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Verifique el estado del flujo de trabajo - AWS HealthOmics

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Verifique el estado del flujo de trabajo

Tras crear el flujo de trabajo, puede verificar el estado y ver otros detalles del flujo de trabajo mediante get-workflow, como se muestra a continuación.

aws omics get-workflow --id 1234567

La respuesta incluye los detalles del flujo de trabajo, incluido el estado, como se muestra.

{
    "arn": "arn:aws:omics:us-west-2:....",
    "creationTime": "2022-07-06T00:27:05.542459" 
    "id": "1234567",
    "engine": "WDL",
    "status": "ACTIVE",
    "type": "PRIVATE",
    "main": "workflow-crambam.wdl",
    "name": "workflow_name",
    "storageType": "STATIC",
    "storageCapacity": "1200",
    "uuid": "64c9a39e-8302-cc45-0262-2ea7116d854f"   
  }

Puede iniciar una ejecución con este flujo de trabajo después de que el estado pase aACTIVE.

nota

En el caso de los flujos de trabajo de la DSL2 de Nextflow, HealthOmics ejecuta el sistema Strict Linter integrado durante la creación. Si el linter detecta errores o advertencias, el flujo de trabajo sigue pasando a ACTIVE y el statusMessage campo contiene los resultados estructurados de lint. Si inicias una ejecución en un flujo de trabajo con errores de linter, es posible que la ejecución falle debido a una definición de flujo de trabajo incorrecta. Para ver un ejemplo de la GetWorkflow respuesta con los resultados de Lint, consulte. El flujo de trabajo apunta a HealthOmics