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Aceleradores de tareas en una definición de flujo de trabajo HealthOmics
En la definición del flujo de trabajo, si lo desea, puede especificar las especificaciones del acelerador de la GPU para una tarea. HealthOmics admite los siguientes valores de especificación del acelerador, junto con los tipos de instancia compatibles:
| Especificación del acelerador | Tipos de instancias de Healtomics |
|---|---|
| nvidia-tesla-t4 | G4 |
| nvidia-tesla-t4-a10g | G4 y G5 |
| nvidia-tesla-a10g | G5 |
| nvidia-t4-a10g-l4 | G4, G5 y G6 |
| nvidia-l4-a10g | G5 y G6 |
| nvidia-l4 | G6 |
| nvidia-l40s | G6e |
Si especificas un tipo de acelerador que admite varios tipos de instancias, HealthOmics selecciona el tipo de instancia en función de la capacidad disponible. Si ambos tipos de instancia están disponibles, HealthOmics da preferencia a la instancia de menor coste. La excepción es el acelerador de tareas nvidia-t4-a10g-l4, que da preferencia a la instancia de última generación disponible.
Para obtener más información sobre los tipos de Accelerated-computing instancias instancias, consulte.
En el siguiente ejemplo, la definición del flujo de trabajo especifica nvidia-l4 el acelerador:
Configuración avanzada de recursos
También puedes configurar una tarea para reservar varios aceleradores en el orden de prioridad que prefieras mediante la omicsResourceFallbackOrder directiva. Por el momento, esta directiva solo está disponible para WDL. HealthOmics prueba cada perfil de acelerador en el orden definido hasta que uno tenga éxito, incluido un perfil de CPU final opcional.
Esto es útil en los siguientes escenarios:
-
Alternativa de GPU a GPU: lista los tipos de GPU en orden de prioridad (por ejemplo, prueba
nvidia-l40sprimero y luego recurre anvidia-l4). -
Alternativa de GPU a CPU: agrega un CPU-only perfil final para que la tarea se complete incluso cuando no haya capacidad de GPU disponible en la región.
Para obtener más informaciónomicsResourceFallbackOrder, incluida la referencia de campo por perfil, las reglas de validación y un ejemplo completo de WDL, consulte. Configuración avanzada de recursos