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Rechen- und Speicheranforderungen für HealthOmics Aufgaben
HealthOmics führt Ihre privaten Workflow-Aufgaben in einer Omics-Instanz aus. HealthOmics bietet eine Vielzahl von Instanztypen für verschiedene Aufgabentypen. Jeder Instanztyp hat eine feste Speicher- und vCPU-Konfiguration (und eine feste GPU-Konfiguration für Instanztypen mit beschleunigter Datenverarbeitung). Die Kosten für die Verwendung einer Omics-Instanz variieren je nach Instanztyp. Einzelheiten finden Sie auf der Seite mit den
Für Aufgaben in einem Workflow geben Sie den erforderlichen Arbeitsspeicher und die vCPUs in der Workflow-Definitionsdatei an. Wenn eine Workflow-Aufgabe ausgeführt wird, wird die kleinste HealthOmics Omics-Instanz zugewiesen, die den angeforderten Speicher und die vCPUs beherbergt. Wenn eine Aufgabe beispielsweise 64 GiB Arbeitsspeicher und 8 vCPUs benötigt, wählt aus. HealthOmics omics.r.2xlarge
Wir empfehlen Ihnen, die Instance-Typen zu überprüfen und die angeforderten vCPUs und die Speichergröße so einzustellen, dass sie der Instance entsprechen, die Ihren Anforderungen am besten entspricht. Der Aufgabencontainer verwendet die Anzahl der vCPUs und die Speichergröße, die Sie in Ihrer Workflow-Definitionsdatei angeben, auch wenn der Instanztyp über zusätzliche vCPUs und Arbeitsspeicher verfügt.
Die folgende Liste enthält zusätzliche Informationen zu vCPU und Speicherzuweisung:
Bei der Zuweisung von Container-Ressourcen handelt es sich um feste Grenzwerte. Wenn einer Aufgabe der Arbeitsspeicher ausgeht oder versucht wird, zusätzliche vCPUs zu verwenden, generiert die Aufgabe ein Fehlerprotokoll und wird beendet.
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Wenn Sie keine Rechen- oder Speicheranforderungen angeben, HealthOmics wählt eine Konfiguration mit 1 vCPU omics.c.large und 1 GiB Arbeitsspeicher aus und verwendet diese standardmäßig.
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Die Mindestkonfiguration, die Sie anfordern können, ist 1 vCPU und 1 GiB Arbeitsspeicher.
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Wenn Sie vCPUs, Arbeitsspeicher oder GPUs angeben, die die unterstützten Instanztypen überschreiten, wird eine Fehlermeldung ausgegeben und der Workflow HealthOmics schlägt die Validierungen fehl
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Wenn Sie Brucheinheiten angeben, wird auf die nächste Ganzzahl aufgerundet HealthOmics .
HealthOmics reserviert eine kleine Speichermenge (5%) für Verwaltungs- und Protokollierungsagenten, sodass der Anwendung in der Aufgabe möglicherweise nicht immer der gesamte Speicherzuweisung zur Verfügung steht.
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HealthOmics passt die Instanztypen an die von Ihnen angegebenen Rechen- und Speicheranforderungen an und verwendet möglicherweise eine Mischung aus Hardwaregenerationen. Aus diesem Grund kann es für dieselbe Aufgabe zu geringfügigen Abweichungen bei den Aufgabenlaufzeiten kommen.
Diese Themen enthalten Einzelheiten zu den HealthOmics unterstützten Instanztypen.
Themen
Anmerkung
Erhöhen Sie bei Standard-, Rechen- und speicheroptimierten Instances die Instance-Bandbreitengröße, wenn die Instance einen höheren Durchsatz benötigt. Bei Amazon EC2-Instances mit weniger als 16 vCPUs (Größe 4xl und kleiner) kann es zu Durchsatzsteigerungen kommen. Weitere Informationen zum Durchsatz von Amazon EC2-Instances finden Sie unter Verfügbare Amazon EC2-Instance-Bandbreite.
