Doc AWS SDK ExamplesWord リポジトリには、さらに多くの GitHub の例があります。 AWS SDK
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を使用した Amazon Comprehend Medical の例 AWS CLI
次のコード例は、Amazon Comprehend Medical AWS Command Line Interface で を使用してアクションを実行し、一般的なシナリオを実装する方法を示しています。
アクションはより大きなプログラムからのコードの抜粋であり、コンテキスト内で実行する必要があります。アクションは個々のサービス機能を呼び出す方法を示していますが、コンテキスト内のアクションは、関連するシナリオで確認できます。
各例には、完全なソースコードへのリンクが含まれています。ここでは、コンテキストでコードを設定および実行する方法の手順を確認できます。
トピック
アクション
次のコード例は、describe-entities-detection-v2-job
を使用する方法を示しています。
- AWS CLI
-
エンティティ検出ジョブを記述するには
次の
describe-entities-detection-v2-job
例は、非同期エンティティ検出ジョブに関連付けられたプロパティを示しています。aws comprehendmedical describe-entities-detection-v2-job \ --job-id
"ab9887877365fe70299089371c043b96"
出力:
{ "ComprehendMedicalAsyncJobProperties": { "JobId": "ab9887877365fe70299089371c043b96", "JobStatus": "COMPLETED", "SubmitTime": "2020-03-18T21:20:15.614000+00:00", "EndTime": "2020-03-18T21:27:07.350000+00:00", "ExpirationTime": "2020-07-16T21:20:15+00:00", "InputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-input", "S3Key": "" }, "OutputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-output", "S3Key": "867139942017-EntitiesDetection-ab9887877365fe70299089371c043b96/" }, "LanguageCode": "en", "DataAccessRoleArn": "arn:aws:iam::867139942017:role/ComprehendMedicalBatchProcessingRole", "ModelVersion": "DetectEntitiesModelV20190930" } }
詳細については、Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「バッチAPIs」を参照してください。
-
API の詳細については、 AWS CLI コマンドリファレンスのDescribeEntitiesDetectionV2Job
」を参照してください。
-
次の例は、describe-icd10-cm-inference-job
を使用する方法を説明しています。
- AWS CLI
-
ICD-10-CM 推論ジョブを記述するには
次の
describe-icd10-cm-inference-job
例では、指定された job-id を持つリクエストされた推論ジョブのプロパティについて説明します。aws comprehendmedical describe-icd10-cm-inference-job \ --job-id
"5780034166536cdb52ffa3295a1b00a7"
出力:
{ "ComprehendMedicalAsyncJobProperties": { "JobId": "5780034166536cdb52ffa3295a1b00a7", "JobStatus": "COMPLETED", "SubmitTime": "2020-05-18T21:20:15.614000+00:00", "EndTime": "2020-05-18T21:27:07.350000+00:00", "ExpirationTime": "2020-09-16T21:20:15+00:00", "InputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-input", "S3Key": "AKIAIOSFODNN7EXAMPLE" }, "OutputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-output", "S3Key": "AKIAIOSFODNN7EXAMPLE" }, "LanguageCode": "en", "DataAccessRoleArn": "arn:aws:iam::867139942017:role/ComprehendMedicalBatchProcessingRole", "ModelVersion": "0.1.0" } }
詳細については、「Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「Ontology リンクバッチ分析」を参照してください。 Amazon Comprehend
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のDescribeIcd10CmInferenceJob
」を参照してください。
-
次の例は、describe-phi-detection-job
を使用する方法を説明しています。
- AWS CLI
-
PHI 検出ジョブを記述するには
次の
describe-phi-detection-job
例は、非同期保護ヘルス情報 (PHI) 検出ジョブに関連付けられたプロパティを示しています。aws comprehendmedical describe-phi-detection-job \ --job-id
"4750034166536cdb52ffa3295a1b00a3"
出力:
{ "ComprehendMedicalAsyncJobProperties": { "JobId": "4750034166536cdb52ffa3295a1b00a3", "JobStatus": "COMPLETED", "SubmitTime": "2020-03-19T20:38:37.594000+00:00", "EndTime": "2020-03-19T20:45:07.894000+00:00", "ExpirationTime": "2020-07-17T20:38:37+00:00", "InputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-input", "S3Key": "" }, "OutputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-output", "S3Key": "867139942017-PHIDetection-4750034166536cdb52ffa3295a1b00a3/" }, "LanguageCode": "en", "DataAccessRoleArn": "arn:aws:iam::867139942017:role/ComprehendMedicalBatchProcessingRole", "ModelVersion": "PHIModelV20190903" } }
詳細については、Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「バッチAPIs」を参照してください。
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のDescribePhiDetectionJob
」を参照してください。
-
次のコード例は、describe-rx-norm-inference-job
