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HealthOmics 固定大小配额 - AWS HealthOmics

本文属于机器翻译版本。若本译文内容与英语原文存在差异,则一律以英文原文为准。

HealthOmics 固定大小配额

除此之外HealthOmics 服务配额,还 HealthOmics 包括具有固定大小的配额。您不能请求提高这些值。

除非另有说明,否则每个配额都列出了每个区域的最大值。

HealthOmics 分析固定大小配额

下表显示了分析配额支持的最大值。这些值不可调整。

Name 说明 最大值 可调节 Yes/No
分析-每个注解存储导入任务的最大文件数 每个注释导入任务的最大文件数。 1 否

HealthOmics 存储固定大小配额

下表显示了存储文件支持的最大值。这些值不可调整。

Name 说明 最大值 可调节 Yes/No
存储-最大 S3 访问资源策略大小 S3 访问资源策略的最大大小 15 KB 否
存储-传播的最大集合级别标签 每个存储区传播到 S3 对象的最大设置级别标签密钥数 5 否
存储-每个激活任务的最大读取集数 每个激活任务的最大读取集数。 20 否
存储-每个导出任务的最大读取集数 每个导出任务的最大读取集数。 100 否
存储-每个导入任务的最大读取集数 每个导入任务的最大读取集数。 100 否
存储-最大参考存储量 参考存储库的最大数量。 1 否
存储-直接上传的最大分段大小 直接上传到序列存储的最大分段大小。 100 MB 否
存储-文件中可直接上传的最大分段数 文件中可直接上传到序列存储的最大分段数。 10000 否
存储-最大参考大小 可以导入到参考存储库的参考文件的最大大小。 15 GB 否
存储-最大读取集源大小 读取集中可导入序列存储的单个源文件的最大大小。 976 GB 否

HealthOmics 工作流程固定大小配额

下表显示了工作流配额支持的最大值。这些值不可调整。

Name 说明 最大大小 可调节 Yes/No
工作流程-最大运行组数 运行组的最大数量。 1000 否
工作流程-最大运行缓存 您可以为一个账户创建的最大运行缓存数量。

一次或多次运行可以共享同一个运行缓存。每个账户 HealthOmics 可以缓存的运行次数没有配额。

1000 否
工作流程-最高工作流程版本 每个工作流程的最大工作流程版本数。 1000 否
工作流程-CPU 实例容器大小 CPU 实例的最大容器镜像大小。 45 GiB 否
工作流程-GPU 实例容器大小 GPU 实例的最大容器镜像大小。 95 GiB 否
GPU 实例/ dev/shm 共享内存 每个 GPU 实例的最大共享内存量。 每个 GPU 8 GB 否
工作流程-运行参数文件 运行参数文件的最大大小。 256,000 字节 否
工作流程-工作流参数模板文件 工作流参数模板文件的最大条目数和最大文件大小。此配额适用于您使用控制台或 API 创建的工作流程。 1,000 个条目,400 KB 否
工作流程-工作流程定义文件大小-API(DefinitionZip 直接上传) 使用 API 操作或带有 DefinitionZip 的 AWS SDK(直接上传)创建工作流程时工作流程定义文件的最大大小。 4.4 兆字节 否
工作流程-工作流程定义文件大小-API(定义 URI S3 上传) 使用 API 操作或带有 DefinitionURI 的软件开发工具包( AWS S3 上传)创建工作流程时工作流定义文件的最大大小。 100 MB 否
工作流程-工作流程定义文件大小-控制台(直接上传) 使用控制台创建工作流程时,您可以直接上传的工作流程定义文件的最大大小。 4.4 兆字节 否
工作流程-工作流程定义文件大小-控制台(从 Amazon S3 上传) 当您使用控制台创建工作流程时,您可以作为从 Amazon S3 上传的工作流程定义文件的最大大小。 100 MB 否
工作流程-存储库大小 外部代码存储库的最大大小。 1 GiB 否
工作流程-存储库单个文件大小 来自外部代码存储库的单个文件的最大大小。 100 MiB 否
工作流程-自述文件大小 自述文件的最大大小。 500 KiB 否
工作流程-每个账户的最大配置 每个账户的最大 VPC 配置数。 10 否
工作流程-每个配置的最大安全组数 每个 VPC 配置的最大安全组数。 5 否
工作流程-每个配置的最大子网数 每个 VPC 配置的最大子网数。 16 否
工作流程-每个可用区的最大子网数 VPC 配置中每个可用区的最大子网数。 1 否
工作流程-每个 VPC 配置的弹性网络接口 每个 VPC 配置的最大弹性网络接口 (ENI) 数量。 5000 否

