As traduções são geradas por tradução automática. Em caso de conflito entre o conteúdo da tradução e da versão original em inglês, a versão em inglês prevalecerá.

# Executando consultas em lojas de HealthOmics variantes
<a name="analytics-run-queries"></a>

**Importante**  
AWS HealthOmics lojas de variantes e lojas de anotações não estão mais abertas a novos clientes. Os clientes atuais podem continuar usando o serviço normalmente. Para obter mais informações, consulte [AWS HealthOmics alteração na disponibilidade da loja de variantes e da loja de anotações](variant-store-availability-change.md).

Você pode realizar consultas na sua loja de variantes usando o Amazon Athena. Observe que as coordenadas genômicas nos armazenamentos de variantes e anotações são representadas como intervalos semiabertos semifechados com base em zero.

## Execute uma consulta simples usando o console Athena
<a name="run-queries-athena-simple"></a>

O exemplo a seguir mostra como executar uma consulta simples.

1. [Abra o editor Athena Query: editor Athena Query](https://console.aws.amazon.com//athena)

1. Em **Grupo de trabalho**, selecione o grupo de trabalho que você criou durante a configuração.

1. Verifique se a **fonte de dados** é **AwsDataCatalog**.

1. Em **Database**, selecione o link do recurso de banco de dados que você criou durante a configuração do Lake Formation.

1. Copie a consulta a seguir no **Editor** de **consultas na guia Consulta 1**:

   ```
   SELECT * from omicsvariants limit 10
   ```

1. Para executar a consulta, escolha **Executar**. O console preenche a tabela de resultados com as primeiras 10 linhas da **omicsvariants** tabela.

## Execute uma consulta complexa usando o console Athena
<a name="run-queries-athena-complex"></a>

O exemplo a seguir mostra como executar uma consulta complexa. Para executar essa consulta, importe `ClinVar` para o armazenamento de anotações.

**Execute uma consulta complexa**

1. [Abra o editor Athena Query: editor Athena Query](https://console.aws.amazon.com//athena)

1. Em **Grupo de trabalho**, selecione o grupo de trabalho que você criou durante a configuração.

1. Verifique se a **fonte de dados** é **AwsDataCatalog**.

1. Em **Database**, selecione o link do recurso de banco de dados que você criou durante a configuração do Lake Formation.

1. Escolha a opção **\$1** no canto superior direito para criar uma nova guia de **consulta chamada Consulta 2**.

1. Copie a consulta a seguir no **Editor** de **consultas na guia Consulta 2**:

   ```
   SELECT variants.sampleid,
     variants.contigname,
     variants.start,
     variants."end",
     variants.referenceallele,
     variants.alternatealleles,
     variants.attributes AS variant_attributes,
     clinvar.attributes AS clinvar_attributes  
   FROM omicsvariants as variants 
   INNER JOIN omicsannotations as clinvar ON 
     variants.contigname=CONCAT('chr',clinvar.contigname) 
     AND variants.start=clinvar.start 
     AND variants."end"=clinvar."end" 
     AND variants.referenceallele=clinvar.referenceallele 
     AND variants.alternatealleles=clinvar.alternatealleles 
   WHERE clinvar.attributes['CLNSIG']='Likely_pathogenic'
   ```

1. Escolha **Executar** para começar a executar a consulta.