を使用する方法を示しています。
- AWS CLI
-
RxNorm 推論ジョブを記述するには
次の
describe-rx-norm-inference-job
例では、指定された job-id を持つリクエストされた推論ジョブのプロパティについて説明します。aws comprehendmedical describe-rx-norm-inference-job \ --job-id
"eg8199877365fc70299089371c043b96"
出力:
{ "ComprehendMedicalAsyncJobProperties": { "JobId": "g8199877365fc70299089371c043b96", "JobStatus": "COMPLETED", "SubmitTime": "2020-05-18T21:20:15.614000+00:00", "EndTime": "2020-05-18T21:27:07.350000+00:00", "ExpirationTime": "2020-09-16T21:20:15+00:00", "InputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-input", "S3Key": "AKIAIOSFODNN7EXAMPLE" }, "OutputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-output", "S3Key": "AKIAIOSFODNN7EXAMPLE" }, "LanguageCode": "en", "DataAccessRoleArn": "arn:aws:iam::867139942017:role/ComprehendMedicalBatchProcessingRole", "ModelVersion": "0.0.0" } }
詳細については、「Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「Ontology リンクバッチ分析」を参照してください。 Amazon Comprehend
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のDescribeRxNormInferenceJob
」を参照してください。
-
次のコード例は、describe-snomedct-inference-job
を使用する方法を示しています。
- AWS CLI
-
SNOMED CT 推論ジョブを記述するには
次の
describe-snomedct-inference-job
例では、指定された job-id を持つリクエストされた推論ジョブのプロパティについて説明します。aws comprehendmedical describe-snomedct-inference-job \ --job-id
"2630034166536cdb52ffa3295a1b00a7"
出力:
{ "ComprehendMedicalAsyncJobProperties": { "JobId": "2630034166536cdb52ffa3295a1b00a7", "JobStatus": "COMPLETED", "SubmitTime": "2021-12-18T21:20:15.614000+00:00", "EndTime": "2021-12-18T21:27:07.350000+00:00", "ExpirationTime": "2022-05-16T21:20:15+00:00", "InputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-input", "S3Key": "AKIAIOSFODNN7EXAMPLE" }, "OutputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-output", "S3Key": "AKIAIOSFODNN7EXAMPLE" }, "LanguageCode": "en", "DataAccessRoleArn": "arn:aws:iam::867139942017:role/ComprehendMedicalBatchProcessingRole", "ModelVersion": "0.1.0" } }
詳細については、「Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「Ontology リンクバッチ分析」を参照してください。 Amazon Comprehend
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のDescribeSnomedctInferenceJob
」を参照してください。
-
次の例は、detect-entities-v2
を使用する方法を説明しています。
- AWS CLI
-
例 1: テキストからエンティティを直接検出するには
次の
detect-entities-v2
例は、検出されたエンティティを示し、入力テキストから直接タイプに従ってラベル付けします。aws comprehendmedical detect-entities-v2 \ --text
"Sleeping trouble on present dosage of Clonidine. Severe rash on face and leg, slightly itchy."
出力:
{ "Id": 0, "BeginOffset": 38, "EndOffset": 47, "Score": 0.9942955374717712, "Text": "Clonidine", "Category": "MEDICATION", "Type": "GENERIC_NAME", "Traits": [] }
詳細については、Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイドの「Detect Entities Version 2」を参照してください。
例 2: ファイルパスからエンティティを検出するには
次の
detect-entities-v2
例は、検出されたエンティティを示し、ファイルパスのタイプに従ってラベル付けします。aws comprehendmedical detect-entities-v2 \ --text
file://medical_entities.txt
medical_entities.txt
の内容:{ "Sleeping trouble on present dosage of Clonidine. Severe rash on face and leg, slightly itchy." }
出力:
{ "Id": 0, "BeginOffset": 38, "EndOffset": 47, "Score": 0.9942955374717712, "Text": "Clonidine", "Category": "MEDICATION", "Type": "GENERIC_NAME", "Traits": [] }
詳細については、Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイドの「Detect Entities Version 2」を参照してください。
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のDetectEntitiesV2
」を参照してください。
-
次の例は、detect-phi
を使用する方法を説明しています。
- AWS CLI
-
例 1: 保護された医療情報 (PHI) をテキストから直接検出するには
次の
detect-phi
例では、検出された保護されたヘルス情報 (PHI) エンティティを入力テキストから直接表示します。aws comprehendmedical detect-phi \ --text
"Patient Carlos Salazar presented with rash on his upper extremities and dry cough. He lives at 100 Main Street, Anytown, USA where he works from his home as a carpenter."
