View a markdown version of this page

Akselerator tugas di a HealthOmics definisi alur kerja - AWS HealthOmics

Terjemahan disediakan oleh mesin penerjemah. Jika konten terjemahan yang diberikan bertentangan dengan versi bahasa Inggris aslinya, utamakan versi bahasa Inggris.

Akselerator tugas di a HealthOmics definisi alur kerja

Dalam definisi alur kerja, Anda dapat secara opsional menentukan spesifikasi akselerator GPU untuk tugas. HealthOmics mendukung nilai spec akselerator berikut, bersama dengan jenis instance yang didukung:

Spesifikasi akselerator Jenis instance Healthomics
nvidia-tesla-t4 G4
nvidia-tesla-t4-a10g G4 dan G5
nvidia-tesla-a10g G5
nvidia-t4-a10g-l4 G4, G5, dan G6
nvidia-l4-a10g G5 dan G6
nvidia-l4 G6
nvidia-l40s G6e

Jika Anda menentukan jenis akselerator yang mendukung beberapa jenis instance, HealthOmics memilih jenis instance berdasarkan kapasitas yang tersedia. Jika kedua jenis instans tersedia, HealthOmics memberikan preferensi untuk contoh biaya lebih rendah. Pengecualiannya adalah untuk akselerator tugas nvidia-t4-a10g-l4 yang memberikan preferensi ke instance generasi terbaru yang tersedia.

Untuk detail tentang jenis instans, lihat Accelerated-computing contoh.

Dalam contoh berikut, definisi alur kerja menentukan nvidia-l4 Sebagai akselerator:

WDL
task my_task { runtime { ... acceleratorCount: 1 acceleratorType: "nvidia-l4" } ... }
NextFlow
process my_task { ... accelerator 1, type: "nvidia-l4" ... }
CWL
cwlVersion: v1.2 class: CommandLineTool requirements: ... cwltool:CUDARequirement: cudaDeviceCountMin: 1 cudaComputeCapability: "nvidia-l4" cudaVersionMin: "1.0"

Konfigurasi sumber daya lanjutan

Anda juga dapat mengonfigurasi tugas untuk memesan beberapa akselerator dalam urutan prioritas pilihan Anda menggunakan omicsResourceFallbackOrder arahan. Arahan ini tersedia untuk WDL dan Nextflow. HealthOmics mencoba setiap profil akselerator dalam urutan yang Anda tentukan sampai satu berhasil, termasuk profil CPU akhir opsional.

Ini berguna dalam skenario berikut:

  • Fallback GPU ke GPU — Daftar jenis GPU dalam urutan prioritas (misalnya, coba nvidia-l40s pertama, kemudian kembali ke nvidia-l4).

  • Fallback GPU ke CPU — Tambahkan final CPU-only profil sehingga tugas selesai bahkan ketika tidak ada kapasitas GPU yang tersedia di Wilayah.

Untuk detail lengkap tentang omicsResourceFallbackOrder, termasuk referensi bidang per profil, aturan validasi, dan contoh WDL dan Nextflow lengkap, lihat Konfigurasi sumber daya lanjutan.