有关如何减小运行参数文件大小的建议,请参阅管理运行参数大小。

HealthOmics 批量配额

以下配额适用于批量操作。这些值不可调整。

配额 值
每批次的最大运行次数 100000
每个请求的最大内联运行配置 100
最大 S3 配置文件大小 6 GB
StartRunBatch API 吞吐量 1 TPS
GetBatch API 吞吐量 10 TPS
CancelRunBatch API 吞吐量 10 TPS
ListRunsInBatch API 吞吐量 10 TPS

HealthOmics Ready2Run 工作流程固定大小配额

每个 Ready2Run 工作流程都有最大输入文件大小。在下表中,文件大小单位以千兆字节 (GiB) 为单位列出。这些最大文件大小不可调整。

Ready2Run 工作流程名称 最大输入文件大小 (GiB) 可调节 (Yes/No)
AlphaFold 用于 601-1200 残留物 1 否
AlphaFold 最多可处理 600 个残留物 1 否
Bases2Fastq 适用于 2x150 1000 否
Bases2Fastq 适用于 2x300 1000 否
Bases2Fastq 适用于 2x75 500 否
ESMfold 最多可容纳 800 个残留物 1 否
GATK-BP fq2bam 64 否
GATK-BP Germline bam2vcf 用于 30 倍基因组 39 否
GATK-BP 30x 基因组的 Germline fq2vcf 64 否
GATK-BP Somatic WES bam2vcf 86 否
NVIDIA Parabricks BAM2FQ2BAM WGS 最高可达 30 倍 80 否
NVIDIA Parabricks BAM2FQ2BAM WGS 最高可达 50 倍 120 否
NVIDIA Parabricks BAM2FQ2BAM WGS 最高可达 5 倍 20 否
NVIDIA Parabricks FQ2BAM WGS 最高可达 30 倍 71 否
NVIDIA Parabricks FQ2BAM WGS 最高可达 50 倍 137 否
NVIDIA Parabricks FQ2BAM WGS 最高可达 5 倍 13 否
NVIDIA Parabricks Germline DeepVariant WGS 最高可达 30 倍 71 否
NVIDIA Parabricks Germline DeepVariant WGS 最高可达 50 倍 137 否
NVIDIA Parabricks Germline DeepVariant WGS 最高可达 5 倍 12 否
NVIDIA Parabricks Germline HaplotypeCaller WGS 最高可达 30 倍 71 否
NVIDIA Parabricks Germline HaplotypeCaller WGS 最高可达 50 倍 137 否
NVIDIA Parabricks Germline HaplotypeCaller WGS 最高可达 5 倍 13 否
NVIDIA Parabricks Somatic Mutect2 WGS 最高可达 50 倍 196 否
使用 KallistobusTools 的 scrnaSeq 119 否
scrnaSeq 含三文鱼 Alevin-fry 119 否
使用 StarSolo 的 scrnaSeq 119 否
Sentieon Germline BAM WES 最高可达 300 倍 9 否
Sentieon Germline BAM WGS 最高可达 32 倍 18 否
Sentieon Germline FASTQ WES 最高可达 100 倍 5 否
Sentieon Germline FASTQ WES 最高可达 300 倍 26 否
Sentieon Germline FASTQ WGS 最高可达 32 倍 51 否
安大略省的 Sentieon LongRead 25 否
Sentieon for LongRead PacBio HiFi 58 否
Sentieon Somatic WES 50 不可以
Sentieon Somatic WGS 113 否
Ultima Genomics DeepVariant 最高可达 40 倍 91 否