出力:
{ "Entities": [ { "Id": 0, "BeginOffset": 8, "EndOffset": 21, "Score": 0.9914507269859314, "Text": "Carlos Salazar", "Category": "PROTECTED_HEALTH_INFORMATION", "Type": "NAME", "Traits": [] }, { "Id": 1, "BeginOffset": 94, "EndOffset": 109, "Score": 0.871849775314331, "Text": "100 Main Street, Anytown, USA", "Category": "PROTECTED_HEALTH_INFORMATION", "Type": "ADDRESS", "Traits": [] }, { "Id": 2, "BeginOffset": 145, "EndOffset": 154, "Score": 0.8302185535430908, "Text": "carpenter", "Category": "PROTECTED_HEALTH_INFORMATION", "Type": "PROFESSION", "Traits": [] } ], "ModelVersion": "0.0.0" }
詳細については、Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」のPHIの検出」を参照してください。
例 2: ファイルパスから直接ヘルス情報 (PHI) を保護する方法を検出するには
次の
detect-phi
例は、ファイルパスから検出された保護されたヘルス情報 (PHI) エンティティを示しています。aws comprehendmedical detect-phi \ --text
file://phi.txt
phi.txt
の内容:"Patient Carlos Salazar presented with a rash on his upper extremities and a dry cough. He lives at 100 Main Street, Anytown, USA, where he works from his home as a carpenter."
出力:
{ "Entities": [ { "Id": 0, "BeginOffset": 8, "EndOffset": 21, "Score": 0.9914507269859314, "Text": "Carlos Salazar", "Category": "PROTECTED_HEALTH_INFORMATION", "Type": "NAME", "Traits": [] }, { "Id": 1, "BeginOffset": 94, "EndOffset": 109, "Score": 0.871849775314331, "Text": "100 Main Street, Anytown, USA", "Category": "PROTECTED_HEALTH_INFORMATION", "Type": "ADDRESS", "Traits": [] }, { "Id": 2, "BeginOffset": 145, "EndOffset": 154, "Score": 0.8302185535430908, "Text": "carpenter", "Category": "PROTECTED_HEALTH_INFORMATION", "Type": "PROFESSION", "Traits": [] } ], "ModelVersion": "0.0.0" }
詳細については、Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」のPHIの検出」を参照してください。
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のDetectPhi
」を参照してください。
-
次のコード例は、infer-icd10-cm
を使用する方法を示しています。
- AWS CLI
-
例 1: 病状エンティティを検出し、テキストから直接 ICD-10-CM Ontology にリンクするには
次の
infer-icd10-cm
例では、検出された病状エンティティにラベルを付け、それらのエンティティを国際疾病臨床修飾分類 (ICD-10-CM) の 2019 年版のコードにリンクします。aws comprehendmedical infer-icd10-cm \ --text
"The patient complains of abdominal pain, has a long-standing history of diabetes treated with Micronase daily."
出力:
{ "Entities": [ { "Id": 0, "Text": "abdominal pain", "Category": "MEDICAL_CONDITION", "Type": "DX_NAME", "Score": 0.9475538730621338, "BeginOffset": 28, "EndOffset": 42, "Attributes": [], "Traits": [ { "Name": "SYMPTOM", "Score": 0.6724207401275635 } ], "ICD10CMConcepts": [ { "Description": "Unspecified abdominal pain", "Code": "R10.9", "Score": 0.6904221177101135 }, { "Description": "Epigastric pain", "Code": "R10.13", "Score": 0.1364113688468933 }, { "Description": "Generalized abdominal pain", "Code": "R10.84", "Score": 0.12508003413677216 }, { "Description": "Left lower quadrant pain", "Code": "R10.32", "Score": 0.10063883662223816 }, { "Description": "Lower abdominal pain, unspecified", "Code": "R10.30", "Score": 0.09933677315711975 } ] }, { "Id": 1, "Text": "diabetes", "Category": "MEDICAL_CONDITION", "Type": "DX_NAME", "Score": 0.9899052977561951, "BeginOffset": 75, "EndOffset": 83, "Attributes": [], "Traits": [ { "Name": "DIAGNOSIS", "Score": 0.9258432388305664 } ], "ICD10CMConcepts": [ { "Description": "Type 2 diabetes mellitus without complications", "Code": "E11.9", "Score": 0.7158446311950684 }, { "Description": "Family history of diabetes mellitus", "Code": "Z83.3", "Score": 0.5704703330993652 }, { "Description": "Family history of other endocrine, nutritional and metabolic diseases", "Code": "Z83.49", "Score": 0.19856023788452148 }, { "Description": "Type 1 diabetes mellitus with ketoacidosis without coma", "Code": "E10.10", "Score": 0.13285516202449799 }, { "Description": "Type 2 diabetes mellitus with hyperglycemia", "Code": "E11.65", "Score": 0.0993388369679451 } ] } ], "ModelVersion": "0.1.0" }
詳細については、Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」のICD10-CM を推測する」を参照してください。
