配置 AWS ParallelCluster

安装之后 AWS ParallelCluster，完成以下配置步骤。

确认你的 AWS 账户的角色包含运行所需的权限pclusterCLI。有关更多信息，请参阅 AWS ParallelCluster 实例和用户策略示例。

设置你的 AWS 证书。有关更多信息，请参阅配置 AWS CLI中的 AWS CLI 用户指南。


$ aws configure
  AWS Access Key ID [None]: AKIAIOSFODNN7EXAMPLE
AWS Secret Access Key [None]: wJalrXUtnFEMI/K7MDENG/bPxRfiCYEXAMPLEKEY
Default AWS 区域 name [us-east-1]: us-east-1
Default output format [None]:

这些区域有： AWS 区域启动集群的位置必须至少有一个 Amazon EC2 密钥对。有关更多信息，请参阅《亚马逊EC2用户指南》中的亚马逊EC2密钥对。


$ pcluster configure

该配置向导会提示您输入所需的所有信息以创建集群。使用时序列的细节会有所不同 AWS Batch 作为调度器与使用相比 Slurm。有关集群配置的更多信息，请参阅配置。

注意

从版本 2.11.5 开始， AWS ParallelCluster 不支持使用 SGE 或者 Torque 调度器。你可以继续在 2.11.4 及之前的版本中使用它们，但它们没有资格获得 future 的更新或疑难解答支持 AWS 服务和 AWS Support 团队。

Slurm

从有效列表中 AWS 区域标识符，选择 AWS 区域你想让你的集群运行在哪里。

注意

的名单 AWS 区域显示的基于您账户的分区，仅包括 AWS 区域已为您的账户启用。有关启用的更多信息 AWS 区域对于您的账户，请参阅管理 AWS 区域中的 AWS 一般参考。显示的示例来自 AWS 全局分区。如果您的账户位于 AWS GovCloud (US) 分区，仅限 AWS 区域在该分区中列出（gov-us-east-1和gov-us-west-1）。同样，如果您的账户位于 AWS 仅显示了cn-north-1和的cn-northwest-1中国分区。如需查看完整列表 AWS 区域由 AWS ParallelCluster，请参阅支持的区域。


Allowed values for the AWS 区域 ID:
1. af-south-1
2. ap-east-1
3. ap-northeast-1
4. ap-northeast-2
5. ap-south-1
6. ap-southeast-1
7. ap-southeast-2
8. ca-central-1
9. eu-central-1
10. eu-north-1
11. eu-south-1
12. eu-west-1
13. eu-west-2
14. eu-west-3
15. me-south-1
16. sa-east-1
17. us-east-1
18. us-east-2
19. us-west-1
20. us-west-2
AWS 区域 ID [ap-northeast-1]:

选择要用于集群的计划程序。


Allowed values for Scheduler:
1. slurm
2. awsbatch
Scheduler [slurm]:

选择操作系统。


Allowed values for Operating System:
1. alinux2
2. centos7
3. ubuntu1804
4. ubuntu2004
Operating System [alinux2]:

注意

中添加alinux2了对 Support 的支持 AWS ParallelCluster 版本 2.6.0。

输入计算节点集群的最小和最大大小。这是用实例数来衡量的。


Minimum cluster size (instances) [0]:
Maximum cluster size (instances) [10]:

输入头节点和计算节点的实例类型。对于实例类型，您的账户实例限制足够大，足以满足您的要求。有关更多信息，请参阅 Amazon EC2 用户指南中的按需实例限制。


Master instance type [t2.micro]: 
Compute instance type [t2.micro]:

密钥对是从选定的 Amazon EC2 注册的密钥对中选择的 AWS 区域.


