Terjemahan disediakan oleh mesin penerjemah. Jika konten terjemahan yang diberikan bertentangan dengan versi bahasa Inggris aslinya, utamakan versi bahasa Inggris.
# Pemantauan HealthOmics dengan CloudWatch Log
HealthOmics menghasilkan berbagai log untuk membantu Anda memahami dan memecahkan masalah proses Anda. Log tersedia di dua tempat: CloudWatch dan Amazon S3.
Secara default, proses telah mengaktifkan logging. Anda secara opsional dapat menonaktifkan logging untuk menjalankan dengan menyetel `LogLevel = OFF` **startrun** permintaan.
**catatan**
Untuk pembaruan layanan, konfigurasikan dan pantau [Dashboard Personal Health](https://health.console.aws.amazon.com/health/home#/account/dashboard/open-issues) Anda. Untuk informasi selengkapnya tentang cara mengelola dasbor, lihat [Memulai dengan Dasbor AWS Health Anda](https://docs.aws.amazon.com/health/latest/ug/getting-started-health-dashboard.html).
**Topics**
+ [Jenis log untuk HealthOmics alur kerja](#log-descriptions)
+ [Log masuk CloudWatch](#cloudwatch-logs)
+ [Log di Amazon S3](#s3-logs)
+ [CloudWatch Log Interaktif di CLI](#cloudwatch-logs-cli)
+ [Mengakses CloudWatch Log dari konsol](#cloudwatch-logs-console)
## Jenis log untuk HealthOmics alur kerja
HealthOmics menyediakan jenis log berikut untuk alur kerja:
+ Log mesin — Mesin alur kerja yang mendasarinya (Nextflow, WDL, dan CWL) menghasilkan log mesin untuk dijalankan. Log ini dapat membantu Anda memecahkan masalah definisi alur kerja.
+ Jalankan log manifes — Log ini memberikan informasi tingkat tinggi tentang setiap tugas yang dijalankan, seperti status tugas, waktu mulai, waktu berhenti, dan alasan gagal (jika tugas gagal).
Jalankan log manifes juga melaporkan statistik pemanfaatan sumber daya yang dapat membantu untuk memahami peluang pengoptimalan sumber daya. Statistik ini meliputi:
+ CPUSAverage
+ CPUSMaksimum
+ CPUSreserved
+ GPUSreserved
+ memoryAverageGiB
+ memoryMaximumGiB
+ memoryReservedGiB
+ RunningSeconds
+ Run logs — Run logs menyediakan status run keseluruhan dan waktu ketika tugas individu dimulai, berjalan, berhenti, dan selesai. Jalankan log juga memberi Anda visibilitas ke langkah-langkah impor dan ekspor file.
+ Log tugas — Log tugas memberikan informasi pencatatan terperinci tentang tugas individual dalam proses Anda. Output dalam log tugas Anda bergantung pada definisi tugas dan di mana Anda menggunakan pernyataan log dalam kode Anda. Jika log tugas Anda tidak memberikan tingkat wawasan yang Anda butuhkan, pertimbangkan untuk menambahkan pernyataan log tambahan ke definisi tugas Anda untuk menghasilkan log tugas yang lebih berwawasan.
+ Jalankan log cache - Jalankan log cache memberikan status keseluruhan cache run dan caching output tugas. Jalankan log cache memberi Anda visibilitas ke dalam klik dan kesalahan cache untuk setiap proses yang menggunakan caching.
+ Outputs.json — Untuk alur kerja WDL dan CWL, HealthOmics mengirimkan file yang dibuat mesin, bernama, ke bucket Amazon S3 Anda setelah proses selesai. `outputs.json` File ini mencakup daftar dan peta semua output untuk dijalankan.
## Log masuk CloudWatch
CloudWatch menghasilkan log alur kerja untuk menjalankan yang gagal dan berjalan dengan sukses. Semua log tersedia untuk proses yang gagal dan berjalan dengan sukses, kecuali log mesin hanya tersedia untuk proses yang gagal.
Anda dapat menemukan log CloudWatch alur kerja di grup log berikut:`/aws/omics/WorkflowLog`. Selain itu, output dari operasi **get-run** API menyediakan aliran CloudWatch log ARNs untuk log mesin dan menjalankan log.
Secara default, AWS menyimpan CloudWatch Log tanpa batas. Anda dapat menyesuaikan kebijakan penyimpanan grup log untuk menetapkan periode retensi antara 10 tahun dan satu hari.