例 2: ファイルパスウェイから病状エンティティを検出し、ICD-10-CM オントロジーにリンクするには
次の
infer-icd-10-cm
例では、検出された病状エンティティにラベルを付け、それらのエンティティを国際疾病臨床修飾分類 (ICD-10-CM) の 2019 年版のコードにリンクします。aws comprehendmedical infer-icd10-cm \ --text
file://icd10cm.txt
icd10cm.txt
の内容:{ "The patient complains of abdominal pain, has a long-standing history of diabetes treated with Micronase daily." }
出力:
{ "Entities": [ { "Id": 0, "Text": "abdominal pain", "Category": "MEDICAL_CONDITION", "Type": "DX_NAME", "Score": 0.9475538730621338, "BeginOffset": 28, "EndOffset": 42, "Attributes": [], "Traits": [ { "Name": "SYMPTOM", "Score": 0.6724207401275635 } ], "ICD10CMConcepts": [ { "Description": "Unspecified abdominal pain", "Code": "R10.9", "Score": 0.6904221177101135 }, { "Description": "Epigastric pain", "Code": "R10.13", "Score": 0.1364113688468933 }, { "Description": "Generalized abdominal pain", "Code": "R10.84", "Score": 0.12508003413677216 }, { "Description": "Left lower quadrant pain", "Code": "R10.32", "Score": 0.10063883662223816 }, { "Description": "Lower abdominal pain, unspecified", "Code": "R10.30", "Score": 0.09933677315711975 } ] }, { "Id": 1, "Text": "diabetes", "Category": "MEDICAL_CONDITION", "Type": "DX_NAME", "Score": 0.9899052977561951, "BeginOffset": 75, "EndOffset": 83, "Attributes": [], "Traits": [ { "Name": "DIAGNOSIS", "Score": 0.9258432388305664 } ], "ICD10CMConcepts": [ { "Description": "Type 2 diabetes mellitus without complications", "Code": "E11.9", "Score": 0.7158446311950684 }, { "Description": "Family history of diabetes mellitus", "Code": "Z83.3", "Score": 0.5704703330993652 }, { "Description": "Family history of other endocrine, nutritional and metabolic diseases", "Code": "Z83.49", "Score": 0.19856023788452148 }, { "Description": "Type 1 diabetes mellitus with ketoacidosis without coma", "Code": "E10.10", "Score": 0.13285516202449799 }, { "Description": "Type 2 diabetes mellitus with hyperglycemia", "Code": "E11.65", "Score": 0.0993388369679451 } ] } ], "ModelVersion": "0.1.0" }
詳細については、Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイドの「Infer-ICD10-CM」を参照してください。
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のInferIcd10Cm
」を参照してください。
-
次の例は、infer-rx-norm
を使用する方法を説明しています。
- AWS CLI
-
例 1: 薬剤エンティティを検出し、テキストから直接 RxNorm にリンクするには
次の
infer-rx-norm
例は、検出された薬剤エンティティを表示およびラベル付けし、それらのエンティティを National Library of MedicineCUI データベースの概念識別子 (Rx RxNorm ) にリンクします。aws comprehendmedical infer-rx-norm \ --text
"Patient reports taking Levothyroxine 125 micrograms p.o. once daily, but denies taking Synthroid."
出力:
{ "Entities": [ { "Id": 0, "Text": "Levothyroxine", "Category": "MEDICATION", "Type": "GENERIC_NAME", "Score": 0.9996285438537598, "BeginOffset": 23, "EndOffset": 36, "Attributes": [ { "Type": "DOSAGE", "Score": 0.9892290830612183, "RelationshipScore": 0.9997978806495667, "Id": 1, "BeginOffset": 37, "EndOffset": 51, "Text": "125 micrograms", "Traits": [] }, { "Type": "ROUTE_OR_MODE", "Score": 0.9988924860954285, "RelationshipScore": 0.998291552066803, "Id": 2, "BeginOffset": 52, "EndOffset": 56, "Text": "p.o.", "Traits": [] }, { "Type": "FREQUENCY", "Score": 0.9953463673591614, "RelationshipScore": 0.9999889135360718, "Id": 3, "BeginOffset": 57, "EndOffset": 67, "Text": "once daily", "Traits": [] } ], "Traits": [], "RxNormConcepts": [ { "Description": "Levothyroxine Sodium 0.125 MG Oral Tablet", "Code": "966224", "Score": 0.9912070631980896 }, { "Description": "Levothyroxine Sodium 0.125 MG Oral Capsule", "Code": "966405", "Score": 0.8698278665542603 }, { "Description": "Levothyroxine Sodium 0.125 MG Oral Tablet [Synthroid]", "Code": "966191", "Score": 0.7448257803916931 }, { "Description": "levothyroxine", "Code": "10582", "Score": 0.7050482630729675 }, { "Description": "Levothyroxine Sodium 0.125 MG Oral Tablet [Levoxyl]", "Code": "966190", "Score": 0.6921631693840027 } ] }, { "Id": 4, "Text": "Synthroid", "Category": "MEDICATION", "Type": "BRAND_NAME", "Score": 