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Slurm Workload Manager (slurm)

Capacità, dimensione e aggiornamento del cluster.

La capacità del cluster è definita dal numero di nodi di calcolo scalabili dal cluster. I nodi di calcolo sono supportati da EC2 istanze Amazon definite all'interno delle risorse di elaborazione nella AWS ParallelCluster configurazione (Scheduling/SlurmQueues/ComputeResources) e sono organizzati in code (Scheduling/SlurmQueues) con mappatura 1:1 a Slurm partizioni.

All'interno di una risorsa di calcolo è possibile configurare il numero minimo di nodi di calcolo (istanze) che devono essere sempre mantenuti in esecuzione nel cluster (MinCount) e il numero massimo di istanze che la risorsa di calcolo può scalare fino a (3). MaxCount

Al momento della creazione del cluster o dopo un aggiornamento del cluster, AWS ParallelCluster avvia tutte le EC2 istanze Amazon configurate MinCount per ogni risorsa di calcolo (Scheduling/SlurmQueues/ ComputeResources ) definita nel cluster. Le istanze avviate per coprire il numero minimo di nodi per le risorse di calcolo nel cluster sono chiamate nodi statici. Una volta avviati, i nodi statici sono pensati per essere persistenti nel cluster e non vengono terminati dal sistema, a meno che non si verifichi un evento o una condizione particolare. Tali eventi includono, ad esempio, il fallimento di Slurm o i controlli EC2 sanitari di Amazon e la modifica del Slurm stato del nodo su DRAIN oDOWN.

Le EC2 istanze Amazon, nell'intervallo da 0 1 a ‘MaxCount - MinCount’ (MaxCount meno) MinCount), lanciate su richiesta per gestire l'aumento del carico del cluster, vengono chiamate nodi dinamici. La loro natura è effimera, vengono avviate per eseguire lavori in sospeso e vengono terminate quando rimangono inattive per un periodo di tempo definito Scheduling/SlurmSettings/ScaledownIdletime nella configurazione del cluster (impostazione predefinita: 10 minuti).

I nodi statici e i nodi dinamici sono conformi al seguente schema di denominazione:

Ad esempio, data la seguente AWS ParallelCluster configurazione:

Scheduling:  
    Scheduler: Slurm  
    SlurmQueues:    
        - Name: queue1      
            ComputeResources:        
                - Name: c5xlarge          
                    Instances:            
                        - InstanceType: c5.xlarge          
                        MinCount: 100          
                        MaxCount: 150        

I seguenti nodi verranno definiti in Slurm

$ sinfo
PARTITION AVAIL  TIMELIMIT  NODES  STATE NODELIST
queue1*      up   infinite     50  idle~ queue1-dy-c5xlarge-[1-50]
queue1*      up   infinite    100   idle queue1-st-c5xlarge-[1-100]                
            

Quando una risorsa di elaborazione lo haMinCount == MaxCount, tutti i nodi di calcolo corrispondenti saranno statici e tutte le istanze verranno avviate al momento della creazione/aggiornamento del cluster e mantenute attive e funzionanti. Per esempio:

Scheduling:
  Scheduler: slurm
  SlurmQueues:
    - Name: queue1
      ComputeResources:
        - Name: c5xlarge
          Instances:
            - InstanceType: c5.xlarge
          MinCount: 100
          MaxCount: 100
            

$ sinfo
PARTITION AVAIL  TIMELIMIT  NODES  STATE NODELIST
queue1*      up   infinite    100   idle queue1-st-c5xlarge-[1-100]               
            

Aggiornamento della capacità del cluster

L'aggiornamento della capacità del cluster include l'aggiunta o la rimozione di code, risorse di elaborazione o la modifica MinCount/MaxCount di una risorsa di elaborazione. A partire dalla AWS ParallelCluster versione 3.9.0, la riduzione delle dimensioni di una coda richiede l'arresto o l'QueueUpdateStrategyimpostazione del parco di elaborazione prima dell'aggiornamento del TERMINATE cluster. Non è necessario interrompere la flotta di elaborazione o impostare quando: QueueUpdateStrategyTERMINATE

Considerazioni e limitazioni

Questa sezione ha lo scopo di delineare eventuali fattori, vincoli o limitazioni importanti da tenere in considerazione durante il ridimensionamento della capacità del cluster.

Quando si modifica il MinCount parametro di una risorsa di calcolo, possiamo distinguere due diversi scenari, se MaxCount viene mantenuto uguale a MinCount (solo capacità statica) e se MaxCount è maggiore di MinCount (capacità statica e dinamica mista).

La capacità cambia solo con nodi statici

Modifiche di capacità con nodi misti

SeMinCount < MaxCount, aumentando MinCount di una quantità N (supponendo che MaxCount venga mantenuto invariato), il cluster verrà configurato estendendo il numero di nodi statici al nuovo valore di MinCount (old_MinCount + N): <Queue/Name>-st-<ComputeResource/Name>-<old_MinCount + N> e il sistema continuerà a provare ad avviare EC2 istanze Amazon per soddisfare la nuova capacità statica richiesta. Inoltre, per rispettare la MaxCount capacità della risorsa di calcolo, la configurazione del cluster viene aggiornata rimuovendo gli ultimi N nodi dinamici: <Queue/Name>-dy-<ComputeResource/Name>-[<MaxCount - old_MinCount - N>...<MaxCount - old_MinCount>] e il sistema interromperà le istanze Amazon EC2 corrispondenti.

