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# Ejecutar consultas en tiendas de HealthOmics variantes
<a name="analytics-run-queries"></a>

**importante**  
AWS HealthOmics las tiendas de variantes y las tiendas de anotaciones ya no están abiertas a nuevos clientes. Los clientes existentes pueden seguir utilizando el servicio con normalidad. Para obtener más información, consulte [AWS HealthOmics cambio en la disponibilidad del almacén de variantes y del almacén de anotaciones](variant-store-availability-change.md).

Puedes realizar consultas en tu tienda de variantes con Amazon Athena. Tenga en cuenta que las coordenadas genómicas de los almacenes de variantes y anotaciones se representan como intervalos de base cero, semicerrados y semiabiertos.

## Ejecute una consulta sencilla con la consola Athena
<a name="run-queries-athena-simple"></a>

El siguiente ejemplo muestra cómo ejecutar una consulta sencilla.

1. [Abra el editor de consultas de Athena: editor de consultas de Athena](https://console.aws.amazon.com//athena)

1. En **Grupo de trabajo**, seleccione el grupo de trabajo que creó durante la configuración.

1. Compruebe que la **fuente de datos** sea. **AwsDataCatalog**

1. En **Database**, seleccione el enlace de recursos de base de datos que creó durante la configuración de Lake Formation.

1. Copie la siguiente consulta en el **editor de consultas**, en la pestaña **Consulta 1**:

   ```
   SELECT * from omicsvariants limit 10
   ```

1. Seleccione **Ejecutar** para ejecutar la consulta. La consola rellena la tabla de resultados con las 10 primeras filas de la **omicsvariants** tabla.

## Ejecute una consulta compleja con la consola de Athena
<a name="run-queries-athena-complex"></a>

El siguiente ejemplo muestra cómo ejecutar una consulta compleja. Para ejecutar esta consulta, `ClinVar` impórtela al almacén de anotaciones.

**Ejecute una consulta compleja**

1. [Abra el editor de consultas de Athena: editor de consultas de Athena](https://console.aws.amazon.com//athena)

1. En **Grupo de trabajo**, seleccione el grupo de trabajo que creó durante la configuración.

1. Compruebe que la **fuente de datos** sea. **AwsDataCatalog**

1. En **Database**, seleccione el enlace de recursos de base de datos que creó durante la configuración de Lake Formation.

1. Seleccione la de **\$1** la parte superior derecha para crear una nueva pestaña de **consulta denominada Consulta 2**.

1. Copie la siguiente consulta en el **editor de consultas**, en la pestaña **Consulta 2**:

   ```
   SELECT variants.sampleid,
     variants.contigname,
     variants.start,
     variants."end",
     variants.referenceallele,
     variants.alternatealleles,
     variants.attributes AS variant_attributes,
     clinvar.attributes AS clinvar_attributes  
   FROM omicsvariants as variants 
   INNER JOIN omicsannotations as clinvar ON 
     variants.contigname=CONCAT('chr',clinvar.contigname) 
     AND variants.start=clinvar.start 
     AND variants."end"=clinvar."end" 
     AND variants.referenceallele=clinvar.referenceallele 
     AND variants.alternatealleles=clinvar.alternatealleles 
   WHERE clinvar.attributes['CLNSIG']='Likely_pathogenic'
   ```

1. Seleccione **Ejecutar** para empezar a ejecutar la consulta.