-jobs, se muestra cómo utilizar el comando para ver una lista de todos los trabajos de importación asociados a una cuenta.

aws healthlake list-fhir-import-jobs \
    --datastore-id (Data store ID) \
    --submitted-before (DATE like 2024-10-13T19:00:00Z) \
    --submitted-after (DATE like 2020-10-13T19:00:00Z ) \
    --job-name "FHIR-IMPORT" \
    --job-status SUBMITTED  \
    -max-results (Integer between 1 and 500)

Salida:

{
    "ImportJobPropertiesList": [
        {
            "JobId": "c0fddbf76f238297632d4aebdbfc9ddf",
            "JobStatus": "COMPLETED",
            "SubmitTime": "2024-11-20T10:08:46.813000-05:00",
            "EndTime": "2024-11-20T10:10:09.093000-05:00",
            "DatastoreId": "(Data store ID)",
            "InputDataConfig": {
                "S3Uri": "s3://(Bucket Name)/(Prefix Name)/"
            },
            "JobOutputDataConfig": {
                "S3Configuration": {
                    "S3Uri": "s3://(Bucket Name)/import/6407b9ae4c2def3cb6f1a46a0c599ec0-FHIR_IMPORT-c0fddbf76f238297632d4aebdbfc9ddf/",
                    "KmsKeyId": "arn:aws:kms:us-east-1:123456789012:key/b7f645cb-e564-4981-8672-9e012d1ff1a0"
                }
            },
            "JobProgressReport": {
                "TotalNumberOfScannedFiles": 1,
                "TotalSizeOfScannedFilesInMB": 0.001798,
                "TotalNumberOfImportedFiles": 1,
                "TotalNumberOfResourcesScanned": 1,
                "TotalNumberOfResourcesImported": 1,
                "TotalNumberOfResourcesWithCustomerError": 0,
                "TotalNumberOfFilesReadWithCustomerError": 0,
                "Throughput": 0.0
            },
            "DataAccessRoleArn": "arn:aws:iam::(AWS Account ID):role/(Role Name)"
        }
    ]
}

Para obtener más información, consulte Importación de archivos a un almacén de datos de FHIR en la Guía para desarrolladores de AWS HealthLake.

Muestra de las etiquetas para un almacén de datos

En el siguiente ejemplo de list-tags-for-resource, se muestran las etiquetas asociadas al almacén de datos especificado:

aws healthlake list-tags-for-resource \
    --resource-arn "arn:aws:healthlake:us-east-1:123456789012:datastore/fhir/0725c83f4307f263e16fd56b6d8ebdbe"

Salida:

{
    "tags": {
        "key": "value",
        "key1": "value1"
    }
}

Para obtener más información, consulte Etiquetado de recursos en AWS HealthLake en la Guía para desarrolladores de AWS HealthLake.

Para iniciar un trabajo de exportación de FHIR

En el siguiente ejemplo de start-fhir-export-job, se muestra cómo empezar un trabajo de exportación de FHIR con AWS HealthLake.

aws healthlake start-fhir-export-job \
    --output-data-config '{"S3Configuration": {"S3Uri":"s3://(Bucket Name)/(Prefix Name)/","KmsKeyId":"arn:aws:kms:us-east-1:012345678910:key/d330e7fc-b56c-4216-a250-f4c43ef46e83"}}' \
    --datastore-id (Data store ID) \
    --data-access-role-arn arn:aws:iam::(AWS Account ID):role/(Role Name)

Salida:

{
    "DatastoreId": "(Data store ID)",
    "JobStatus": "SUBMITTED",
    "JobId": "9b9a51943afaedd0a8c0c26c49135a31"
}

Para obtener más información, consulte Exportación de archivos de un almacén de datos de FHIR en la Guía para desarrolladores de AWS HealthLake.

Para iniciar un trabajo de importación de FHIR

En el siguiente ejemplo de start-fhir-import-job, se muestra cómo empezar un trabajo de importación de FHIR con AWS HealthLake.

aws healthlake start-fhir-import-job \
    --input-data-config S3Uri="s3://(Bucket Name)/(Prefix Name)/" \
    --job-output-data-config '{"S3Configuration": {"S3Uri":"s3://(Bucket Name)/(Prefix Name)/","KmsKeyId":"arn:aws:kms:us-east-1:012345678910:key/d330e7fc-b56c-4216-a250-f4c43ef46e83"}}' \
    --datastore-id (Data store ID) \
    --data-access-role-arn "arn:aws:iam::(AWS Account ID):role/(Role Name)"

Salida:

{
    "DatastoreId": "(Data store ID)",
    "JobStatus": "SUBMITTED",
    "JobId": "c145fbb27b192af392f8ce6e7838e34f"
}

Para obtener más información, consulte Importación de archivos a un almacén de datos de FHIR en la Guía para desarrolladores de AWS HealthLake.

Agregación de una etiqueta al almacén de datos

En el siguiente ejemplo de tag-resource, se muestra cómo agregar una etiqueta a un almacén de datos.

aws healthlake tag-resource \
    --resource-arn "arn:aws:healthlake:us-east-1:123456789012:datastore/fhir/0725c83f4307f263e16fd56b6d8ebdbe" \
    --tags '[{"Key": "key1", "Value": "value1"}]'

Este comando no genera ninguna salida.

Para obtener más información, consulte Agregación de una etiqueta a un almacén de datos en la Guía para desarrolladores de AWS HealthLake.

Eliminación de etiquetas de un almacén de datos.

En el siguiente ejemplo de untag-resource, se muestra cómo eliminar etiquetas de un almacén de datos.

aws healthlake untag-resource \
    --resource-arn "arn:aws:healthlake:us-east-1:123456789012:datastore/fhir/b91723d65c6fdeb1d26543a49d2ed1fa" \
    --tag-keys '["key1"]'

Este comando no genera ninguna salida.

Para obtener más información, consulte Eliminación de etiquetas de un almacén de datos en la Guía para desarrolladores de AWS HealthLake.