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# HealthOmics 변형 저장소에서 쿼리 실행
<a name="analytics-run-queries"></a>

**중요**  
AWS HealthOmics 변형 저장소 및 주석 저장소는 더 이상 신규 고객에게 공개되지 않습니다. 기존 고객은 정상적으로 서비스를 계속 이용할 수 있습니다. 자세한 내용은 [AWS HealthOmics 변형 저장소 및 주석 저장소 가용성 변경](variant-store-availability-change.md) 단원을 참조하십시오.

Amazon Athena를 사용하여 변형 저장소에서 쿼리를 수행할 수 있습니다. 변형 및 주석 저장소의 게놈 좌표는 제로 기반 반닫힌 반개방 간격으로 표시됩니다.

## Athena 콘솔을 사용하여 간단한 쿼리 실행
<a name="run-queries-athena-simple"></a>

다음 예제에서는 단순 쿼리를 실행하는 방법을 보여줍니다.

1. Athena 쿼리 편집기 열기: [Athena 쿼리 편집기](https://console.aws.amazon.com//athena)

1. **작업 그룹에서** 설정 중에 생성한 작업 그룹을 선택합니다.

1. **데이터 소스**가 **AwsDataCatalog**인지 확인합니다.

1. **데이터베이스**에서 Lake Formation 설정 중에 생성한 데이터베이스 리소스 링크를 선택합니다.

1. 쿼리 1 탭 아래의 **쿼리 편집기**에 다음 쿼리를 복사합니다. **** 

   ```
   SELECT * from omicsvariants limit 10
   ```

1. 그런 다음 **Run**(실행)을 선택하여 쿼리를 실행합니다. 콘솔은 결과 테이블을 **omicsvariants** 테이블의 처음 10개 행으로 채웁니다.

## Athena 콘솔을 사용하여 복잡한 쿼리 실행
<a name="run-queries-athena-complex"></a>

다음 예제에서는 복잡한 쿼리를 실행하는 방법을 보여줍니다. 이 쿼리를 실행하려면 주석 저장소`ClinVar`로 가져옵니다.

**복잡한 쿼리 실행**

1. Athena 쿼리 편집기 열기: [Athena 쿼리 편집기](https://console.aws.amazon.com//athena)

1. **작업 그룹에서** 설정 중에 생성한 작업 그룹을 선택합니다.

1. **데이터 소스**가 **AwsDataCatalog**인지 확인합니다.

1. **데이터베이스**에서 Lake Formation 설정 중에 생성한 데이터베이스 리소스 링크를 선택합니다.

1. 오른쪽 **\$1** 상단의를 선택하여 쿼리 **2**라는 새 쿼리 탭을 생성합니다.

1. 쿼리 2 탭 아래의 **쿼리 편집기**에 다음 쿼리를 복사합니다. **** 

   ```
   SELECT variants.sampleid,
     variants.contigname,
     variants.start,
     variants."end",
     variants.referenceallele,
     variants.alternatealleles,
     variants.attributes AS variant_attributes,
     clinvar.attributes AS clinvar_attributes  
   FROM omicsvariants as variants 
   INNER JOIN omicsannotations as clinvar ON 
     variants.contigname=CONCAT('chr',clinvar.contigname) 
     AND variants.start=clinvar.start 
     AND variants."end"=clinvar."end" 
     AND variants.referenceallele=clinvar.referenceallele 
     AND variants.alternatealleles=clinvar.alternatealleles 
   WHERE clinvar.attributes['CLNSIG']='Likely_pathogenic'
   ```

1. **실행**을 선택하여 쿼리 실행을 시작합니다.