Tabel berikut memberikan ringkasan dari CloudWatch Log in HealthOmics. Semua log alur kerja tersedia untuk proses yang berhasil dan gagal berjalan, kecuali log mesin hanya tersedia untuk proses yang gagal.
| Nama log | Tersedia dalam CloudWatch Log | Kapan log tersedia | Format aliran log |
| --- | --- | --- | --- |
| Log mesin | Ya, untuk proses yang gagal | Setelah lari selesai | jalankan//mesin runID |
| Jalankan log manifes | Ya | Setelah lari selesai | manifest/lari//runIDrunUUID |
| Jalankan log | Ya | Secara real time | lari/ runID |
| Log tugas | Ya | Secara real time | jalankan// tugas/runIDtaskID |
| Jalankan log cache | Ya | Secara real time | Runcache//runCacheIdrunCacheUUID |
| Outputs.json (WDL dan CWL) | Tidak | tidak berlaku | T/A |
## Log di Amazon S3
Hanya log mesin dan `outputs.json` file yang dikirim ke Amazon S3.
Setelah proses selesai, log mesin dikirim ke bucket S3 Anda dan tersedia tanpa batas hingga Anda menghapusnya. Log ini terletak di direktori log dari URI keluaran S3 yang Anda tentukan untuk alur kerja.
Jalur ke direktori log memiliki format berikut:`s3://{user_provided_path}/logs/`.
Tabel berikut memberikan ringkasan HealthOmics log yang tersedia di bucket Amazon S3 Anda.
| Nama log | Tersedia di Amazon S3 | Kapan log tersedia | Jalur aliran log |
| --- | --- | --- | --- |
| Log mesin | Ya | Setelah lari selesai | s3:///logs/engine.log user\$1provided\$1path |
| Outputs.json (WDL dan CWL) | Ya | Setelah lari selesai | s3:///user\$1provided\$1path/runID/logs/outputs.json runUUID |
| Jalankan log manifes, jalankan log, dan log tugas | Tidak | tidak berlaku | T/A |
## CloudWatch Log Interaktif di CLI
Anda dapat melihat CloudWatch Log secara interaktif menggunakan perintah Live Tail dalam mode interaktif. Anda dapat melacak kemajuan run secara real time dan menentukan hingga 5 kata kunci untuk disorot di log:
```
aws logs start-live-tail \
--mode interactive \
--log-group-identifiers arn:aws:logs:region:account-ID:log-group:/aws/omics/WorkflowLog
```
Untuk informasi selengkapnya, lihat [Memulai ekor langsung](https://awscli.amazonaws.com/v2/documentation/api/latest/reference/logs/start-live-tail.html) di Referensi AWS CLI Perintah.
## Mengakses CloudWatch Log dari konsol
Untuk mengakses log untuk dijalankan, Anda dapat menautkan langsung ke log ini dari halaman **Run details** di HealthOmics konsol.
1. Buka [konsol HealthOmics ](https://console.aws.amazon.com/omics/).
1. Jika diperlukan, buka panel navigasi kiri (≡). Pilih **Runs**.
1. Pilih run dari tabel Runs.
1. Di halaman run details, Anda dapat memilih salah satu tindakan ini:
1. Dari **Run summary**, pilih **View run logs**. Konsol membuka log run di CloudWatch konsol.
1. Dari **Run summary**, pilih **Lihat log di Amazon S3**. Konsol membuka folder log di konsol Amazon S3.
1. Dari **Jalankan tugas**, pilih **Lihat log**, **Lihat log jalankan**, atau **Lihat menjalankan log manifes** untuk tugas. Konsol membuka log di CloudWatch konsol.
Anda juga dapat menavigasi ke log dari CloudWatch konsol:
1. Buka CloudWatch konsol [https://console.aws.amazon.com/cloudwatch/](https://console.aws.amazon.com/cloudwatch/).
1. Dari menu sebelah kiri, pilih **Grup log**.
1. Pilih grup `/aws/omics/WorkflowLog`.
Jika daftar grup log panjang, Anda dapat memasukkan **omics** di kotak teks pencarian untuk mempersempit daftar.
1. Saat halaman **detail grup Log** terbuka, pilih aliran log yang ingin Anda lihat. Konsol menampilkan peristiwa untuk aliran log ini.