HealthOmics에서 프라이빗 워크플로 생성

Workflow definition file: WDL, Nextflow또는 로 작성된 워크플로 정의 파일입니다CWL. 워크플로 정의는 워크플로를 사용하는 실행에 대한 입력 및 출력을 지정합니다. 또한 컴퓨팅 및 메모리 요구 사항을 포함하여 워크플로의 실행 및 실행 작업에 대한 사양도 포함되어 있습니다. 워크플로 정의 파일은 .zip 형식이어야 합니다. 자세한 내용은 워크플로 정의 파일을 참조하세요.

Container images: 워크플로에 퍼블릭 레지스트리 또는 자체 리포지토리의 컨테이너 이미지가 필요한 경우 실행에 대한 Amazon Elastic Container Registry(Amazon ECR) 및 AWS Identity and Access Management (IAM) 권한을 구성할 수 있습니다. HealthOmics를 사용하면 , Amazon ECR PublicDocker Hub, GitHub Container Registry, GitLab Container Registry, Google Artifact 또는 Container Registry, Kubernetes Container Registry, Container Registry, NVIDIA NGC, 및의 자체 프라이빗 컨테이너 Quay및 Microsoft Azure 컨테이너 이미지를 사용할 수 있습니다Seqera Containers. 지원되는 레지스트리에 대한 자세한 내용은 섹션을 참조하세요프라이빗 워크플로용 컨테이너 이미지.

(Optional) Parameter template file:에 작성된 파라미터 템플릿 파일입니다JSON. 파일을 생성하여 실행 파라미터를 정의하거나 HealthOmics가 파라미터 템플릿을 생성합니다. 자세한 내용은 HealthOmics 워크플로용 파라미터 템플릿 파일을 참조하세요.

(Optional) README file: README 파일을 사용하여 포괄적인 설명서, 구현 세부 정보 및 다이어그램을 생물 정보학 워크플로 및 워크플로 버전에 직접 첨부할 수 있습니다. README 파일은 중요한 워크플로 문서를 위한 중앙 위치를 제공하여 워크플로 관리를 개선하여 연구 팀 간에 보다 효과적인 지식 공유를 지원합니다. 자세한 내용은 워크플로 README 파일을 참조하세요.

(Optional) Sentieon licenses: 프라이빗 워크플로에서 Sentieon 소프트웨어를 사용할 수 있는 Sentieon 라이선스를 요청합니다.

(Optional) Illumina DRAGEN: 프라이빗 워크플로에서 Illumina DRAGEN 소프트웨어 모드를 작업으로 실행합니다. 자세한 내용은 HealthOmics의 Illumina DRAGEN 프라이빗 워크플로 섹션을 참조하세요.

워크플로 린터: 워크플로 정의를 린트하여 오류와 경고를 조기에 포착합니다. HealthOmics에는 워크플로 생성 중에 실행되는 내장 린터가 포함되어 있으며, 워크플로를 생성하기 전에 선택적으로 로컬에서 린터를 실행할 수 있습니다. 내장 린터가 문제를 발견하면에 구조화된 린트 결과가 표시statusMessage되므로 문제를 검토하고 수정할 수 있습니다.

지원되는 언어 사양 및 엔진 버전: HealthOmics는 세 가지 워크플로 언어로 작성된 워크플로 정의를 지원합니다. 각 언어에는 자체 구문, 기능 및 버전 지원이 있습니다.