Führen Sie einen MPI Job mit mehreren Knoten mit Slurm in aus AWS PCS - AWS PCS

Die vorliegende Übersetzung wurde maschinell erstellt. Im Falle eines Konflikts oder eines Widerspruchs zwischen dieser übersetzten Fassung und der englischen Fassung (einschließlich infolge von Verzögerungen bei der Übersetzung) ist die englische Fassung maßgeblich.

Führen Sie einen MPI Job mit mehreren Knoten mit Slurm in aus AWS PCS

Diese Anweisungen demonstrieren die Verwendung von Slurm zur Ausführung eines Interface-Jobs (MPI) für die Nachrichtenübergabe in. AWS PCS

Führen Sie die folgenden Befehle an einer Shell-Eingabeaufforderung Ihres Login-Knotens aus.

  • Werden Sie der Standardbenutzer. Wechseln Sie in sein Home-Verzeichnis. 

    sudo su - ec2-user
cd ~/

  • Erstellen Sie Quellcode in der Programmiersprache C. 

    cat > hello.c << EOF
// * mpi-hello-world - https://www.mpitutorial.com
// Released under MIT License
// 
// Copyright (c) 2014 MPI Tutorial.
//
// Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
// of this software and associated documentation files (the "Software"), to 
// deal in the Software without restriction, including without limitation the 
// rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or 
// sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is 
// furnished to do so, subject to the following conditions:
// The above copyright notice and this permission notice shall be included in 
// all copies or substantial portions of the Software.
//
// THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR 
// IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, 
// FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
// AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER 
// LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING 
// FROM, OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER 
// DEALINGS IN THE SOFTWARE.

#include <mpi.h>
#include <stdio.h>
#include <stddef.h>

int main(int argc, char** argv) {
  // Initialize the MPI environment. The two arguments to MPI Init are not
  // currently used by MPI implementations, but are there in case future
  // implementations might need the arguments.
  MPI_Init(NULL, NULL);

  // Get the number of processes
  int world_size;
  MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &world_size);

  // Get the rank of the process
  int world_rank;
  MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &world_rank);

  // Get the name of the processor
  char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];
  int name_len;
  MPI_Get_processor_name(processor_name, &name_len);

  // Print off a hello world message
  printf("Hello world from processor %s, rank %d out of %d processors\n",
         processor_name, world_rank, world_size);

  // Finalize the MPI environment. No more MPI calls can be made after this
  MPI_Finalize();
}
EOF

  • Laden Sie das MPI Open-Modul.

    module load openmpi

  • Kompilieren Sie das C-Programm.

    mpicc -o hello hello.c

  • Schreiben Sie ein Slurm-Job-Skript.

    cat > hello.sh << EOF
#!/bin/bash
#SBATCH -J multi
#SBATCH -o multi.out
#SBATCH -e multi.err
#SBATCH --exclusive
#SBATCH --nodes=4
#SBATCH --ntasks-per-node=1

srun $HOME/hello
EOF

  • Wechseln Sie in das gemeinsam genutzte Verzeichnis.

    cd /shared

  • Reichen Sie das Jobskript ein.

    sbatch -p demo ~/hello.sh

  • Wird verwendetsqueue, um den Job zu überwachen, bis er erledigt ist.

  • Überprüfen Sie den Inhalt vonmulti.out:

    cat multi.out

    Die Ausgabe sieht folgendermaßen oder ähnlich aus. Beachten Sie, dass jeder Rang seine eigene IP-Adresse hat, da er auf einem anderen Knoten lief.

    Hello world from processor ip-10-3-133-204, rank 0 out of 4 processors
Hello world from processor ip-10-3-128-219, rank 2 out of 4 processors
Hello world from processor ip-10-3-141-26, rank 3 out of 4 processors
Hello world from processor ip-10-3-143-52, rank 1 out of 4 processor