Standard-Instance-Typen
Bei Standard-Instanztypen zielen die Konfigurationen auf ein ausgewogenes Verhältnis von Rechenleistung und Arbeitsspeicher ab.
HealthOmics unterstützt die 32xlarge- und 48xlarge-Instances in den folgenden Regionen: USA West (Oregon), USA Ost (Nord-Virginia), Asien-Pazifik (Seoul), Asien-Pazifik (Tokio) und USA Ost (Ohio).
| Instance | Anzahl der vCPUs | Arbeitsspeicher |
|---|---|---|
| omics.m.large | 2 | 8 GiB |
| omics.m.xlarge | 4 | 16 GiB |
| omics.m.2xlarge | 8 | 32 GiB |
| omics.m.4xlarge | 16 | 64 GiB |
| omics.m.8xlarge | 32 | 128 GiB |
| omics.m.12xlarge | 48 | 192 GiB |
| omics.m.16xlarge | 64 | 256 GiB |
| omics.m.24xlarge | 96 | 384 GiB |
| omics.m.32xlarge | 128 | 512 GiB |
| omics.m.48xlarge | 192 | 768 GiB |
Compute-optimized Instanzen
Bei rechenoptimierten Instanztypen verfügen die Konfigurationen über mehr Rechenleistung und weniger Arbeitsspeicher.
HealthOmics unterstützt die 32xlarge- und 48xlarge-Instances in den folgenden Regionen: USA West (Oregon), USA Ost (Nord-Virginia), Asien-Pazifik (Seoul), Asien-Pazifik (Tokio) und USA Ost (Ohio).
| Instance | Anzahl der vCPUs | Arbeitsspeicher |
|---|---|---|
| omics.c.large | 2 | 4 GiB |
| omics.c.xlarge | 4 | 8 GiB |
| omics.c.2xlarge | 8 | 16 GiB |
| omics.c.4xlarge | 16 | 32 GiB |
| omics.c.8xlarge | 32 | 64 GiB |
| omics.c.12xlarge | 48 | 96 GiB |
| Omics.c.16x groß | 64 | 128 GiB |
| omics.c.24xlarge | 96 | 192 GiB |
| omics.c.32xlarge | 128 | 256 GiB |
| omics.c.48xlarge | 192 | 384 GiB |
Memory-optimized Instanzen
Bei speicheroptimierten Instanztypen haben die Konfigurationen weniger Rechenleistung und mehr Speicher.
HealthOmics unterstützt die 32xlarge- und 48xlarge-Instances in den folgenden Regionen: USA West (Oregon), USA Ost (Nord-Virginia), Asien-Pazifik (Seoul), Asien-Pazifik (Tokio) und USA Ost (Ohio).
| Instance | Anzahl der vCPUs | Arbeitsspeicher |
|---|---|---|
| omics.r.large | 2 | 16 GiB |
| omics.r.xlarge | 4 | 32 GiB |
| omics.r.2xgroß | 8 | 64 GiB |
| omics.r.4x groß | 16 | 128 GiB |
| omics.r.8 x groß | 32 | 256 GiB |
| omics.r. 12 x groß | 48 | 384 GiB |
| omics.r. 16x groß | 64 | 512 GiB |
| omics.r. 24x groß | 96 | 768 GiB |
| omics.r. 32 x groß | 128 | 1024 GiB |
| omics.r. 48x groß | 192 | 1536 GiB |
Accelerated-computing Instanzen
Sie können optional GPU-Ressourcen für jede Aufgabe in einem Workflow angeben, sodass der Aufgabe eine HealthOmics Instanz für beschleunigtes Rechnen zugewiesen wird. Informationen zum Angeben der GPU-Informationen in der Workflow-Definitionsdatei finden Sie unter. Aufgabenbeschleuniger in einer Workflow-Definition HealthOmics
Wenn Sie einen Task Accelerator angeben, der mehrere Instanztypen unterstützt, HealthOmics wählen Sie den Instanztyp je nach Verfügbarkeit aus. Wenn mehr als ein Instanztyp verfügbar ist, wird HealthOmics der kostengünstigeren Instanz der Vorzug gegeben. Die Ausnahme bildet der nvidia-t4-a10g-l4 Task Accelerator, der der in Ihrer Region verfügbaren Instance der neuesten Generation den Vorzug gibt.
