Terjemahan disediakan oleh mesin penerjemah. Jika konten terjemahan yang diberikan bertentangan dengan versi bahasa Inggris aslinya, utamakan versi bahasa Inggris.

# Menjalankan kueri di toko HealthOmics varian
<a name="analytics-run-queries"></a>

**penting**  
AWS HealthOmics toko varian dan toko anotasi tidak lagi terbuka untuk pelanggan baru. Pelanggan yang sudah ada dapat terus menggunakan layanan ini seperti biasa. Untuk informasi selengkapnya, lihat [AWS HealthOmics toko varian dan perubahan ketersediaan toko anotasi](variant-store-availability-change.md).

Anda dapat melakukan kueri di toko varian Anda menggunakan Amazon Athena. Perhatikan bahwa koordinat genom dalam penyimpanan varian dan anotasi direpresentasikan sebagai interval setengah terbuka setengah tertutup berbasis nol.

## Jalankan kueri sederhana menggunakan konsol Athena
<a name="run-queries-athena-simple"></a>

Contoh berikut menunjukkan bagaimana menjalankan query sederhana.

1. [Buka editor Kueri Athena: Athena Query editor](https://console.aws.amazon.com//athena)

1. Di bawah **Workgroup**, pilih workgroup yang Anda buat selama penyiapan.

1. Verifikasi bahwa **sumber data** adalah **AwsDataCatalog**.

1. Untuk **Database**, pilih tautan sumber daya database yang Anda buat selama penyiapan Lake Formation.

1. Salin kueri berikut ke **Editor Kueri** di bawah tab **Query 1**:

   ```
   SELECT * from omicsvariants limit 10
   ```

1. Pilih **Jalankan** untuk menjalankan kueri. Konsol mengisi tabel hasil dengan 10 baris pertama **omicsvariants** tabel.

## Jalankan kueri kompleks menggunakan konsol Athena
<a name="run-queries-athena-complex"></a>

Contoh berikut menunjukkan bagaimana menjalankan query kompleks. Untuk menjalankan kueri ini, impor `ClinVar` ke toko anotasi.

**Jalankan kueri yang kompleks**

1. [Buka editor Kueri Athena: Athena Query editor](https://console.aws.amazon.com//athena)

1. Di bawah **Workgroup**, pilih workgroup yang Anda buat selama penyiapan.

1. Verifikasi bahwa **sumber data** adalah **AwsDataCatalog**.

1. Untuk **Database**, pilih tautan sumber daya database yang Anda buat selama penyiapan Lake Formation.

1. Pilih **\$1** di kanan atas untuk membuat tab kueri baru bernama **Query 2**.

1. Salin kueri berikut ke **Editor Kueri** di bawah tab **Query 2**:

   ```
   SELECT variants.sampleid,
     variants.contigname,
     variants.start,
     variants."end",
     variants.referenceallele,
     variants.alternatealleles,
     variants.attributes AS variant_attributes,
     clinvar.attributes AS clinvar_attributes  
   FROM omicsvariants as variants 
   INNER JOIN omicsannotations as clinvar ON 
     variants.contigname=CONCAT('chr',clinvar.contigname) 
     AND variants.start=clinvar.start 
     AND variants."end"=clinvar."end" 
     AND variants.referenceallele=clinvar.referenceallele 
     AND variants.alternatealleles=clinvar.alternatealleles 
   WHERE clinvar.attributes['CLNSIG']='Likely_pathogenic'
   ```

1. Pilih **Jalankan** untuk mulai menjalankan kueri.