SeMinCount < MaxCount, aumentando MinCount e MaxCount della stessa quantità N, il cluster verrà configurato estendendo il numero di nodi statici al nuovo valore di MinCount (old_MinCount + N): <Queue/Name>-st-<ComputeResource/Name>-<old_MinCount + N> e il sistema continuerà a provare ad avviare EC2 istanze Amazon per soddisfare la nuova capacità statica richiesta. Inoltre, non verrà apportata alcuna modifica al numero di nodi dinamici per rispettare il nuovo

MaxCount value.

SeMinCount < MaxCount, diminuendo la MinCount quantità N (supponendo che MaxCount venga mantenuta invariata), il cluster verrà configurato rimuovendo gli ultimi N nodi statici dei nodi statici <Queue/Name>-st-<ComputeResource/Name>-[<old_MinCount - N>...<old_MinCount> e il sistema chiuderà le istanze Amazon corrispondenti. EC2 Inoltre, per rispettare la MaxCount capacità della risorsa di elaborazione, la configurazione del cluster viene aggiornata estendendo il numero di nodi dinamici per colmare il divario. MaxCount - new_MinCount: <Queue/Name>-dy-<ComputeResource/Name>-[1..<MazCount - new_MinCount>] In questo caso, trattandosi di nodi dinamici, non verranno lanciate nuove EC2 istanze Amazon a meno che lo scheduler non abbia lavori in sospeso sui nuovi nodi.

SeMinCount < MaxCount, in diminuzione MinCount e MaxCount della stessa quantità N, il cluster verrà configurato rimuovendo gli ultimi N nodi statici <Queue/Name>-st-<ComputeResource/Name>-<old_MinCount - N>...<oldMinCount>] e il sistema interromperà le istanze Amazon EC2 corrispondenti.

Inoltre, non verrà apportata alcuna modifica al numero di nodi dinamici per rispettare il nuovo valore. MaxCount

SeMinCount < MaxCount, diminuendo la MaxCount quantità N (supponendo che MinCount venga mantenuta invariata), il cluster verrà configurato rimuovendo gli ultimi N nodi dinamici <Queue/Name>-dy-<ComputeResource/Name>-<old_MaxCount - N...<oldMaxCount>] e il sistema interromperà le EC2 istanze Amazon corrispondenti nel caso in cui fossero in esecuzione. Non è previsto alcun impatto sui nodi statici.

Impatti sui lavori

In tutti i casi in cui i nodi vengono rimossi e EC2 le istanze Amazon terminate, un job sbatch in esecuzione sui nodi rimossi verrà messo nuovamente in coda, a meno che non vi siano altri nodi che soddisfino i requisiti del processo. In quest'ultimo caso il processo avrà esito negativo con status NODE _ FAIL e scomparirà dalla coda; in tal caso, dovrà essere inviato nuovamente manualmente.

Se si prevede di eseguire un aggiornamento per il ridimensionamento del cluster, è possibile impedire l'esecuzione dei lavori nei nodi che verranno rimossi durante l'aggiornamento pianificato. Ciò è possibile impostando i nodi da rimuovere durante la manutenzione. Tieni presente che l'impostazione di un nodo in manutenzione non influirebbe sui lavori che alla fine sono già in esecuzione nel nodo.

Supponiamo che con l'aggiornamento pianificato per il ridimensionamento del cluster si voglia rimuovere il nodoqeueu-st-computeresource-[9-10]. È possibile creare un Slurm prenotazione con il seguente comando

sudo -i scontrol create reservation ReservationName=maint_for_update user=root starttime=now duration=infinite flags=maint,ignore_jobs nodes=qeueu-st-computeresource-[9-10]

Questo creerà un Slurm prenotazione denominata maint_for_update sui nodiqeueu-st-computeresource-[9-10]. Dal momento in cui viene creata la prenotazione, non è possibile eseguire altri lavori nei nodiqeueu-st-computeresource-[9-10]. Tieni presente che la prenotazione non impedirà l'assegnazione finale dei lavori sui nodiqeueu-st-computeresource-[9-10].

Dopo l'aggiornamento del ridimensionamento del cluster, se Slurm la prenotazione è stata impostata solo sui nodi che sono stati rimossi durante l'aggiornamento di ridimensionamento, la prenotazione di manutenzione verrà eliminata automaticamente. Se invece avessi creato un Slurm prenotazione sui nodi che sono ancora presenti dopo l'aggiornamento del ridimensionamento del cluster, potremmo voler rimuovere la prenotazione di manutenzione sui nodi dopo aver eseguito l'aggiornamento di ridimensionamento, utilizzando il seguente comando

sudo -i scontrol delete ReservationName=maint_for_update

Per ulteriori dettagli su Slurm per prenotare, consulta il documento ufficiale di SchedMD qui.

Processo di aggiornamento del cluster in caso di modifiche alla capacità

In caso di modifica della configurazione dello scheduler, durante il processo di aggiornamento del cluster vengono eseguiti i seguenti passaggi:

Per informazioni su Slurm, vedi https://slurm.schedmd.com. Per i download, vedi https://github.com/SchedMD/slurm/tags. Per il codice sorgente, vedi slurm. https://github.com/SchedMD/