0.9946461319923401, "BeginOffset": 86, "EndOffset": 95, "Attributes": [], "Traits": [ { "Name": "NEGATION", "Score": 0.5167351961135864 } ], "RxNormConcepts": [ { "Description": "Synthroid", "Code": "224920", "Score": 0.9462039470672607 }, { "Description": "Levothyroxine Sodium 0.088 MG Oral Tablet [Synthroid]", "Code": "966282", "Score": 0.8309829235076904 }, { "Description": "Levothyroxine Sodium 0.125 MG Oral Tablet [Synthroid]", "Code": "966191", "Score": 0.4945160448551178 }, { "Description": "Levothyroxine Sodium 0.05 MG Oral Tablet [Synthroid]", "Code": "966247", "Score": 0.3674522042274475 }, { "Description": "Levothyroxine Sodium 0.025 MG Oral Tablet [Synthroid]", "Code": "966158", "Score": 0.2588822841644287 } ] } ], "ModelVersion": "0.0.0" }
詳細については、Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイドの「Infer RxNorm」を参照してください。
例 2: 薬剤エンティティを検出し、ファイルパスから RxNorm にリンクするには。
次の
infer-rx-norm
例は、検出された薬剤エンティティを表示およびラベル付けし、それらのエンティティを National Library of MedicineCUI データベースの概念識別子 (Rx RxNorm ) にリンクします。aws comprehendmedical infer-rx-norm \ --text
file://rxnorm.txt
rxnorm.txt
の内容:{ "Patient reports taking Levothyroxine 125 micrograms p.o. once daily, but denies taking Synthroid." }
出力:
{ "Entities": [ { "Id": 0, "Text": "Levothyroxine", "Category": "MEDICATION", "Type": "GENERIC_NAME", "Score": 0.9996285438537598, "BeginOffset": 23, "EndOffset": 36, "Attributes": [ { "Type": "DOSAGE", "Score": 0.9892290830612183, "RelationshipScore": 0.9997978806495667, "Id": 1, "BeginOffset": 37, "EndOffset": 51, "Text": "125 micrograms", "Traits": [] }, { "Type": "ROUTE_OR_MODE", "Score": 0.9988924860954285, "RelationshipScore": 0.998291552066803, "Id": 2, "BeginOffset": 52, "EndOffset": 56, "Text": "p.o.", "Traits": [] }, { "Type": "FREQUENCY", "Score": 0.9953463673591614, "RelationshipScore": 0.9999889135360718, "Id": 3, "BeginOffset": 57, "EndOffset": 67, "Text": "once daily", "Traits": [] } ], "Traits": [], "RxNormConcepts": [ { "Description": "Levothyroxine Sodium 0.125 MG Oral Tablet", "Code": "966224", "Score": 0.9912070631980896 }, { "Description": "Levothyroxine Sodium 0.125 MG Oral Capsule", "Code": "966405", "Score": 0.8698278665542603 }, { "Description": "Levothyroxine Sodium 0.125 MG Oral Tablet [Synthroid]", "Code": "966191", "Score": 0.7448257803916931 }, { "Description": "levothyroxine", "Code": "10582", "Score": 0.7050482630729675 }, { "Description": "Levothyroxine Sodium 0.125 MG Oral Tablet [Levoxyl]", "Code": "966190", "Score": 0.6921631693840027 } ] }, { "Id": 4, "Text": "Synthroid", "Category": "MEDICATION", "Type": "BRAND_NAME", "Score": 0.9946461319923401, "BeginOffset": 86, "EndOffset": 95, "Attributes": [], "Traits": [ { "Name": "NEGATION", "Score": 0.5167351961135864 } ], "RxNormConcepts": [ { "Description": "Synthroid", "Code": "224920", "Score": 0.9462039470672607 }, { "Description": "Levothyroxine Sodium 0.088 MG Oral Tablet [Synthroid]", "Code": "966282", "Score": 0.8309829235076904 }, { "Description": "Levothyroxine Sodium 0.125 MG Oral Tablet [Synthroid]", "Code": "966191", "Score": 0.4945160448551178 }, { "Description": "Levothyroxine Sodium 0.05 MG Oral Tablet [Synthroid]", "Code": "966247", "Score": 0.3674522042274475 }, { "Description": "Levothyroxine Sodium 0.025 MG Oral Tablet [Synthroid]", "Code": "966158", "Score": 0.2588822841644287 } ] } ], "ModelVersion": "0.0.0" }
詳細については、Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイドの「Infer RxNorm」を参照してください。
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のInferRxNorm
」を参照してください。
-
次のコード例は、infer-snomedct
を使用する方法を示しています。
- AWS CLI
-
例: テキストから直接エンティティと SNOMED CT Ontology へのリンクを検出するには
次の
infer-snomedct
例は、医療エンティティを検出し、2021-03 バージョンの Systematized Nomenclature of Medicine, Clinical Terms (SNOMED CT) の概念にリンクする方法を示しています。aws comprehendmedical infer-snomedct \ --text
"The patient complains of abdominal pain, has a long-standing history of diabetes treated with Micronase daily."
