Noções básicas sobre as tarefas de importação - AWS HealthImaging

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Noções básicas sobre as tarefas de importação

Depois de criar um armazenamento de dados na AWS HealthImaging, você deve importar seus dados de imagens médicas do seu bucket de entrada do Amazon S3 para o seu armazenamento de dados para criar conjuntos de imagens. Você pode usar os AWS SDKs AWS Management Console AWS CLI,, e para iniciar, descrever e listar trabalhos de importação.

O diagrama a seguir fornece uma visão geral de como HealthImaging importa dados DICOM em um armazenamento de dados e os transforma em conjuntos de imagens. Os resultados do processamento do trabalho de importação são armazenados no bucket de saída do Amazon S3 (outputS3Uri) e os conjuntos de imagens são armazenados no armazenamento de HealthImaging dados da AWS.

Diagrama de arquitetura mostrando como HealthImaging importa dados de imagens médicas DICOM e os transforma em conjuntos de imagens compostos por metadados e molduras de imagem.

Lembre-se dos seguintes pontos ao importar seus arquivos de imagens médicas do Amazon S3 para um armazenamento de dados da HealthImaging AWS:

  • Classes SOP específicas e sintaxes de transferência são suportadas para trabalhos de importação. Para ter mais informações, consulte DICOMapoio.

  • As restrições de comprimento se aplicam a elementos DICOM específicos durante a importação. Para garantir uma importação bem-sucedida, verifique se os seus dados de imagens médicas não excedam as restrições de tamanho máximo. Para obter mais informações, consulte DICOMrestrições de elementos.

  • Uma verificação de dados de píxeis é realizada no início dos trabalhos de importação. Para ter mais informações, consulte Verificação de dados de pixel.

  • Há endpoints, cotas e limites de limitação associados às ações de importação. HealthImaging Para obter mais informações, consulte Endpoints e cotas e Limites de controle de utilização.

  • Para cada tarefa de importação, os resultados do processamento são armazenados no outputS3Uri local. Os resultados do processamento são organizados em um arquivo job-output-manifest.json e pastas SUCCESS e FAILURE.

    nota

    Você pode incluir até 10.000 pastas aninhadas em um único trabalho de importação.

    • O arquivo job-output-manifest.json contém a saída jobSummary e detalhes adicionais sobre os dados processados. O seguinte exemplo de saída mostra um arquivo job-output-manifest.json.

      {
    "jobSummary": {
        "jobId": "09876543210987654321098765432109",
        "datastoreId": "12345678901234567890123456789012",
        "inputS3Uri": "s3://medical-imaging-dicom-input/dicom_input/",
        "outputS3Uri": "s3://medical-imaging-output/job_output/12345678901234567890123456789012-DicomImport-09876543210987654321098765432109/",
        "successOutputS3Uri": "s3://medical-imaging-output/job_output/12345678901234567890123456789012-DicomImport-09876543210987654321098765432109/SUCCESS/",
        "failureOutputS3Uri": "s3://medical-imaging-output/job_output/12345678901234567890123456789012-DicomImport-09876543210987654321098765432109/FAILURE/",
        "numberOfScannedFiles": 5,
        "numberOfImportedFiles": 3,
        "numberOfFilesWithCustomerError": 2,
        "numberOfFilesWithServerError": 0,
        "numberOfGeneratedImageSets": 2,
        "imageSetsSummary": [{
                "imageSetId": "12345612345612345678907890789012",
                "numberOfMatchedSOPInstances": 2
            },
            {
                "imageSetId": "12345612345612345678917891789012",
                "numberOfMatchedSOPInstances": 1
            }
        ]
    }
}

    • A pasta SUCCESS contém o arquivo success.ndjson contendo os resultados de todos os arquivos de imagem que foram importados com sucesso. O seguinte exemplo de saída mostra um arquivo success.ndjson.

      {"inputFile":"dicomInputFolder/1.3.51.5145.5142.20010109.1105620.1.0.1.dcm","importResponse":{"imageSetId":"12345612345612345678907890789012"}}
{"inputFile":"dicomInputFolder/1.3.51.5145.5142.20010109.1105630.1.0.1.dcm","importResponse":{"imageSetId":"12345612345612345678917891789012"}}

    • A pasta FAILURE contém o arquivo failure.ndjson contendo os resultados de todos os arquivos de imagem que não foram importados com êxito. O seguinte exemplo de saída mostra um arquivo failure.ndjson.

      {"inputFile":"dicom_input/invalidDicomFile1.dcm","exception":{"exceptionType":"ValidationException","message":"DICOM attribute TransferSyntaxUID does not exist"}}
{"inputFile":"dicom_input/invalidDicomFile2.dcm","exception":{"exceptionType":"ValidationException","message":"DICOM attributes does not exist"}}

  • Os trabalhos de importação são mantidos na lista de trabalhos por 90 dias e depois arquivados.