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Usare EventBridge con AWS HealthOmics

HealthOmics invia eventi ad Amazon EventBridge quando le risorse cambiano stato. Le risorse includono processi di importazione, processi di esportazione, condivisioni di risorse, flussi di lavoro, attività ed esecuzioni. Per ogni tipo di risorsa, è disponibile un elenco di modifiche allo stato che generano un evento.

Un bus di eventi è un router che riceve eventi e li invia alle destinazioni. L'account include un bus di eventi predefinito che riceve automaticamente gli eventi dai AWS servizi. È possibile creare bus di eventi personalizzati aggiuntivi.

Si creano EventBridge regole per specificare le azioni da intraprendere quando il bus degli eventi riceve degli eventi. Ad esempio, è possibile creare una regola che notifica le modifiche di stato di una risorsa.

Gli scenari più comuni per l'utilizzo degli eventi includono:

Per ulteriori informazioni sull'utilizzo EventBridge, consulta Cos'è Amazon EventBridge?

Configurare EventBridge per HealthOmics

Prima di poter monitorare gli EventBridge eventi, crea un EventBridge bus e crea regole per gli eventi di interesse.

Configura un EventBridge bus

È possibile utilizzare il bus di eventi predefinito per il proprio bus di eventi Account AWS o configurare un bus di eventi personalizzato. Per configurare un bus di eventi personalizzato, segui questi passaggi:

Crea una EventBridge regola

La procedura seguente mostra come creare una regola semplice. Per ulteriori informazioni sulle regole, vedere Regole in EventBridge.

EventBridge eventi in HealthOmics

La tabella seguente elenca gli eventi a EventBridge cui vengono HealthOmics inviati e l'elenco dei possibili valori di stato per l'evento.

Struttura del messaggio di evento

HealthOmics fornisce la soluzione ottimale per inviare messaggi relativi agli eventi di modifica dello stato a. EventBridge L'evento è un oggetto con struttura JSON che contiene anche dettagli sui metadati. È possibile utilizzare i metadati come input per ricreare l'evento o per ottenere ulteriori informazioni. Gli eventi includono i seguenti campi:

Gli eventi di esecuzione includono i seguenti campi:

Esempi di messaggi di evento

L'esempio seguente è un evento per una modifica dello stato di esecuzione, che mostra i campi aggiuntivi.

{
    "version":"0",
    "id":"c0e540f4-df38-b986-86c1-3e3730f971fe",
    "detail-type":"Run Status Change",
    "source":"aws.omics",
    "account":"123456789012",
    "time":"2022-10-20T22:07:35Z",
    "region":"us-west-2",
    "resources":[
        "arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:run/2101313"
    ],
    "detail":{
        "omicsVersion":"1.0.0",
        "arn":"arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:run/2101313",
        "status":"COMPLETED",
        "uuid":"153893cd-097a-40ec-aec7-838a97cd2b21",
        "runId": "1234567",
        "runName": "run name",
        "runOutputUri": "s3://amzn-s3-demo-bucket/run-output/2101313",
        "workflowId": "1234567",
        "workflowName": "workflow name"
    }  
}   

L'esempio seguente è un evento per una modifica dello stato dell'attività.

{
    "version": "0",
    "id": "718d6817-c868-26d3-8ef0-0dc9b2ac73f4",
    "detail-type": "Task Status Change",
    "source": "aws.omics",
    "account": "123456789012",
    "time": "2024-10-30T09:05:44Z",
    "region": "us-west-2",
    "resources": ["arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:task/8888888"],
    "detail": {
        "omicsVersion": "1.0.0",
        "arn": "arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:task/8888888",
        "status": "COMPLETED",
        "runArn": "arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:run/2101313",
        "runUuid": "153893cd-097a-40ec-aec7-838a97cd2b21",
        "runId": "1234567",
        "runName": "run name",
        "workflowId": "1234567",
        "workflowName": "workflow name"
    }      
}   

Di seguito è riportato un esempio di evento per una modifica dello stato del set di lettura.

{
  "version": "0",
  "id": "64ca0eda-9751-dc55-c41a-1bd50b4fc9b7",
  "detail-type": "Read Set Status Change",
  "source": "aws.omics",
  "account": "123456789012",
  "time": "2023-04-04T17:53:06Z",
  "region": "us-west-2",
  "resources": ["arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:sequenceStore/1234567890/readSet/3456789012"],
  "detail": {
     "omicsVersion": "1.0.0",
     "arn": "arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:sequenceStore/1234567890/readSet/3456789012",
     "sequenceStoreId" : "1234567890", 
     "id": "3456789012", 
     "status": "PROCESSING_UPLOAD"
  }
}   

Un evento simile viene creato per un processo di importazione di un negozio di varianti.

{
    "version": "0",
    "id": "6a7e8feb-b491-4cf7-a9f1-bf3703467718",
    "detail-type": "Variant Store Status Change",
    "source": "aws.omics",
    "account": "123456789012",
    "time": "2015-12-22T18:43:48Z",
    "region": "us-east-1",
    "resources": ["arn:aws:omics:us-east-1:123456789012:myvariantstore2"],
    "detail": {
       "omicsVersion": "1.0.0",
       "arn": "arn:aws:omics:us-east-1:123456789012:myvariantstore2",
       "status": "CREATED",
       "storeId": "6710c5f02610", 
       "storeName": "myvariantstore2"
    }
}   

Di seguito è riportato un evento per la modifica dello stato del processo di importazione.

{
    "version": "0",
    "id": "6a7e8feb-b491-4cf7-a9f1-bf3703467718",
    "detail-type": "Variant Import Job Status Change",
    "source": "aws.omics",
    "account": "123456789012",
    "time": "2015-12-22T18:43:48Z",
    "region": "us-east-1",
    "resources": ["arn:aws:omics:us-east-1:123456789012:my_variant_store/b64ea9a3-459f-4b68-92c3-3ddb83209fe9"],
    "detail": {
       "omicsVersion": "1.0.0",
       "arn": "arn:aws:omics:us-east-1:123456789012:my_variant_store/b64ea9a3-459f-4b68-92c3-3ddb83209fe9",   
       "status": "COMPLETED",
       "jobId": "b64ea9a3-459f-4b68-92c3-3ddb83209fe9",
       "storeId": "a74869f91e20",
       "storeName": "my_variant_store"
    }
}