出力:
{ "Entities": [ { "Id": 3, "BeginOffset": 26, "EndOffset": 40, "Score": 0.9598260521888733, "Text": "abdominal pain", "Category": "MEDICAL_CONDITION", "Type": "DX_NAME", "Traits": [ { "Name": "SYMPTOM", "Score": 0.6819021701812744 } ] }, { "Id": 4, "BeginOffset": 73, "EndOffset": 81, "Score": 0.9905840158462524, "Text": "diabetes", "Category": "MEDICAL_CONDITION", "Type": "DX_NAME", "Traits": [ { "Name": "DIAGNOSIS", "Score": 0.9255214333534241 } ] }, { "Id": 1, "BeginOffset": 95, "EndOffset": 104, "Score": 0.6371926665306091, "Text": "Micronase", "Category": "MEDICATION", "Type": "BRAND_NAME", "Traits": [], "Attributes": [ { "Type": "FREQUENCY", "Score": 0.9761165380477905, "RelationshipScore": 0.9984188079833984, "RelationshipType": "FREQUENCY", "Id": 2, "BeginOffset": 105, "EndOffset": 110, "Text": "daily", "Category": "MEDICATION", "Traits": [] } ] } ], "UnmappedAttributes": [], "ModelVersion": "1.0.0" }
詳細については、Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイドの「InferSNOMEDCT」を参照してください。
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のInferSnomedct
」を参照してください。
-
次の例は、list-entities-detection-v2-jobs
を使用する方法を説明しています。
- AWS CLI
-
エンティティ検出ジョブを一覧表示するには
次の
list-entities-detection-v2-jobs
例では、現在の非同期検出ジョブを一覧表示します。aws comprehendmedical list-entities-detection-v2-jobs
出力:
{ "ComprehendMedicalAsyncJobPropertiesList": [ { "JobId": "ab9887877365fe70299089371c043b96", "JobStatus": "COMPLETED", "SubmitTime": "2020-03-19T20:38:37.594000+00:00", "EndTime": "2020-03-19T20:45:07.894000+00:00", "ExpirationTime": "2020-07-17T20:38:37+00:00", "InputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-input", "S3Key": "" }, "OutputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-output", "S3Key": "867139942017-EntitiesDetection-ab9887877365fe70299089371c043b96/" }, "LanguageCode": "en", "DataAccessRoleArn": "arn:aws:iam::867139942017:role/ComprehendMedicalBatchProcessingRole", "ModelVersion": "DetectEntitiesModelV20190930" } ] }
詳細については、Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「バッチAPIs」を参照してください。
-
API の詳細については、 AWS CLI コマンドリファレンスのListEntitiesDetectionV2Jobs
」を参照してください。
-
次の例は、list-icd10-cm-inference-jobs
を使用する方法を説明しています。
- AWS CLI
-
現在のすべての ICD-10-CM 推論ジョブを一覧表示するには
次の例は、
list-icd10-cm-inference-jobs
オペレーションが現在の非同期 ICD-10-CM バッチ推論ジョブのリストを返す方法を示しています。aws comprehendmedical list-icd10-cm-inference-jobs
出力:
{ "ComprehendMedicalAsyncJobPropertiesList": [ { "JobId": "5780034166536cdb52ffa3295a1b00a7", "JobStatus": "COMPLETED", "SubmitTime": "2020-05-19T20:38:37.594000+00:00", "EndTime": "2020-05-19T20:45:07.894000+00:00", "ExpirationTime": "2020-09-17T20:38:37+00:00", "InputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-input", "S3Key": "AKIAIOSFODNN7EXAMPLE" }, "OutputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-output", "S3Key": "AKIAIOSFODNN7EXAMPLE" }, "LanguageCode": "en", "DataAccessRoleArn": "arn:aws:iam::867139942017:role/ComprehendMedicalBatchProcessingRole", "ModelVersion": "0.1.0" } ] }
詳細については、「Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「Ontology リンクバッチ分析」を参照してください。 Amazon Comprehend
-
API の詳細については、 AWS CLI コマンドリファレンスの ListIcd10CmInferenceJobs
を参照してください。
-
次のコード例は、list-phi-detection-jobs
を使用する方法を示しています。
- AWS CLI
-
保護されたヘルス情報 (PHI) 検出ジョブを一覧表示するには
次の
list-phi-detection-jobs
例では、現在の保護対象ヘルス情報 (PHI) 検出ジョブを一覧表示します。aws comprehendmedical list-phi-detection-jobs
出力:
{ "ComprehendMedicalAsyncJobPropertiesList": [ { "JobId": "4750034166536cdb52ffa3295a1b00a3", "JobStatus": "COMPLETED", "SubmitTime": "2020-03-19T20:38:37.594000+00:00", "EndTime": "2020-03-19T20:45:07.894000+00:00", "ExpirationTime": "2020-07-17T20:38:37+00:00", "InputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-input", "S3Key": "" }, "OutputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-output", "S3Key": "867139942017-PHIDetection-4750034166536cdb52ffa3295a1b00a3/" }, "LanguageCode": "en", "DataAccessRoleArn": "arn:aws:iam::867139942017:role/ComprehendMedicalBatchProcessingRole", "ModelVersion": "PHIModelV20190903" } ] }
