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# Faça uma exibição virtual com AutoDock Vina no Deadline Cloud
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O pacote de tarefas [AutoDockvirtual\_screening\_vina](https://github.com/aws-deadline/deadline-cloud-samples/tree/mainline/job_bundles/virtual_screening_vina) [usa o Vina para rastrear grandes bibliotecas de compostos em relação](https://github.com/ccsb-scripps/AutoDock-Vina) a uma proteína alvo. O pacote divide uma biblioteca composta em partes e as encaixa paralelamente em uma frota de trabalhadores e, em seguida, agrega e classifica os resultados por afinidade de vinculação.

O pipeline executa quatro etapas:

1. **PrepareReceptor**— Converte a proteína PDB para o formato PDBQT com o Open Babel.

1. **SplitLibrary**— Divide a biblioteca de compostos SDF em N partes.

1. **DockCompounds**— Executa N tarefas de encaixe paralelo (uma por bloco). Cada tarefa é idempotente e segura para a preempção de pontos.

1. **ScoreAndRank**— Agrega todos os resultados em partes em um CSV classificado dos principais resultados.

O pacote requer uma frota gerenciada por serviços Linux x86\_64 (recomendado pelo Spot), um ambiente de fila conda com from e Vina. `openbabel` `conda-forge` AutoDock Instale o Vina criando a receita [Crie um pacote AutoDock Vina conda para o Deadline Cloud](examples-conda-autodock-vina.md) conda em seu canal S3 ou instalando o binário por meio de um script de configuração de host de frota.

Defina `CompoundLibrary=chembl` (padrão) para baixar e filtrar automaticamente moléculas semelhantes a medicamentos do ChEMBL ou fornecer seu [próprio arquivo SDF](https://www.ebi.ac.uk/chembl/).

No `job_bundles` diretório, envie o trabalho:

```
deadline bundle submit virtual_screening_vina \
  -p "ReceptorPdb=receptor.pdb" \
  -p "CompoundLibrary=chembl" \
  -p "MaxCompounds=100000" \
  -p "CompoundsPerChunk=100" \
  -p "CenterX=-10.7" \
  -p "CenterY=12.4" \
  -p "CenterZ=68.8"
```

Para obter detalhes sobre a criação do pacote AutoDock Vina conda, consulte[Crie um pacote AutoDock Vina conda para o Deadline Cloud](examples-conda-autodock-vina.md).