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Notas de lançamento da versão Nextflow para HealthOmics
Esta página contém notas de lançamento para cada versão compatível do Nextflow em. HealthOmics Cada seção resume novos recursos, aprimoramentos e suspensões de uso para uma versão específica do Nextflow.
Notas de lançamento do Nextflow v26.04
As tabelas a seguir resumem o HealthOmics suporte para novos recursos, aprimoramentos e suspensões lançados no Nextflow versão 26.04.
Novos recursos e aprimoramentos
| Recurso | Da versão | HealthOmics apoio | Observações |
|---|---|---|---|
| Analisador de sintaxe estrito (padrão) | 26,04 | Sim | Ativado por padrão a partir da v26.04. Analisador legado disponível syntaxVersion: "v1" nas configurações do motor. |
| Tipos de registro | 26,04 | Sim | Para obter mais informações, consulte Registros |
| Resumos de saída do fluxo de trabalho | 26,04 | Sim | Imprime um resumo das saídas do fluxo de trabalho ao concluir a execução. Formato de saída configurável através outputFormat das configurações do motor. Para obter mais informações, consulte Especifique as configurações do mecanismo Nextflow. |
| Modo de registro do agente | 26,04 | Sim | Configurável por meio agentMode das configurações do motor. Para obter mais informações, consulte Especifique as configurações do mecanismo Nextflow. |
| Sistema de módulos (Nextflow Registry) | 26,04 | Não | HealthOmics fluxos de trabalho são executados em uma rede isolada sem acesso externo à Internet. Você pode incluir módulos diretamente no zip do seu fluxo de trabalho. |
| Digitação estática (pré-visualização) | 26,04 | Não | HealthOmics não oferece suporte a recursos de visualização. |
| Auto-load parâmetros de coleta de arquivos | 26,04 | Não | Requer digitação estática (pré-visualização), que HealthOmics não é compatível. |
| Multi-revision finalização da compra de oleodutos | 26,04 | N/A | Não aplicável. HealthOmics não usa o checkout do Git-based pipeline. |
Defasagens
| Item obsoleto | Da versão | Impacto | Ação recomendada |
|---|---|---|---|
Método listFiles() |
26,04 | Aviso de depreciação | Substitua porlistDirectory(). |
sinalizador nextflow.enable.strict |
26,04 | Não é mais necessário | Remova da configuração. O modo estrito agora é o padrão. |
manifest.defaultBranch |
26,04 | Não é mais necessário | Remova da configuração. HealthOmics não usa o Git-based pipeline checkout e nunca suportou essa opção. |