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Accélérateurs de tâches dans un HealthOmics définition du flux de travail
Dans la définition du flux de travail, vous pouvez éventuellement spécifier la spécification de l'accélérateur GPU pour une tâche. HealthOmics prend en charge les valeurs de spécification d'accélérateur suivantes, ainsi que les types d'instances pris en charge :
| Spécifications de l'accélérateur | Types d'instances Healthomics |
|---|---|
| nvidia-tesla-t4 | G4 |
| nvidia-tesla-t4-a10g | G4 et G5 |
| nvidia-tesla-a10g | G5 |
| nvidia-t4-a10g-l4 | G4, G5 et G6 |
| nvidia-l4-a10g | G5 et G6 |
| nvidia-L4 | G6 |
| nvidia-années 40 | G6e |
Si vous spécifiez un type d'accélérateur qui prend en charge plusieurs types d'instances, HealthOmics sélectionne le type d'instance en fonction de la capacité disponible. Si les deux types d'instances sont disponibles, HealthOmics donne la préférence à l'instance la moins coûteuse. L'exception concerne l'accélérateur de tâches nvidia-t4-a10g-l4 qui donne la préférence à l'instance de dernière génération disponible.
Pour plus de détails sur les types d'instances, consultez Accelerated-computing instances.
Dans l'exemple suivant, la définition du flux de travail spécifie nvidia-l4 comme accélérateur :
Configuration avancée des ressources
Vous pouvez également configurer une tâche pour réserver plusieurs accélérateurs dans l'ordre de priorité de votre choix à l'aide du omicsResourceFallbackOrder directive. Cette directive est disponible pour WDL et Nextflow. HealthOmics essaie chaque profil d'accélérateur dans l'ordre que vous avez défini jusqu'à ce que l'un d'entre eux réussisse, y compris un profil de processeur final facultatif.
Cela est utile dans les scénarios suivants :
-
Solution de repli GPU à GPU — Répertoriez les types de GPU par ordre de priorité (par exemple, essayez
nvidia-l40sd'abord, puis revenez ànvidia-l4). -
Solution de repli entre GPU — Ajouter une finale CPU-only profil afin que la tâche soit terminée même lorsqu'aucune capacité GPU n'est disponible dans la région.
Pour plus de détails sur omicsResourceFallbackOrder, y compris une référence de champ par profil, des règles de validation et des exemples complets de WDL et Nextflow, voir Configuration avancée des ressources.