G4-Instances werden in der Region Israel (Tel Aviv) nicht unterstützt. G5-Instances werden in der Region Asien-Pazifik (Singapur) nicht unterstützt.
G6- und G6e-Instance-Typen
HealthOmics unterstützt die folgenden G6-Instance-Konfigurationen für beschleunigtes Rechnen. Alle omics.g6-Instanzen verwenden Nvidia L4-GPUs.
HealthOmics unterstützt die G6- und G6e-Instances in diesen Regionen: USA West (Oregon), USA Ost (Nord-Virginia), Asien-Pazifik (Seoul), Asien-Pazifik (Tokio) und USA Ost (Ohio).
| Instance | Anzahl der vCPUs | Arbeitsspeicher | Anzahl der GPUs | GPU-Arbeitsspeicher |
|---|---|---|---|---|
| omics.g6.xlarge | 4 | 16 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g6.2xlarge | 8 | 32 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g6.4xgroß | 16 | 64 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g6.8xlarge | 32 | 128 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g6.12xlarge | 48 | 192 GiB | 4 | 96 GiB |
| omics.g 6, 16 x groß | 64 | 256 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g6.24xlarge | 96 | 384 GiB | 4 | 96 GiB |
Alle omics.g6e-Instanzen verwenden Nvidia L40s-GPUs.
| Instance | Anzahl der vCPUs | Arbeitsspeicher | Anzahl der GPUs | GPU-Arbeitsspeicher |
|---|---|---|---|---|
| omics.g6e.xlarge | 4 | 32 GiB | 1 | 48 GiB |
| omics.g6e.2xlarge | 8 | 64 GiB | 1 | 48 GiB |
| omics.g6e.4xlarge | 16 | 128 GiB | 1 | 48 GiB |
| omics.g6e.8xlarge | 32 | 256 GiB | 1 | 48 GiB |
| omics.g6e.12xlarge | 48 | 384 GiB | 4 | 192 GiB |
| omics.g6e.16xlarge | 64 | 512 GiB | 1 | 48 GiB |
| omics.g6e.24xlarge | 96 | 768 GiB | 4 | 192 GiB |
G4- und G5-Instanzen
HealthOmics unterstützt die folgenden G4- und G5-Instance-Konfigurationen für beschleunigtes Rechnen.
Alle omics.g5-Instanzen verwenden Nvidia Tesla A10G-GPUs.
| Instance | Anzahl der vCPUs | Arbeitsspeicher | Anzahl der GPUs | GPU-Arbeitsspeicher |
|---|---|---|---|---|
| omics.g5.xlarge | 4 | 16 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g5.2xlarge | 8 | 32 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g5.4xgroß | 16 | 64 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g5.8xlarge | 32 | 128 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g5.12xlarge | 48 | 192 GiB | 4 | 96 GiB |
| omics.g 5.16x groß | 64 | 256 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g5.24xlarge | 96 | 384 GiB | 4 | 96 GiB |
Alle omics.g4dn-Instanzen verwenden Nvidia Tesla T4-GPUs.
| Instance | Anzahl der vCPUs | Arbeitsspeicher | Anzahl der GPUs | GPU-Arbeitsspeicher |
|---|---|---|---|---|
| omics.g4dn.xlarge | 4 | 16 GiB | 1 | 16 GiB |
| omics.g4dn.2xlarge | 8 | 32 GiB | 1 | 16 GiB |
| omics.g4dn.4xlarge | 16 | 64 GiB | 1 | 16 GiB |
| omics.g4dn.8xlarge | 32 | 128 GiB | 1 | 16 GiB |
| omics.g4dn.12xlarge | 48 | 192 GiB | 4 | 64 GiB |
| omics.g4dn.16xlarge | 64 | 256 GiB | 1 | 24 GiB |