Allowed values for EC2 Key Pair Name:
1. prod-uswest1-key
2. test-uswest1-key
EC2 Key Pair Name [prod-uswest1-key]:

完成前面的步骤后，决定是使用现有VPC还是出租 AWS ParallelCluster VPC为你创建一个。如果你没有正确配置VPC， AWS ParallelCluster 可以创建一个新的。它将使用同一公有子网中的头节点和计算节点，或者仅使用公有子网中的头节点，所有节点都在私有子网中。有可能达到你的数量VPCs上限 AWS 区域。每个的默认限制VPCs为五个 AWS 区域。有关此限制以及如何申请提高限制的更多信息，请参阅 Amazon VPC 用户指南中的VPC和子网。

如果你让 AWS ParallelCluster 创建VPC，您必须决定是否所有节点都应位于公有子网中。

重要

VPCs由... 创建 AWS ParallelCluster 默认情况下不要启用VPC流日志。VPC使用流日志，您可以捕获有关进出您的网络接口的 IP 流量的信息VPCs。有关更多信息，请参阅 Amazon VPC 用户指南中的VPC流日志。

注意

如果你愿意1. Master in a public subnet and compute fleet in a private subnet， AWS ParallelCluster 创建的NAT网关会产生额外费用，即使您指定了免费套餐资源也是如此。


Automate VPC creation? (y/n) [n]: y
Allowed values for Network Configuration:
1. Master in a public subnet and compute fleet in a private subnet
2. Master and compute fleet in the same public subnet
Network Configuration [Master in a public subnet and compute fleet in a private subnet]: 1
Beginning VPC creation. Please do not leave the terminal until the creation is finalized

如果不创建新的VPC，则必须选择现有的VPC。

如果你选择拥有 AWS ParallelCluster 创建VPC，记下VPC身份证这样你就可以使用 AWS CLI 稍后再将其删除。


Automate VPC creation? (y/n) [n]: n
Allowed values for VPC ID:
  #  id                     name                                 number_of_subnets
---  ---------------------  ---------------------------------  -------------------
  1  vpc-0b4ad9c4678d3c7ad  ParallelClusterVPC-20200118031893                    2
  2  vpc-0e87c753286f37eef  ParallelClusterVPC-20191118233938                    5
VPC ID [vpc-0b4ad9c4678d3c7ad]: 1

选择之后VPC，您需要决定是使用现有子网还是创建新子网。


Automate Subnet creation? (y/n) [y]: y


Creating CloudFormation stack...
Do not leave the terminal until the process has finished

AWS Batch

从有效列表中 AWS 区域标识符，选择 AWS 区域你想让你的集群运行在哪里。


Allowed values for AWS 区域 ID:
1. ap-northeast-1
2. ap-northeast-2
3. ap-south-1
4. ap-southeast-1
5. ap-southeast-2
6. ca-central-1
7. eu-central-1
8. eu-north-1
9. eu-west-1
10. eu-west-2
11. eu-west-3
12. sa-east-1
13. us-east-1
14. us-east-2
15. us-west-1
16. us-west-2
AWS 区域 ID [ap-northeast-1]:

选择要用于集群的计划程序。


Allowed values for Scheduler:
1. slurm
2. awsbatch
Scheduler [awsbatch]:

当选择 awsbatch 作为计划程序时，alinux2 将用作操作系统。

输入计算节点集群的最小和最大大小。这是用来衡量的vCPUs。


Minimum cluster size (vcpus) [0]:
Maximum cluster size (vcpus) [10]:

输入头节点实例类型。使用 awsbatch 调度器时，计算节点使用的实例类型为 optimal。


Master instance type [t2.micro]:

Amazon EC2 密钥对是从选定的 Amazon EC2 注册的密钥对中选择的 AWS 区域.


