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# Création de boutiques de HealthOmics variantes
<a name="creating-variant-stores"></a>

**Important**  
AWS HealthOmics les magasins de variantes et les magasins d'annotations ne sont plus ouverts aux nouveaux clients. Les clients existants peuvent continuer à utiliser le service normalement. Pour de plus amples informations, veuillez consulter [AWS HealthOmics modification de la disponibilité du magasin de variantes et du magasin d'annotations](variant-store-availability-change.md).

Les rubriques suivantes décrivent comment créer des magasins de HealthOmics variantes à l'aide de la console et de l'API.

**Topics**
+ [Création d'un magasin de variantes à l'aide de la console](#gs-console-analytics)
+ [Création d'un magasin de variantes à l'aide de l'API](#gs-api-analytics)

## Création d'un magasin de variantes à l'aide de la console
<a name="gs-console-analytics"></a>

Vous pouvez créer un magasin de variantes à l'aide de la HealthOmics console.

1. Ouvrez la [HealthOmics console](https://console.aws.amazon.com/omics/).

1.  Si nécessaire, ouvrez le volet de navigation de gauche (≡). Choisissez **Variant stores**.

1. Sur la page **Créer un magasin de variantes**, fournissez les informations suivantes
   + **Variante du nom de la boutique** : nom unique pour cette boutique. 
   + **Description** (facultatif) : description de ce magasin de variantes.
   + **Génome de référence** - Le génome de référence pour cette banque de variants.
   + **Chiffrement des données** - Choisissez si vous souhaitez que le chiffrement des données soit détenu et géré par vous-même AWS ou par vous-même. 
   + **Balises** (facultatif) - Fournissez jusqu'à 50 balises pour cette variante de boutique.

1. Choisissez **Créer un magasin de variantes**.

## Création d'un magasin de variantes à l'aide de l'API
<a name="gs-api-analytics"></a>

Utilisez le fonctionnement de l' HealthOmics `CreateVariantStore`API pour créer des magasins de variantes. Vous pouvez également effectuer cette opération avec le AWS CLI.

Pour créer un magasin de variantes, vous devez fournir un nom au magasin et l'ARN d'un magasin de référence. Le magasin de variantes est prêt à ingérer des données lorsque son statut passe à READY. 

L'exemple suivant utilise le AWS CLI pour créer un magasin de variantes.

```
aws omics create-variant-store --name myvariantstore \
    --reference referenceArn="arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:referenceStore/123456789/reference/5987565360"
```

Pour confirmer la création de votre boutique de variantes, vous recevez la réponse suivante.

```
{
    "creationTime": "2022-11-03T18:19:52.296368+00:00",
    "id": "45aeb91d5678",
    "name": "myvariantstore",
    "reference": {
        "referenceArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:referenceStore/123456789/reference/5987565360"
    },
    "status": "CREATING"
}
```

Pour en savoir plus sur un magasin de variantes, utilisez l'**get-variant-store**API.

```
aws omics get-variant-store --name myvariantstore
```

Vous recevez la réponse suivante.

```
{
    "id": "45aeb91d5678",
    "reference": {
        "referenceArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:referenceStore/123456789/reference/5987565360"
    },
    "status": "ACTIVE",
    "storeArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:variantStore/myvariantstore",
    "name": "myvariantstore",
    "creationTime": "2022-11-03T18:19:52.296368+00:00",
    "updateTime": "2022-11-03T18:30:56.272792+00:00",
    "tags": {},
    "storeSizeBytes": 0
}
```

Pour afficher toutes les variantes de magasins associées à un compte, utilisez l'**list-variant-stores**API.

```
aws omics list-variant-stores  
```

Vous recevez une réponse répertoriant toutes les variantes de magasins, ainsi que leurs IDs statuts et autres informations, comme indiqué dans l'exemple de réponse suivant.

```
{
    "variantStores": [
        {
            "id": "45aeb91d5678",
            "reference": {
                "referenceArn": "arn:aws:omics:us-west-2:55555555555:referenceStore/5506874698"
            },
            "status": "ACTIVE",
            "storeArn": "arn:aws:omics:us-west-2:55555555555:variantStore/new_variant_store",
            "name": "variantstore",
            "creationTime": "2022-11-03T18:19:52.296368+00:00",
            "updateTime": "2022-11-03T18:30:56.272792+00:00",
            "statusMessage": "",
            "storeSizeBytes": 141526
        }
    ]
}
```

Vous pouvez également filtrer les réponses pour l'**list-variant-stores**API en fonction des statuts ou d'autres critères.

 Les fichiers VCF importés dans des magasins d'analyse créés le 15 mai 2023 ou après cette date ont défini des schémas pour les annotations VEP (Variant Effect Predictor). Cela facilite l'interrogation et l'analyse des données VCF importées. La modification n'a aucun impact sur les magasins créés avant le 15 mai 2023, sauf si le `annotation fields` paramètre est inclus dans l'appel d'API ou de CLI. Pour ces magasins, l'utilisation du `annotation fields` paramètre entraînera l'échec de la demande.