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# Guida introduttiva con HealthOmics
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Per iniziare HealthOmics, assicurati di aver configurato correttamente le [autorizzazioni e i ruoli IAM per HealthOmics](https://docs.aws.amazon.com/omics/latest/dev/setting-up-new.html#setting-up-create-iam-user). 

## Utilizzo di un flusso di lavoro Ready2Run nella console HealthOmics
<a name="ready2run-workflow"></a>

L'esercizio seguente mostra come utilizzare un flusso di lavoro Ready2Run. Un flusso di lavoro Ready2Run è preconfigurato con i parametri e i riferimenti agli strumenti necessari per eseguire il flusso di lavoro. L'editore del workflow fornisce dati di esempio, quindi non è necessario creare dati propri.

1. Apri la [HealthOmics console](https://console.aws.amazon.com/omics/).

1. Seleziona il pannello di navigazione (≡) in alto a sinistra e seleziona **Ready2Run** Workflows.

1. Nella pagina Flussi di lavoro **Ready2Run**, scegli il flusso di lavoro. **ESMFold for up to 800 residues** La console apre la pagina dei dettagli per quel flusso di lavoro.

1. La scheda dei dettagli fornisce informazioni sul flusso di lavoro. Per provare il flusso di lavoro, seleziona **Avvia esecuzione** in alto a destra della pagina.

1. Nella pagina **Specificare i dettagli della corsa**, inserisci un nome di esecuzione.

1. Inserisci o seleziona una posizione Amazon S3 per l'output di esecuzione. 

1. Per la **modalità di conservazione dei metadati Run**, scegli se conservare o rimuovere i metadati runmeta. 

1. Nel pannello **Ruolo di servizio**, scegli **Crea e usa un nuovo ruolo di servizio**.

1. Scegli **Next (Successivo)**.

1. Nella pagina **Aggiungi valori dei parametri**, scegli **Esegui flusso di lavoro con dati di test Ready2Run**.

1. Scegli **Next (Successivo)**.

1. **Controlla i dati immessi, quindi scegli Avvia esecuzione.**

## Esempi di istruzioni per Amazon Q CLI
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La CLI di Amazon Q può eseguire flussi di lavoro genomici e attività di analisi utilizzando comandi in AWS HealthOmics linguaggio naturale. I seguenti prompt di esempio consentono di creare flussi di lavoro, gestire esecuzioni e analizzare dati genomici. [Per ulteriori informazioni e suggerimenti di esempio, consulta il tutorial sull'intelligenza artificiale generativa di HealthOmics Agentic su. HealthOmics ](https://github.com/aws-samples/aws-healthomics-tutorials/tree/main/generative-ai) GitHub 
+ «Crea un file di workflow WDL 1.1 su cui verrà eseguito. `main.wdl` HealthOmics Il flusso di lavoro utilizzerà un genoma di riferimento come input e coppie di file fastq. Indicizzerà il genoma di riferimento utilizzando BWA e quindi mapperà ogni coppia di file fastq sul riferimento. Infine unisci ogni BAM mappato in un singolo file BAM e restituisci questo file e il suo indice bai.»
+ «Package del workflow e crealo in HealthOmics»
+ «Aggiorna il file inputs.json per utilizzare file reali dal mio bucket Amazon S3" (`omics-my-bucket-with-genome-data`fornisci una posizione specifica per il bucket Amazon S3 o lascia che Amazon Q esplori)
+ «Trova contenitori adatti nei miei repository Amazon ECR e aggiorna inputs.json per utilizzarli»
+ «Trova o crea un ruolo IAM adatto da utilizzare durante l'esecuzione del flusso di lavoro»
+ «Crea una cache di esecuzione per il mio flusso di lavoro»
+ «Esegui il flusso di lavoro in HealthOmics»
+ «Controlla lo stato della corsa»

**avvertimento**  
Quando lavori con Amazon Q CLI, esamina tutti i contenuti generati e le azioni proposte prima di procedere. Fornisci feedback per migliorare la qualità della risposta e soddisfare i requisiti del tuo flusso di lavoro. Per ulteriori informazioni, consulta [Considerazioni sulla sicurezza e best practice](https://docs.aws.amazon.com/amazonq/latest/qdeveloper-ug/command-line-chat-security.html) per Amazon Q.