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PCS AWS でのネットワークファイルシステムの使用
AWS Parallel Computing Service (AWS PCS) コンピューティングノードグループで起動されたノードにネットワークファイルシステムをアタッチして、データとファイルを書き込んでアクセスできる永続的な場所を提供できます。Amazon Elastic File System (Amazon EFS)、Amazon FSx for Lustre、Amazon FSx for NetApp ONTAP、Amazon FSx FSx for OpenZFS、Amazon File Cache など、 AWS のサービスが提供するファイルシステムを使用できます。 https://docs.aws.amazon.com/fsx/latest/FileCacheGuide/what-is.htmlNFS サーバーなどのセルフマネージドファイルシステムを使用することもできます。
このトピックでは、 AWS PCS でネットワークファイルシステムを使用するための考慮事項と例について説明します。
ネットワークファイルシステムを使用する際の考慮事項
さまざまなファイルシステムの実装の詳細は異なりますが、いくつかの一般的な考慮事項があります。
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関連するファイルシステムソフトウェアをインスタンスにインストールする必要があります。例えば、Amazon FSx for Lustre を使用するには、適切なLustreパッケージが存在する必要があります。これは、コンピューティングノードグループ AMI に含めるか、インスタンスの起動時に実行されるスクリプトを使用することで実現できます。
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共有ネットワークファイルシステムとコンピューティングノードグループインスタンスの間にネットワークルートが必要です。
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共有ネットワークファイルシステムとコンピューティングノードグループインスタンスの両方のセキュリティグループルールでは、関連するポートへの接続を許可する必要があります。
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ファイルシステムにアクセスするリソース全体で、一貫したPOSIXユーザーとグループの名前空間を維持する必要があります。そうしないと、PCS クラスターで実行されるジョブやインタラクティブプロセスでアクセス許可エラーが発生する可能性があります。
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ファイルシステムのマウントは、EC2起動テンプレートを使用して行われます。ネットワークファイルシステムのマウント時にエラーやタイムアウトが発生すると、インスタンスがジョブを実行できなくなる可能性があります。これにより、予期しないコストが発生する可能性があります。起動テンプレートのデバッグの詳細については、「」を参照してくださいPCS での Amazon EC2 AWS 起動テンプレートの使用。
ネットワークマウントの例
Amazon EFS、Amazon FSx for Lustre、Amazon FSx for NetApp ONTAP、Amazon FSx for OpenZFS、および Amazon File Cache を使用してファイルシステムを作成できます。以下の関連セクションを展開して、各ネットワークマウントの例を確認してください。
ファイルシステムのセットアップ
Amazon EFS ファイルシステムを作成します。PCS コンピューティングノードグループインスタンスを起動する各アベイラビリティーゾーンにマウントターゲットがあることを確認します。また、各マウントターゲットが、PCS コンピューティングノードグループインスタンスからのインバウンドおよびアウトバウンドアクセスを許可するセキュリティグループに関連付けられていることを確認します。詳細については、Amazon Elastic File System ユーザーガイド」の「ターゲットとセキュリティグループのマウント」を参照してください。
起動テンプレート
ファイルシステムのセットアップから、コンピューティングノードグループに使用する起動テンプレートにセキュリティグループ (複数可) を追加します。
Amazon EFS ファイルシステムをマウントするcloud-config
メカニズムを使用するユーザーデータを含めます。このスクリプトの次の値を独自の詳細に置き換えます。
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– Amazon EFS をマウントする各インスタンスのパスmount-point-directory
-
– EFS ファイルシステムのファイルシステム IDfilesystem-id
MIME-Version: 1.0 Content-Type: multipart/mixed; boundary="==MYBOUNDARY==" --==MYBOUNDARY== Content-Type: text/cloud-config; charset="us-ascii" packages: - amazon-efs-utils runcmd: - mkdir -p /
mount-point-directory
- echo "filesystem-id
:/ /mount-point-directory
efs tls,_netdev" >> /etc/fstab - mount -a -t efs defaults --==MYBOUNDARY==--
ファイルシステムのセットアップ
PCS を使用する VPC AWS に FSx for Lustre ファイルシステムを作成します。ゾーン間転送を最小限に抑えるには、PCS コンピューティングノードグループインスタンスの大部分を起動するのと同じアベイラビリティーゾーンのサブネットに をデプロイします。ファイルシステムが、PCS コンピューティングノードグループインスタンスからのインバウンドおよびアウトバウンドアクセスを許可するセキュリティグループに関連付けられていることを確認します。セキュリティグループの詳細については、「Amazon FSx for Lustre ユーザーガイド」の「Amazon VPC によるファイルシステムのアクセスコントロール」を参照してください。 FSx
起動テンプレート
が FSx for Lustre ファイルシステムをマウントcloud-config
するために使用するユーザーデータを含めます。このスクリプトの次の値を独自の詳細に置き換えます。
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– FSx for Lustre をマウントするインスタンスのパスmount-point-directory
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– FSx for Lustre ファイルシステムのファイルシステム IDfilesystem-id
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– FSx for Lustre ファイルシステムのマウント名mount-name
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– AWS リージョン FSx for Lustre ファイルシステムがデプロイされている (PCS AWS システムと同じである必要があります)region-code
-
(オプション)