詳細については、Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「バッチAPIs」を参照してください。
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のListPhiDetectionJobs
」を参照してください。
-
次の例は、list-rx-norm-inference-jobs
を使用する方法を説明しています。
- AWS CLI
-
現在のすべての Rx-Norm 推論ジョブを一覧表示するには
次の例は、 が現在の非同期 Rx-Norm バッチ推論ジョブのリストを
list-rx-norm-inference-jobs
で返す方法を示しています。aws comprehendmedical list-rx-norm-inference-jobs
出力:
{ "ComprehendMedicalAsyncJobPropertiesList": [ { "JobId": "4980034166536cfb52gga3295a1b00a3", "JobStatus": "COMPLETED", "SubmitTime": "2020-05-19T20:38:37.594000+00:00", "EndTime": "2020-05-19T20:45:07.894000+00:00", "ExpirationTime": "2020-09-17T20:38:37+00:00", "InputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-input", "S3Key": "AKIAIOSFODNN7EXAMPLE" }, "OutputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-output", "S3Key": "AKIAIOSFODNN7EXAMPLE" }, "LanguageCode": "en", "DataAccessRoleArn": "arn:aws:iam::867139942017:role/ComprehendMedicalBatchProcessingRole", "ModelVersion": "0.0.0" } ] }
詳細については、「Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「オントロジーのバッチ分析のリンク」を参照してください。 Amazon Comprehend
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のListRxNormInferenceJobs
」を参照してください。
-
次のコード例は、list-snomedct-inference-jobs
を使用する方法を示しています。
- AWS CLI
-
すべての SNOMED CT 推論ジョブを一覧表示するには
次の例は、
list-snomedct-inference-jobs
オペレーションが現在の非同期 SNOMED CT バッチ推論ジョブのリストを返す方法を示しています。aws comprehendmedical list-snomedct-inference-jobs
出力:
{ "ComprehendMedicalAsyncJobPropertiesList": [ { "JobId": "5780034166536cdb52ffa3295a1b00a7", "JobStatus": "COMPLETED", "SubmitTime": "2020-05-19T20:38:37.594000+00:00", "EndTime": "2020-05-19T20:45:07.894000+00:00", "ExpirationTime": "2020-09-17T20:38:37+00:00", "InputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-input", "S3Key": "AKIAIOSFODNN7EXAMPLE" }, "OutputDataConfig": { "S3Bucket": "comp-med-output", "S3Key": "AKIAIOSFODNN7EXAMPLE" }, "LanguageCode": "en", "DataAccessRoleArn": "arn:aws:iam::867139942017:role/ComprehendMedicalBatchProcessingRole", "ModelVersion": "0.1.0" } ] }
詳細については、「Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「Ontology リンクバッチ分析」を参照してください。 Amazon Comprehend
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のListSnomedctInferenceJobs
」を参照してください。
-
次のコード例は、start-entities-detection-v2-job
を使用する方法を示しています。
- AWS CLI
-
エンティティ検出ジョブを開始するには
次の
start-entities-detection-v2-job
例では、非同期エンティティ検出ジョブを開始します。aws comprehendmedical start-entities-detection-v2-job \ --input-data-config
"S3Bucket=comp-med-input"
\ --output-data-config"S3Bucket=comp-med-output"
\ --data-access-role-arnarn:aws:iam::867139942017:role/ComprehendMedicalBatchProcessingRole
\ --language-codeen
出力:
{ "JobId": "ab9887877365fe70299089371c043b96" }
詳細については、Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「バッチAPIs」を参照してください。
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のStartEntitiesDetectionV2Job
」を参照してください。
-
次の例は、start-icd10-cm-inference-job
を使用する方法を説明しています。
- AWS CLI
-
ICD-10-CM 推論ジョブを開始するには
次の
start-icd10-cm-inference-job
例では、ICD-10-CM 推論バッチ分析ジョブを開始します。aws comprehendmedical start-icd10-cm-inference-job \ --input-data-config
"S3Bucket=comp-med-input"
\ --output-data-config"S3Bucket=comp-med-output"
\ --data-access-role-arnarn:aws:iam::867139942017:role/ComprehendMedicalBatchProcessingRole
\ --language-codeen
出力:
{ "JobId": "ef7289877365fc70299089371c043b96" }
詳細については、「Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「オントロジーのバッチ分析のリンク」を参照してください。 Amazon Comprehend
-
API の詳細については、 AWS CLI コマンドリファレンスの StartIcd10CmInferenceJob
を参照してください。
-
次の例は、start-phi-detection-job
を使用する方法を説明しています。
- AWS CLI
-
PHI 検出ジョブを開始するには
次の
start-phi-detection-job
例では、非同期 PHI エンティティ検出ジョブを開始します。aws comprehendmedical start-phi-detection-job \ --input-data-config
"S3Bucket=comp-med-input"
\ --output-data-config"S3Bucket=comp-med-output"
\ --data-access-role-arnarn:aws:iam::867139942017:role/ComprehendMedicalBatchProcessingRole
