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Versionshinweise zur Nextflow-Version für HealthOmics
Diese Seite enthält Versionshinweise für jede unterstützte Nextflow-Version von. HealthOmics Jeder Abschnitt fasst neue Funktionen, Verbesserungen und veraltete Funktionen für eine bestimmte Nextflow-Version zusammen.
Versionshinweise zu Nextflow v26.04
Die folgenden Tabellen fassen die HealthOmics Unterstützung für neue Funktionen, Verbesserungen und veraltete Funktionen zusammen, die in Nextflow Version 26.04 veröffentlicht wurden.
Neue Features und Verbesserungen
| Feature | Von Version | HealthOmics Unterstützung | Hinweise |
|---|---|---|---|
| Strikter Syntaxparser (Standard) | 26,04 | Ja | Ab v26.04 standardmäßig aktiviert. Legacy-Parser ist syntaxVersion: "v1" in den Engine-Einstellungen verfügbar. |
| Datensatztypen | 26.04 | Ja | Weitere Informationen finden Sie unter Records |
| Zusammenfassungen der Workflow-Ausgaben | 26.04 | Ja | Druckt nach Abschluss des Laufs eine Zusammenfassung der Workflow-Ausgaben. Das Ausgabeformat ist über outputFormat die Engine-Einstellungen konfigurierbar. Weitere Informationen finden Sie unter Geben Sie die Nextflow-Engine-Einstellungen an. |
| Agenten-Protokollierungsmodus | 26.04 | Ja | Konfigurierbar über die agentMode Motoreinstellungen. Weitere Informationen finden Sie unter Geben Sie die Nextflow-Engine-Einstellungen an. |
| Modulsystem (Nextflow Registry) | 26,04 | Nein | HealthOmics Workflows werden in einem isolierten Netzwerk ohne ausgehenden Internetzugang ausgeführt. Sie können Module direkt in Ihre Workflow-Zip-Datei aufnehmen. |
| Statisches Tippen (Vorschau) | 26,04 | Nein | HealthOmics unterstützt keine Vorschaufunktionen. |
| Auto-load Sammlungsparameter aus Dateien | 26,04 | Nein | Erfordert statisches Tippen (Vorschau), das HealthOmics nicht unterstützt wird. |
| Multi-revision Pipelines auschecken | 26,04 | N/A | Nicht zutreffend. HealthOmics verwendet keinen Git-based Pipeline-Checkout. |
Veraltungen
| Veralteter Artikel | Von Version | Auswirkung | Empfohlene Aktion |
|---|---|---|---|
listFiles()-Methode |
26.04 | Warnung vor Verfall | Ersetze durch. listDirectory() |
nextflow.enable.strict-Flag |
26.04 | Wird nicht mehr benötigt | Aus der Konfiguration entfernen. Der strikte Modus ist jetzt die Standardeinstellung. |
manifest.defaultBranch |
26.04 | Wird nicht mehr benötigt | Aus der Konfiguration entfernen. HealthOmics verwendet keinen Git-based Pipeline-Checkout und hat diese Option nie unterstützt. |
