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Esecuzione del tuo primo lavoro su AWS ParallelCluster

Questo tutorial ti guida come eseguire il tuo primo lavoro con Hello World su AWS ParallelCluster

Quando si utilizza l'interfaccia a riga di AWS ParallelCluster comando (CLI) o l'API, si pagano solo le AWS risorse create quando si creano o si aggiornano AWS ParallelCluster immagini e cluster. Per ulteriori informazioni, consulta AWS servizi usati da AWS ParallelCluster.

Verifica dell'installazione

Innanzitutto, verifichiamo che AWS ParallelCluster sia installato e configurato correttamente, inclusa Node.js la dipendenza.

$ node --version
v16.8.0
$ pcluster version
{
  "version": "3.16.1"
}

Ciò restituisce la versione in esecuzione di. AWS ParallelCluster

Creazione del primo cluster

Verrà ora creato il tuo primo cluster. Poiché il carico di lavoro per questo tutorial non ha elevati requisiti di prestazioni, possiamo utilizzare la dimensione dell'istanza predefinita di t2.micro. (Per carichi di lavoro di produzione, scegli la dimensione dell’istanza più adatta alle tue esigenze.) Chiamiamo il tuo clusterhello-world.

$ pcluster create-cluster \
    --cluster-name hello-world \
    --cluster-configuration hello-world.yaml

Se l'output fornisce un messaggio sulla configurazione, è necessario eseguire quanto segue per configurare AWS ParallelCluster:

$ pcluster configure --config hello-world.yaml

Se il pcluster create-cluster comando ha esito positivo, viene visualizzato un output simile al seguente:

{
  "cluster": {
    "clusterName": "hello-world",
    "cloudformationStackStatus": "CREATE_IN_PROGRESS",
    "cloudformationStackArn": "arn:aws:cloudformation:xxx:stack/xxx",
    "region": "...",
    "version": "...",
    "clusterStatus": "CREATE_IN_PROGRESS"
  }
}

È possibile monitorare la creazione del cluster utilizzando:

$ pcluster describe-cluster --cluster-name hello-world

I clusterStatus report "CREATE_IN_PROGRESS" durante la creazione del cluster. Le clusterStatus transizioni a "CREATE_COMPLETE" quando il cluster viene creato correttamente. L'output ci fornisce anche la fine publicIpAddress privateIpAddress del nostro nodo principale.

Accedere al nodo principale

Usa il tuo file pem OpenSSH per accedere al tuo nodo principale.

$ pcluster ssh --cluster-name hello-world -i /path/to/keyfile.pem

Dopo aver effettuato l'accesso, esegui il comando sinfo per verificare che i nodi di calcolo siano impostati e configurati.

$ sinfo
PARTITION AVAIL  TIMELIMIT  NODES  STATE NODELIST
queue1*      up   infinite     10  idle~ queue1-dy-queue1t2micro-[1-10]

L'output mostra che abbiamo una coda nel nostro cluster, con un massimo di dieci nodi.

Esecuzione del primo lavoro con Slurm

Creiamo un processo che rimane in sospeso per alcuni secondi e che quindi fornisce in uscita il suo nome host. Crea un file denominato hellojob.sh, con i seguenti contenuti:

#!/bin/bash
sleep 30
echo "Hello World from $(hostname)"

Quindi, invia il processo utilizzando sbatch e verifica che sia in esecuzione.

$ sbatch hellojob.sh
Submitted batch job 2

Puoi ora visualizzare la coda e verificare lo stato del processo. Il provisioning di una nuova istanza Amazon EC2 viene avviato in background. Puoi monitorare lo stato delle istanze del cluster con il comando. sinfo

$ squeue
             JOBID PARTITION     NAME     USER ST       TIME  NODES NODELIST(REASON)
                 2    queue1 hellojob ec2-user CF       3:30      1 queue1-dy-queue1t2micro-1

L'output mostra che il lavoro è stato inviato aqueue1. Attendi 30 secondi per il completamento del processo, quindi esegui nuovamente squeue.

$ squeue
             JOBID PARTITION     NAME     USER ST       TIME  NODES NODELIST(REASON)

Ora che non ci sono processi in coda, puoi verificare l'output nella directory corrente.

$ ls -l
total 8
-rw-rw-r-- 1 ec2-user ec2-user 57 Sep  1 14:25 hellojob.sh
-rw-rw-r-- 1 ec2-user ec2-user 43 Sep  1 14:30 slurm-2.out

Nell'output, vediamo un file out "». Possiamo vedere i risultati del nostro lavoro:

$ cat slurm-2.out
Hello World from queue1-dy-queue1t2micro-1

L'output mostra anche che il processo è stato eseguito correttamente sull'istanza queue1-dy-queue1t2micro-1.

Nel cluster appena creato, solo la home directory è condivisa tra tutti i nodi del cluster.

Per saperne di più sulla creazione e l'utilizzo dei cluster, consultaBest practice.