\ --language-codeen
出力:
{ "JobId": "ab9887877365fe70299089371c043b96" }
詳細については、Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「バッチAPIs」を参照してください。
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のStartPhiDetectionJob
」を参照してください。
-
次の例は、start-rx-norm-inference-job
を使用する方法を説明しています。
- AWS CLI
-
RxNorm 推論ジョブを開始するには
次の
start-rx-norm-inference-job
例では、 RxNorm 推論バッチ分析ジョブを開始します。aws comprehendmedical start-rx-norm-inference-job \ --input-data-config
"S3Bucket=comp-med-input"
\ --output-data-config"S3Bucket=comp-med-output"
\ --data-access-role-arnarn:aws:iam::867139942017:role/ComprehendMedicalBatchProcessingRole
\ --language-codeen
出力:
{ "JobId": "eg8199877365fc70299089371c043b96" }
詳細については、「Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「オントロジーのバッチ分析のリンク」を参照してください。 Amazon Comprehend
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のStartRxNormInferenceJob
」を参照してください。
-
次の例は、start-snomedct-inference-job
を使用する方法を説明しています。
- AWS CLI
-
SNOMED CT 推論ジョブを開始するには
次の
start-snomedct-inference-job
例では、SNOMED CT 推論バッチ分析ジョブを開始します。aws comprehendmedical start-snomedct-inference-job \ --input-data-config
"S3Bucket=comp-med-input"
\ --output-data-config"S3Bucket=comp-med-output"
\ --data-access-role-arnarn:aws:iam::867139942017:role/ComprehendMedicalBatchProcessingRole
\ --language-codeen
出力:
{ "JobId": "dg7289877365fc70299089371c043b96" }
詳細については、「Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「Ontology リンクバッチ分析」を参照してください。 Amazon Comprehend
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のStartSnomedctInferenceJob
」を参照してください。
-
次のコード例は、stop-entities-detection-v2-job
を使用する方法を示しています。
- AWS CLI
-
エンティティ検出ジョブを停止するには
次の
stop-entities-detection-v2-job
例では、非同期エンティティ検出ジョブを停止しています。aws comprehendmedical stop-entities-detection-v2-job \ --job-id
"ab9887877365fe70299089371c043b96"
出力:
{ "JobId": "ab9887877365fe70299089371c043b96" }
詳細については、Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「バッチAPIs」を参照してください。
-
API の詳細については、 AWS CLI コマンドリファレンスのStopEntitiesDetectionV2Job
」を参照してください。
-
次の例は、stop-icd10-cm-inference-job
を使用する方法を説明しています。
- AWS CLI
-
ICD-10-CM 推論ジョブを停止するには
次の
stop-icd10-cm-inference-job
例では、ICD-10-CM 推論バッチ分析ジョブを停止しています。aws comprehendmedical stop-icd10-cm-inference-job \ --job-id
"4750034166536cdb52ffa3295a1b00a3"
出力:
{ "JobId": "ef7289877365fc70299089371c043b96", }
詳細については、「Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「Ontology リンクバッチ分析」を参照してください。 Amazon Comprehend
-
API の詳細については、 AWS CLI コマンドリファレンスの StopIcd10CmInferenceJob
を参照してください。
-
次の例は、stop-phi-detection-job
を使用する方法を説明しています。
- AWS CLI
-
保護されたヘルス情報 (PHI) 検出ジョブを停止するには
次の
stop-phi-detection-job
例では、非同期保護ヘルス情報 (PHI) 検出ジョブを停止しています。aws comprehendmedical stop-phi-detection-job \ --job-id
"4750034166536cdb52ffa3295a1b00a3"
出力:
{ "JobId": "ab9887877365fe70299089371c043b96" }
詳細については、Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「バッチAPIs」を参照してください。
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のStopPhiDetectionJob
」を参照してください。
-
次のコード例は、stop-rx-norm-inference-job
を使用する方法を示しています。
- AWS CLI
-
RxNorm 推論ジョブを停止するには
次の
stop-rx-norm-inference-job
例では、ICD-10-CM 推論バッチ分析ジョブを停止しています。aws comprehendmedical stop-rx-norm-inference-job \ --job-id
"eg8199877365fc70299089371c043b96"
出力:
{ "JobId": "eg8199877365fc70299089371c043b96", }
詳細については、「Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「オントロジーのバッチ分析のリンク」を参照してください。 Amazon Comprehend
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のStopRxNormInferenceJob
」を参照してください。
-
次の例は、stop-snomedct-inference-job
を使用する方法を説明しています。
- AWS CLI
-
SNOMED CT 推論ジョブを停止するには
次の
stop-snomedct-inference-job
例では、SNOMED CT 推論バッチ分析ジョブを停止しています。aws comprehendmedical stop-snomedct-inference-job \ --job-id
"8750034166436cdb52ffa3295a1b00a1"
出力:
{ "JobId": "8750034166436cdb52ffa3295a1b00a1", }
詳細については、「Amazon Comprehend Medical デベロッパーガイド」の「オントロジーのバッチ分析のリンク」を参照してください。 Amazon Comprehend
-
API の詳細については、AWS CLI 「 コマンドリファレンス」のStopSnomedctInferenceJob
」を参照してください。
-