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Comment Amazon Comprehend Medical est intégré à HealthLake
HealthLake déduit les données trouvées dans le type de DocumentReference
ressource à l'aide d'Amazon Comprehend Medical. Les DetectEntities-V2
opérations d'Amazon Comprehend API Medical InferRxNorm
et détecte InferICD10-CM
les problèmes de santé en tant que traits de caractère. Chaque opération fournit des informations différentes.
Prise en charge des langages
Les opérations d'Amazon Comprehend API Medical détectent uniquement les entités médicales dans les textes en anglais.
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DetectEntities-V2 : inspecte le texte clinique de diverses entités médicales et renvoie des informations spécifiques les concernant, telles que la catégorie d'entité, l'emplacement et le score de confiance.
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Déduire ICD1 0-CM : détecte les affections médicales présentes dans le dossier d'un patient sous forme d'entités, et relie ces entités aux identificateurs conceptuels normalisés de la base de connaissances à ICD -10 CM du CDC National Center for Health Statistics, avec l'autorisation de l'Organisation mondiale de la santé (). WHO
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InferRxNorm: Détecte les médicaments en tant qu'entités répertoriées dans le dossier d'un patient et les lie aux identificateurs conceptuels normalisés de la RxNorm base de données de la National Library of Medicine.
Les caractéristiques prises en charge pour chaque API opération sont SIGN
SYMPTOM
, etDIAGNOSIS
. Si des traits sont détectés, ils sont ajoutés en tant qu'extensions FHIR conformes à différents emplacements de votre banque de HealthLake données.
Emplacements où les extensions sont ajoutées.
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DocumentReference
: Les résultats des opérations Amazon Comprehend API Medical sont ajoutés sous formeextension
de fichier à chaque document trouvé dans DocumentReference le type de ressource. Les résultats de l'extension sont divisés en deux groupes. Vous pouvez les trouver dans les résultats en fonction de leursURL
.-
http://healthlake.amazonaws.com/system-generated-resources/
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Il s'agit de types de ressources qui ont été créés ou ajoutés par HealthLake.
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http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/
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Où le résultat brut des opérations d'Amazon Comprehend API Medical est ajouté à HealthLake votre banque de données.
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Linkage
: Ce type de ressource est soit ajouté, soit créé à la suite de l'intégrationNLP. UneGET
requête portant sur un sujet spécifiqueLinkage
renvoie une liste de ressources liées. Pour savoir si aLinkage
été ajouté par HealthLake, recherchez la paire"tag": [{"display": "SYSTEM_GENERATED"}]
clé-valeur ajoutée. Pour en savoir plus sur les FHIR spécifications relatives à Linkage, voir Type de ressource : Liaison dans l'index de FHIRdocumentation. -
FHIRtypes de ressources générés à la suite des opérations d'Amazon Comprehend API Medical.
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Observation
: Les résultats des DetectEntities opérations Amazon Comprehend API Medical -V2 et ICD1 Infer 0-CM y sont ajoutés lorsque les traits sont ou.SIGN
SYMPTOM
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Condition
: Les résultats des DetectEntities opérations -V2 d'Amazon Comprehend API Medical et ICD1 Infer 0-CM y sont ajoutés lorsque les traits le sont.DIAGNOSIS
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MedicationStatement
: Des résultats de l' InferRxNorm opération Amazon Comprehend API Medical y ont été ajoutés.
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Intégration aux FHIR REST API opérations
Par défaut, les caractéristiques détectées par les opérations d'Amazon Comprehend API Medical ne sont pas renvoyées lors GET
d'une demande.
Pour voir les résultats des NLP opérations intégrées pour ces types de ressources, vous devez spécifier une ressource connueID
.
-
Linkage
-
Observation
-
Condition
-
MedicationStatement
Les résultats des NLP opérations intégrées autres que le type de DocumentReference ressource ne sont disponibles qu'à l'aide d'une GET
demande dont le contenu spécifié ID
est connu pour contenir les résultats des opérations Amazon Comprehend API Medical.
Exemples de la manière dont les opérations d'Amazon Comprehend API Medical sont intégrées dans HealthLake
Exemple 1 : dossier patient ingéré dans une banque de HealthLake données
Voici un exemple de note clinique basée sur la rencontre d'un patient avec un professionnel de santé.
Données synthétiques
Le texte de cet exemple est un contenu synthétique et ne contient pas d'informations médicales personnelles (PHI).
1991-08-31 # Chief Complaint - Headache - Sinus Pain - Nasal Congestion - Sore Throat - Pain with Bright Lights - Nasal Discharge - Cough # History of Present Illness Jerónimo599 is a 4 month-old non-hispanic white male. # Social History Patient has never smoked. Patient comes from a middle socioeconomic background. Patient currently has Aetna. # Allergies No Known Allergies. # Medications No Active Medications. # Assessment and Plan Patient is presenting with bee venom (substance), mold (organism), house dust mite (organism), animal dander (substance), grass pollen (substance), tree pollen (substance), lisinopril, sulfamethoxazole / trimethoprim, fish (substance). ## Plan The patient was prescribed the following medications: - astemizole 10 mg oral tablet - nda020800 0.3 ml epinephrine 1 mg/ml auto-injector The patient was placed on a careplan: - self-care interventions (procedure)
Pour rappel, ces informations sont encodées au format base64 dans la DocumentReference ressource. Lorsque ce document est intégré HealthLake et que les API opérations Amazon Comprehend Medical sont terminées, pour voir les résultats, vous pouvez commencer par la GET
demande sur le DocumentReference
type de ressource.
GET https://https://healthlake.
your-region
.amazonaws.com/datastore/your-datastore-id
/r4/eeb8005725ae22b35b4edbdc68cf2dfd
/r4/DocumentReference
Lorsque les opérations d'Amazon Comprehend API Medical sont réussies, recherchez ces paires clé-valeur dans extension
le lien suivant "url": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/"
{ "url": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/status/", "valueString": "SUCCESS" }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/message/", "valueString": "The Amazon HealthLake integrated medical NLP operation was successful." }
Les onglets suivants indiquent comment le dossier médical ingéré est enregistré dans votre banque de HealthLake données en fonction du type de ressource.
Exemple 2 : A DocumentReference
contenant le type de MedicationStatement ressource
Voici un exemple de note clinique basée sur la rencontre d'un patient avec un professionnel de santé.
Données synthétiques
Le texte de cet exemple est un contenu synthétique et ne contient pas d'informations médicales personnelles (PHI).
Tom is not prescribed Advil
Les onglets suivants montrent comment le dossier médical ingéré est enregistré dans votre banque de HealthLake données en fonction du type de ressource.