Allowed values for EC2 Key Pair Name:
1. prod-uswest1-key
2. test-uswest1-key
EC2 Key Pair Name [prod-uswest1-key]:

决定是使用现有VPCs还是出租 AWS ParallelCluster VPCs为你创造。如果你没有正确配置VPC， AWS ParallelCluster 可以创建一个新的。它将使用同一公有子网中的头节点和计算节点，或者仅使用公有子网中的头节点，所有节点都在私有子网中。有可能达到你的数量VPCs上限 AWS 区域。默认数字VPCs为五。有关此限制以及如何申请提高限制的更多信息，请参阅 Amazon VPC 用户指南中的VPC和子网。

重要

如果你让 AWS ParallelCluster 创建VPC，决定是否所有节点都应位于公有子网中。

注意

如果你愿意1. Master in a public subnet and compute fleet in a private subnet， AWS ParallelCluster 创建的NAT网关会产生额外费用，即使您指定了免费套餐资源也是如此。


Automate VPC creation? (y/n) [n]: y
Allowed values for Network Configuration:
1. Master in a public subnet and compute fleet in a private subnet
2. Master and compute fleet in the same public subnet
Network Configuration [Master in a public subnet and compute fleet in a private subnet]: 1
Beginning VPC creation. Please do not leave the terminal until the creation is finalized

如果不创建新的VPC，则必须选择现有的VPC。

如果你选择拥有 AWS ParallelCluster 创建VPC，记下VPC身份证这样你就可以使用 AWS CLI 稍后再将其删除。


Automate VPC creation? (y/n) [n]: n
Allowed values for VPC ID:
  #  id                     name                                 number_of_subnets
---  ---------------------  ---------------------------------  -------------------
  1  vpc-0b4ad9c4678d3c7ad  ParallelClusterVPC-20200118031893                    2
  2  vpc-0e87c753286f37eef  ParallelClusterVPC-20191118233938                    5
VPC ID [vpc-0b4ad9c4678d3c7ad]: 1

选择VPC完毕后，决定是使用现有子网还是创建新子网。


Automate Subnet creation? (y/n) [y]: y


Creating CloudFormation stack...
Do not leave the terminal until the process has finished

完成上述步骤后，一个简单的集群将启动到VPC。VPC使用支持公有 IP 地址的现有子网。该子网的路由表为 0.0.0.0/0 => igw-xxxxxx。请注意以下条件：

VPC必备DNS Resolution = yes和DNS Hostnames = yes。
还VPC应该有正确的DHCPdomain-name选项 AWS 区域。默认DHCP选项集已经指定了所需的 AmazonProvidedDNS。如果指定多个域名服务器，请参阅《Amazon VPC 用户指南》中的DHCP选项集。使用私有子网时，请使用NAT网关或内部代理为计算节点启用 Web 访问。有关更多信息，请参阅网络配置。

但所有设置都包含有效值时，您可以通过运行创建命令来启动集群：


$ pcluster create mycluster

集群达到 “CREATE_COMPLETE” 状态后，您可以使用普通的SSH客户端设置连接到该集群。有关连接亚马逊EC2实例的更多信息，请参阅亚马逊EC2用户指南中的EC2用户指南。

要删除该集群，请运行以下命令。


$ pcluster delete --region us-east-1 mycluster

要删除中的网络资源VPC，您可以删除 CloudFormation 网络堆栈。堆栈名称以” 开头parallelclusternetworking-“并以" YYYYMMDDHHMMSS "格式包含创建时间。您可以使用 list-stacks 命令列出堆栈。


$ aws --region us-east-1 cloudformation list-stacks \
   --stack-status-filter "CREATE_COMPLETE" \
   --query "StackSummaries[].StackName" | \
   grep -e "parallelclusternetworking-"
    "parallelclusternetworking-pubpriv-20191029205804"

可以使用 delete-stack 命令删除堆栈。


$ aws --region us-east-1 cloudformation delete-stack \
   --stack-name parallelclusternetworking-pubpriv-20191029205804

为您pcluster configure创建VPC的不是在 CloudFormation 网络堆栈中创建的。你可以在控制台中VPC手动将其删除，也可以使用 AWS CLI.


$ aws --region us-east-1 ec2 delete-vpc --vpc-id vpc-0b4ad9c4678d3c7ad

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