– FSx for Lustre でLustreサポートされている の任意のバージョンlatest
MIME-Version: 1.0 Content-Type: multipart/mixed; boundary="==MYBOUNDARY==" --==MYBOUNDARY== Content-Type: text/cloud-config; charset="us-ascii" runcmd: - amazon-linux-extras install -y lustre=
latest
- mkdir -p /mount-point-directory
- mount -t lustrefilesystem-id
.fsx.region-code
.amazonaws.com@tcp:/mount-name
/mount-point-directory
--==MYBOUNDARY==
ファイルシステムのセットアップ
PCS を使用する VPC AWS に Amazon FSx for NetApp ONTAP ファイルシステムを作成します。ゾーン間転送を最小限に抑えるには、PCS AWS コンピューティングノードグループインスタンスの大部分を起動するのと同じアベイラビリティーゾーンのサブネットに をデプロイします。ファイルシステムが、 AWS PCS コンピューティングノードグループインスタンスからのインバウンドおよびアウトバウンドアクセスを許可するセキュリティグループに関連付けられていることを確認します。セキュリティグループの詳細については、FSx for ONTAP ユーザーガイド」の「Amazon VPC によるファイルシステムのアクセスコントロール」を参照してください。
起動テンプレート
が FSx for ONTAP ファイルシステムのルートボリュームをマウントcloud-config
するために使用するユーザーデータを含めます。このスクリプトの次の値を独自の詳細に置き換えます。
-
– FSx for ONTAP ボリュームをマウントするインスタンスのパスmount-point-directory
-
– FSx for ONTAP ファイルシステムの SVM IDsvm-id
-
– FSx for ONTAP ファイルシステムのファイルシステム IDfilesystem-id
-
– AWS リージョン FSx for ONTAP ファイルシステムがデプロイされている (PCS AWS システムと同じである必要があります)region-code
-
– FSx for ONTAP ボリューム名volume-name
MIME-Version: 1.0 Content-Type: multipart/mixed; boundary="==MYBOUNDARY==" --==MYBOUNDARY== Content-Type: text/cloud-config; charset="us-ascii" runcmd: - mkdir -p /
mount-point-directory
- mount -t nfssvm-id
.filesystem-id
.fsx.region-code
.amazonaws.com:/volume-name
/mount-point-directory
--==MYBOUNDARY==
ファイルシステムのセットアップ
PCS を使用する VPC AWS に FSx for OpenZFS ファイルシステムを作成します。ゾーン間転送を最小限に抑えるには、PCS AWS コンピューティングノードグループインスタンスの大部分を起動するのと同じアベイラビリティーゾーンのサブネットに をデプロイします。ファイルシステムが、 AWS PCS コンピューティングノードグループインスタンスからのインバウンドおよびアウトバウンドアクセスを許可するセキュリティグループに関連付けられていることを確認します。セキュリティグループの詳細については、FSx for OpenZFS ユーザーガイド」の「Amazon VPC によるファイルシステムアクセスの管理」を参照してください。
起動テンプレート
が FSx for OpenZFS ファイルシステムのルートボリュームをマウントcloud-config
するために使用するユーザーデータを含めます。このスクリプトの次の値を独自の詳細に置き換えます。
-
– FSx for OpenZFS 共有をマウントするインスタンスのパスmount-point-directory
-
– FSx for OpenZFS ファイルシステムのファイルシステム IDfilesystem-id
-
– AWS リージョン FSx for OpenZFS ファイルシステムがデプロイされている (PCS AWS システムと同じである必要があります)region-code
MIME-Version: 1.0 Content-Type: multipart/mixed; boundary="==MYBOUNDARY==" --==MYBOUNDARY== Content-Type: text/cloud-config; charset="us-ascii" runcmd: - mkdir -p /
mount-point-directory
- mount -t nfs -o noatime,nfsvers=4.2,sync,rsize=1048576,wsize=1048576filesystem-id
.fsx.region-code
.amazonaws.com:/fsx/ /mount-point-directory
--==MYBOUNDARY==
ファイルシステムのセットアップ
PCS を使用する VPC AWS に Amazon ファイルキャッシュを作成します。ゾーン間転送を最小限に抑えるには、PCS コンピューティングノードグループインスタンスの大部分を起動するのと同じアベイラビリティーゾーンのサブネットを選択します。ファイルキャッシュが、PCS インスタンスとファイルキャッシュ間のポート 988 でのインバウンドトラフィックとアウトバウンドトラフィックを許可するセキュリティグループに関連付けられていることを確認します。セキュリティグループの詳細については、「Amazon File Cache ユーザーガイド」の「Amazon VPC によるキャッシュアクセスコントロール」を参照してください。
起動テンプレート
ファイルシステムのセットアップから、コンピューティングノードグループに使用する起動テンプレートにセキュリティグループ (複数可) を追加します。
が Amazon File Cache のマウントcloud-config
に使用するユーザーデータを含めます。このスクリプトの次の値を独自の詳細に置き換えます。
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– FSx for Lustre をマウントするインスタンスのパスmount-point-directory
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– ファイルキャッシュのドメインネームシステム (DNS) 名cache-dns-name
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– ファイルキャッシュのマウント名mount-name
MIME-Version: 1.0 Content-Type: multipart/mixed; boundary="==MYBOUNDARY==" --==MYBOUNDARY== Content-Type: text/cloud-config; charset="us-ascii" runcmd: - amazon-linux-extras install -y lustre=2.12 - mkdir -p /
mount-point-directory
- mount -t lustre -o relatime,flockcache-dns-name
@tcp:/mount-name
/mount-point-directory
--==MYBOUNDARY==