Introducción a los trabajos de importación - AWS HealthImaging

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Introducción a los trabajos de importación

Tras crear un almacén de datos en AWS HealthImaging, debe importar los datos de imágenes médicas de su depósito de entrada de Amazon S3 a su almacén de datos para crear conjuntos de imágenes. Puede usar los campos AWS Management Console AWS CLI, y AWS SDKs para iniciar, describir y enumerar los trabajos de importación.

El siguiente diagrama proporciona una descripción general de cómo se HealthImaging importan los datos DICOM a un banco de datos y los transforma en conjuntos de imágenes. Los resultados del procesamiento de los trabajos de importación se almacenan en el bucket de salida de Amazon S3 (outputS3Uri) y los conjuntos de imágenes se almacenan en el almacén de HealthImaging datos de AWS.

Diagrama de arquitectura que muestra cómo se HealthImaging importan los datos de imágenes médicas de DICOM y cómo los transforma en conjuntos de imágenes compuestos por metadatos y marcos de imágenes.

Tenga en cuenta los siguientes puntos al importar sus archivos de imágenes médicas de Amazon S3 a un almacén de HealthImaging datos de AWS:

  • Se admiten clases de SOP específicas y sintaxis de transferencia para los trabajos de importación. Para obtener más información, consulte DICOM.

  • Durante la importación, se aplican restricciones de longitud a elementos DICOM específicos. Para que la importación sea correcta, asegúrese de que sus datos de imágenes médicas no superen las restricciones de longitud máxima. Para obtener más información, consulte Restricciones de los elementos DICOM.

  • Al principio de los trabajos de importación, se comprueba la verificación de los datos en píxeles. Para obtener más información, consulte Verificación de datos de píxeles.

  • Hay puntos finales, cuotas y límites de regulación asociados a las acciones de importación. HealthImaging Para obtener más información, consulte Cuotas y puntos de conexión y Límites de limitación.

  • Para cada trabajo de importación, los resultados del procesamiento se almacenan en la ubicación outputS3Uri. Los resultados del procesamiento se organizan en un archivo job-output-manifest.json y en las carpetas SUCCESS y FAILURE.

    nota

    Puede incluir hasta 10 000 carpetas anidadas para un solo trabajo de importación.

    • El archivo job-output-manifest.json contiene el resultado de salida jobSummary e información adicional sobre los datos procesados. El ejemplo siguiente muestra la salida de un archivo job-output-manifest.json.

      {
    "jobSummary": {
        "jobId": "09876543210987654321098765432109",
        "datastoreId": "12345678901234567890123456789012",
        "inputS3Uri": "s3://medical-imaging-dicom-input/dicom_input/",
        "outputS3Uri": "s3://medical-imaging-output/job_output/12345678901234567890123456789012-DicomImport-09876543210987654321098765432109/",
        "successOutputS3Uri": "s3://medical-imaging-output/job_output/12345678901234567890123456789012-DicomImport-09876543210987654321098765432109/SUCCESS/",
        "failureOutputS3Uri": "s3://medical-imaging-output/job_output/12345678901234567890123456789012-DicomImport-09876543210987654321098765432109/FAILURE/",
        "numberOfScannedFiles": 5,
        "numberOfImportedFiles": 3,
        "numberOfFilesWithCustomerError": 2,
        "numberOfFilesWithServerError": 0,
        "numberOfGeneratedImageSets": 2,
        "imageSetsSummary": [{
                "imageSetId": "12345612345612345678907890789012",
                "numberOfMatchedSOPInstances": 2
            },
            {
                "imageSetId": "12345612345612345678917891789012",
                "numberOfMatchedSOPInstances": 1
            }
        ]
    }
}

    • La carpeta SUCCESS contiene el archivo success.ndjson con los resultados de todos los archivos de imágenes que se importaron correctamente. El ejemplo siguiente muestra la salida de un archivo success.ndjson.

      {"inputFile":"dicomInputFolder/1.3.51.5145.5142.20010109.1105620.1.0.1.dcm","importResponse":{"imageSetId":"12345612345612345678907890789012"}}
{"inputFile":"dicomInputFolder/1.3.51.5145.5142.20010109.1105630.1.0.1.dcm","importResponse":{"imageSetId":"12345612345612345678917891789012"}}

    • La carpeta FAILURE contiene el archivo failure.ndjson con los resultados de todos los archivos de imágenes que no se importaron correctamente. El ejemplo siguiente muestra la salida de un archivo failure.ndjson.

      {"inputFile":"dicom_input/invalidDicomFile1.dcm","exception":{"exceptionType":"ValidationException","message":"DICOM attribute TransferSyntaxUID does not exist"}}
{"inputFile":"dicom_input/invalidDicomFile2.dcm","exception":{"exceptionType":"ValidationException","message":"DICOM attributes does not exist"}}

  • Los trabajos de importación se conservan en la lista de trabajos durante 90 días y, a continuación, se archivan.