View a markdown version of this page

Mengekspor set HealthOmics baca ke bucket Amazon S3 - AWS HealthOmics

Terjemahan disediakan oleh mesin penerjemah. Jika konten terjemahan yang diberikan bertentangan dengan versi bahasa Inggris aslinya, utamakan versi bahasa Inggris.

Mengekspor set HealthOmics baca ke bucket Amazon S3

Anda dapat mengekspor set baca sebagai pekerjaan ekspor batch ke bucket Amazon S3. Untuk melakukannya, pertama-tama buat kebijakan IAM yang memiliki akses tulis ke bucket, mirip dengan contoh kebijakan IAM berikut.

JSON
{
  "Version":"2012-10-17",
  "Statement": [
    {
      "Effect": "Allow",
      "Action": [
        "s3:PutObject",
        "s3:GetBucketLocation"
      ],
      "Resource": [
        "arn:aws:s3:::amzn-s3-demo-bucket1",
        "arn:aws:s3:::amzn-s3-demo-bucket1/*"
      ]
    }
  ]
}
JSON
{
"Version":"2012-10-17",
"Statement": [
  {
      "Effect": "Allow",
      "Principal": {
          "Service": [
              "omics.amazonaws.com"
          ]
      },
      "Action": "sts:AssumeRole"
  }
]
}

Setelah kebijakan IAM diberlakukan, mulailah pekerjaan ekspor set baca Anda. Contoh berikut menunjukkan cara melakukannya dengan menggunakan operasi API start-read-set-export-job. Dalam contoh berikut, ganti semua parameter, sepertisequence store ID,, destinationrole ARN, dansources, dengan input Anda.

aws omics start-read-set-export-job 
--sequence-store-id sequence store id \
--destination valid s3 uri \
--role-arn role ARN \
--sources readSetId=read set id_1 readSetId=read set id_2

Anda menerima respons berikut dengan informasi tentang toko urutan asal dan bucket Amazon S3 tujuan. 

{
"id": <job-id>,
"sequenceStoreId": <sequence-store-id>,
"destination": <destination-s3-uri>,
"status": "SUBMITTED",
"creationTime": "2022-10-22T01:33:38.079000+00:00"
}

Setelah pekerjaan dimulai, Anda dapat menentukan statusnya dengan menggunakan operasi API get-read-set-export-job, seperti yang ditunjukkan pada berikut ini. Ganti sequence store ID dan job ID dengan ID toko urutan dan ID pekerjaan Anda, masing-masing. 

aws omics get-read-set-export-job --id job-id --sequence-store-id sequence store ID

Anda dapat melihat semua pekerjaan ekspor yang diinisialisasi untuk penyimpanan urutan menggunakan operasi API list-read-set-export-jobs, seperti yang ditunjukkan di bawah ini. Ganti sequence store ID dengan ID toko urutan Anda.

aws omics list-read-set-export-jobs --sequence-store-id sequence store ID.
{
"exportJobs": [
  {
      "id": <job-id>,
      "sequenceStoreId": <sequence-store-id>,
      "destination": <destination-s3-uri>,
      "status": "COMPLETED",
      "creationTime": "2022-10-22T01:33:38.079000+00:00",
      "completionTime": "2022-10-22T01:34:28.941000+00:00"
  }
]
}

Selain mengekspor set baca Anda, Anda juga dapat membagikannya dengan menggunakan URI akses Amazon S3. Untuk mempelajari selengkapnya, lihat Mengakses set HealthOmics baca dengan URI Amazon S3.