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HealthOmics の Nextflow バージョンのリリースノート
このページには、HealthOmics でサポートされている各 Nextflow バージョンのリリースノートが含まれています。各セクションには、特定の Nextflow バージョンの新機能、機能強化、廃止がまとめられています。
Nextflow v26.04 リリースノート
次の表は、Nextflow バージョン 26.04 でリリースされた新機能、機能強化、廃止に関する HealthOmics のサポートをまとめたものです。
新しい特徴と拡張機能
| 機能 | 元のバージョン | HealthOmics のサポート | 注意事項 |
|---|---|---|---|
| 厳密な構文パーサー (デフォルト) | 26.04 | はい | v26.04 からデフォルトで有効になっています。エンジン設定syntaxVersion: "v1"で を介して利用可能なレガシーパーサー。 |
| レコード型 | 26.04 | はい | 詳細については、Seqera Nextflow ドキュメントの「レコード |
| ワークフロー出力の概要 | 26.04 | はい | 実行完了時にワークフロー出力の概要を出力します。エンジン設定outputFormatで を介して設定可能な出力形式。詳細については、「Nextflow エンジン設定の指定」を参照してください。 |
| エージェントログ記録モード | 26.04 | はい | エンジン設定agentModeで を介して設定可能。詳細については、「Nextflow エンジン設定の指定」を参照してください。 |
| モジュールシステム (Nextflow レジストリ) | 26.04 | いいえ | HealthOmics ワークフローは、アウトバウンドインターネットアクセスのない独立したネットワークで実行されます。ワークフロー zip にモジュールを直接含めることができます。 |
| 静的型付け (プレビュー) | 26.04 | いいえ | HealthOmics はプレビュー機能をサポートしていません。 |
| ファイルからコレクションパラメータを自動ロードする | 26.04 | いいえ | HealthOmics がサポートしていない静的型付け (プレビュー) が必要です。 |
| マルチリビジョンパイプラインのチェックアウト | 26.04 | 該当なし | 該当なし。HealthOmics は Git ベースのパイプラインチェックアウトを使用しません。 |
非推奨
| 非推奨の項目 | 元のバージョン | Impact | 推奨されるアクション |
|---|---|---|---|
listFiles() 方法 |
26.04 | 非推奨の警告 | を に置き換えますlistDirectory()。 |
nextflow.enable.strict フラグ |
26.04 | 不要 | 設定から を削除します。Strict モードがデフォルトになりました。 |
manifest.defaultBranch |
26.04 | 不要 | 設定から を削除します。HealthOmics は Git ベースのパイプラインチェックアウトを使用せず、このオプションをサポートしたこともありません。 |
