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# Creazione di negozi di HealthOmics varianti
<a name="creating-variant-stores"></a>

**Importante**  
AWS HealthOmics i negozi di varianti e i negozi di annotazioni non sono più aperti a nuovi clienti. I clienti esistenti possono continuare a utilizzare il servizio normalmente. Per ulteriori informazioni, consulta [AWS HealthOmics modifica della disponibilità dell'archivio delle varianti e dell'archivio delle annotazioni](variant-store-availability-change.md).

I seguenti argomenti descrivono come creare negozi di HealthOmics varianti utilizzando la console e l'API.

**Topics**
+ [Creazione di un archivio di varianti utilizzando la console](#gs-console-analytics)
+ [Creazione di un negozio di varianti utilizzando l'API](#gs-api-analytics)

## Creazione di un archivio di varianti utilizzando la console
<a name="gs-console-analytics"></a>

Puoi creare un negozio di varianti utilizzando la HealthOmics console.

1. Apri la [HealthOmics console](https://console.aws.amazon.com/omics/).

1.  Se necessario, apri il riquadro di navigazione a sinistra (≡). Scegli **Variant stores**.

1. Nella pagina **Crea negozio di varianti**, fornisci le seguenti informazioni
   + **Nome del negozio di varianti**: un nome univoco per questo negozio. 
   + **Descrizione** (opzionale): una descrizione di questo negozio di varianti.
   + **Genoma di riferimento**: il genoma di riferimento per questo archivio di varianti.
   + **Crittografia dei dati**: scegli se desideri che la crittografia dei dati sia di proprietà e gestita da te AWS o da solo. 
   + **Tag** (opzionale): fornisci fino a 50 tag per questo negozio di varianti.

1. Scegli **Crea negozio di varianti**.

## Creazione di un negozio di varianti utilizzando l'API
<a name="gs-api-analytics"></a>

Utilizza l'operazione HealthOmics `CreateVariantStore` API per creare archivi di varianti. È possibile eseguire questa operazione anche con AWS CLI.

Per creare un negozio di varianti, fornisci un nome per il negozio e l'ARN di un negozio di riferimento. L'archivio delle varianti è pronto per l'inserimento dei dati quando il relativo stato passa a READY. 

L'esempio seguente utilizza il AWS CLI per creare un negozio di varianti.

```
aws omics create-variant-store --name myvariantstore \
    --reference referenceArn="arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:referenceStore/123456789/reference/5987565360"
```

Per confermare la creazione del tuo negozio di varianti, riceverai la seguente risposta.

```
{
    "creationTime": "2022-11-03T18:19:52.296368+00:00",
    "id": "45aeb91d5678",
    "name": "myvariantstore",
    "reference": {
        "referenceArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:referenceStore/123456789/reference/5987565360"
    },
    "status": "CREATING"
}
```

Per saperne di più su un negozio di varianti, utilizza l'**get-variant-store**API.

```
aws omics get-variant-store --name myvariantstore
```

Riceverai la seguente risposta.

```
{
    "id": "45aeb91d5678",
    "reference": {
        "referenceArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:referenceStore/123456789/reference/5987565360"
    },
    "status": "ACTIVE",
    "storeArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:variantStore/myvariantstore",
    "name": "myvariantstore",
    "creationTime": "2022-11-03T18:19:52.296368+00:00",
    "updateTime": "2022-11-03T18:30:56.272792+00:00",
    "tags": {},
    "storeSizeBytes": 0
}
```

Per visualizzare tutti i negozi di varianti associati a un account, utilizza l'**list-variant-stores**API.

```
aws omics list-variant-stores  
```

Riceverai una risposta che elenca tutti gli store di varianti IDs, insieme ai relativi stati e ad altri dettagli, come mostrato nella risposta di esempio seguente.

```
{
    "variantStores": [
        {
            "id": "45aeb91d5678",
            "reference": {
                "referenceArn": "arn:aws:omics:us-west-2:55555555555:referenceStore/5506874698"
            },
            "status": "ACTIVE",
            "storeArn": "arn:aws:omics:us-west-2:55555555555:variantStore/new_variant_store",
            "name": "variantstore",
            "creationTime": "2022-11-03T18:19:52.296368+00:00",
            "updateTime": "2022-11-03T18:30:56.272792+00:00",
            "statusMessage": "",
            "storeSizeBytes": 141526
        }
    ]
}
```

Puoi anche filtrare le risposte per l'**list-variant-stores**API in base agli stati o ad altri criteri.

 I file VCF importati negli archivi analitici creati il o dopo il 15 maggio 2023 hanno schemi definiti per le annotazioni Variant Effect Predictor (VEP). Ciò semplifica l'interrogazione e l'analisi dei dati VCF importati. La modifica non ha alcun impatto sui negozi creati prima del 15 maggio 2023, a meno che il `annotation fields` parametro non sia incluso nella chiamata API o CLI. Per questi negozi, l'utilizzo del `annotation fields` parametro causerà l'esito negativo della richiesta.