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HealthOmics 工作流程定義中的任務加速器

在工作流程定義中，您可以選擇為任務指定 GPU 加速器規格。HealthOmics 支援下列加速器規格值，以及支援的執行個體類型：

如果您指定支援多個執行個體類型的加速器類型，HealthOmics 會根據可用容量選取執行個體類型。如果兩種執行個體類型都可用，HealthOmics 會優先考慮成本較低的執行個體。例外情況是 nvidia-t4-a10g-l4 任務加速器，其會提供最新一代執行個體的偏好設定。

如需執行個體類型的詳細資訊，請參閱 加速運算執行個體。

在下列範例中，工作流程定義指定 nvidia-l4為加速器：

WDL

task my_task {
 runtime {
    ...
    acceleratorCount: 1
    acceleratorType: "nvidia-l4"
 }
 ...
}          

NextFlow

process my_task {
 ...
 accelerator 1, type: "nvidia-l4"
 ...
}          

CWL

cwlVersion: v1.2
class: CommandLineTool
requirements:
  ...
  cwltool:CUDARequirement:
      cudaDeviceCountMin: 1
      cudaComputeCapability: "nvidia-l4"
      cudaVersionMin: "1.0"
          

進階資源組態

您也可以使用 omicsResourceFallbackOrder指令設定任務，以您偏好的優先順序保留多個加速器。此指令目前僅適用於 WDL。HealthOmics 會依您定義的順序嘗試每個加速器設定檔，直到一個成功為止，包括選用的最終 CPU 設定檔。

這在下列案例中非常有用：

如需 的完整詳細資訊omicsResourceFallbackOrder，包括每個設定檔的欄位參考、驗證規則和完整的 WDL 範例，請參閱 進階資源組態。