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Conceitos básicos do Console de gerenciamento da AWS
Etapa 1: Navegar até o agente de transformação de dados
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Abra o console do AWS HealthLake
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Na página inicial, clique em Começar e escolha Transformar dados.
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No painel de navegação à esquerda, na seção Agente de transformação de dados, escolha Perfis para gerenciar perfis ou Trabalhos para executar conversões.
Etapa 2: criar um perfil de transformação
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Escolha Perfis no painel de navegação à esquerda e clique em Criar perfil.
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Escolha o formato de origem:
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C-CDA: documentos XML clínicos (registros hospitalares, resumos de alta, documentos de continuidade de cuidados).
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CSV: exportações tabulares (extratos de data warehouse, arquivos simples de EHR, dados de sinistros).
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Escolha como inicializar o perfil:
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Para C-CDA: comece pelo Perfil AWS Inicial (um perfil pré-criado com mapeamentos comuns de seção para recurso).
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Para CSV: forneça um caminho do Amazon S3 para uma pasta contendo arquivos CSV representativos. O agente de IA analisa seus arquivos e gera um perfil básico.
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Insira um nome de perfil e uma descrição opcional.
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Escolha Criar.
O perfil é criado no estado de rascunho (versão 0): uma cópia de trabalho mutável que você pode editar livremente.
Etapa 3: personalizar com o agente de IA de transformação de dados (opcional)
Para C-CDA perfis:
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Abra o perfil e vá para a visualização de edição; o painel do agente de IA de transformação de dados aparece à direita.
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Descreva as mudanças na linguagem natural (por exemplo, “Definir o estado padrão para Washington para recursos do paciente”).
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O agente edita os modelos do Velocity.
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Selecione a guia Teste, cole sua amostra C-CDA e clique em Executar teste para visualizar a conversão.
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Repita até que a saída esteja correta.
Para perfis CSV:
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O agente analisa seus arquivos de amostra e propõe um mapeamento YAML: mapeamentos de coluna para FHIR, traduções, relacionamentos e regras de agregação. date/value PK/FK
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Analise cada mapeamento proposto: aceite, rejeite ou refine.
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Peça ajustes em linguagem natural (por exemplo, “Mapear a coluna RACE_CD para uma extensão FHIR”).
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Visualize os resultados da conversão na guia de teste (fonte à esquerda, saída FHIR à direita).
Etapa 4: publicar o perfil
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Quando estiver satisfeito, escolha Publicar. Isso cria uma versão imutável.
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Seu rascunho permanece editável. Os trabalhos em massa sempre usam a versão mais recente publicada.
Para reverter: escolha uma versão anterior e publique-a novamente. Isso cria uma nova versão do snapshot anterior: nada é excluído.
Etapa 5: Executar um trabalho de transformação
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No painel de navegação à esquerda, em Agente de transformação de dados, escolha Trabalhos.
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Escolha Iniciar novo trabalho.
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Preencha os detalhes do Job:
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Nome do trabalho: um nome descritivo (aparece em CloudWatch registros e métricas).
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Descrição: opcional.
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Defina as configurações de transformação:
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Formato da fonte de dados: C-CDA ou CSV.
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Perfil de transformação: escolha um perfil publicado (somente perfis publicados com versão ≥ 1 aparecem).
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Modo de saída:
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Amazon Amazon S3: grave o FHIR convertido em um local do Amazon S3 (conversão autônoma).
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AWS HealthLake: converta e ingira diretamente em um HealthLake armazenamento de dados. Se selecionado, escolha o HealthLake armazenamento de dados de destino (deve estar no estado ATIVO).
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Proveniência: ativada por padrão. Gera recursos de proveniência FHIR rastreando a saída até a fonte. Desative somente se a proveniência não for necessária.
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Detecção de desvio: ativada por padrão. Produz um relatório mostrando elementos de origem não mapeados.
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Configurar dados de origem:
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Local de origem do Amazon S3: a pasta do Amazon S3 contendo seus arquivos de origem (deve incluir um prefixo, não apenas o nome do bucket).
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Função de acesso a dados: a função do IAM HealthLake pressupõe ler seus arquivos de origem e gravar a saída. Consulte Configurar as políticas de confiança e permissões.
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Configurar a configuração de saída (if):
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URI de saída do Amazon S3: onde gravar registros convertidos de saída e trabalho.
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AWS KMS chave: a AWS KMS chave para criptografar a saída em repouso (obrigatório).
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Escolha Criar trabalho.
Etapa 6: analisar os resultados
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A página de detalhes do trabalho mostra o progresso em tempo real: status, arquivos processados (linhas para CSV), recursos FHIR gerados e falhas.
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Ao concluir, navegue até o local de saída do Amazon S3. O serviço cria uma pasta com escopo de trabalho em seu URI de saída usando o ID do trabalho. Dentro dessa pasta:
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converted/: arquivos de saída FHIR NDJSON (um por arquivo de entrada, por exemplo, -record.ndjson). converted/patient
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ERROR/: detalhe do erro para entradas com falha (arquivos JSON com os campos inputFile e errorMessage, por exemplo). ERROR/bad-file.json
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Manifest.json: resumo do trabalho com métricas agregadas (arquivos escaneados, convertidos, com falha, recursos gerados).
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tarefaLevelDriftResult.json: o relatório de desvio agregado da tarefa (se a detecção de desvio estiver ativada).
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driftDetectionPerFileResults/: relatórios de desvio por arquivo para C-CDA trabalhos (se a detecção de desvio estiver ativada), por exemplo, -record_drift. driftDetectionPerFileResults/patient Metrics.json
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