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Exemple de cluster avec des actions de bootstrap personnalisées - AWS ParallelCluster

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Exemple de cluster avec des actions de bootstrap personnalisées

Les étapes suivantes permettent de créer un script simple à exécuter une fois le nœud configuré, qui installe les wget packages R, curl et sur les nœuds du cluster.

  1. Créez un script.

    #!/bin/bash
  echo "The script has $# arguments"
  for arg in "$@"
  do
      echo "arg: ${arg}"
  done
  yum -y install "${@:1}"

  2. Téléchargez le script avec les autorisations appropriées sur Amazon S3. Si les autorisations de lecture publiques ne vous conviennent pas, utilisez HeadNode les sections de SlurmQueues configuration Scheduling//S3Accesset/. Iam Pour de plus amples informations, veuillez consulter Travailler avec Amazon S3.

    $ aws s3 cp --acl public-read /path/to/myscript.sh s3://amzn-s3-demo-bucket/myscript.sh
    Important

    Si le script a été modifié sous Windows, les fins de ligne doivent passer de CRLF à LF avant que le script ne soit chargé sur Amazon S3.

  3. Mettez à jour la AWS ParallelCluster configuration pour inclure la nouvelle OnNodeConfigured action.

    CustomActions:
  OnNodeConfigured:
    Script: https://<amzn-s3-demo-bucket>.s3.<region>.amazonaws.com/myscript.sh
    Args:
      - "R"
      - "curl"
      - "wget"

    Si le bucket ne dispose pas d'une autorisation de lecture publique, s3 utilisez-le comme protocole URL.

    CustomActions:
  OnNodeConfigured:
    Script: s3://amzn-s3-demo-bucket/myscript.sh
    Args:
      - "R"
      - "curl"
      - "wget"

  4. Lancement du cluster

    $ pcluster create-cluster --cluster-name mycluster \
  --region <region> --cluster-configuration config-file.yaml

  5. Vérifiez la sortie.

    • Si vous avez ajouté des actions personnalisées à la HeadNode configuration, connectez-vous au nœud principal et vérifiez le cfn-init.log fichier qui s'y trouve /var/log/cfn-init.log en exécutant la commande suivante :

      $ less /var/log/cfn-init.log
  2021-09-03 10:43:54,588 [DEBUG] Command run
  postinstall output: The script has 3 arguments
  arg: R
  arg: curl
  arg: wget
  Loaded plugins: dkms-build-requires, priorities, update-motd, upgrade-helper
  Package R-3.4.1-1.52.amzn1.x86_64 already installed and latest version
  Package curl-7.61.1-7.91.amzn1.x86_64 already installed and latest version
  Package wget-1.18-4.29.amzn1.x86_64 already installed and latest version
  Nothing to do

    • Si vous avez ajouté des actions personnalisées au SlurmQueues paramètre, cochez la case cloud-init.log située /var/log/cloud-init.log dans un nœud de calcul. Utilisez CloudWatch pour afficher ces journaux.

    Vous pouvez consulter ces deux journaux sur la CloudWatch console Amazon. Pour de plus amples informations, veuillez consulter Intégration à Amazon CloudWatch Logs.