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Verifique o status do fluxo de trabalho - AWS HealthOmics

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Verifique o status do fluxo de trabalho

Depois de criar seu fluxo de trabalho, você pode verificar o status e visualizar outros detalhes do fluxo de trabalho usando get-workflow, conforme mostrado.

aws omics get-workflow --id 1234567

A resposta inclui detalhes do fluxo de trabalho, incluindo o status, conforme mostrado.

{
    "arn": "arn:aws:omics:us-west-2:....",
    "creationTime": "2022-07-06T00:27:05.542459" 
    "id": "1234567",
    "engine": "WDL",
    "status": "ACTIVE",
    "type": "PRIVATE",
    "main": "workflow-crambam.wdl",
    "name": "workflow_name",
    "storageType": "STATIC",
    "storageCapacity": "1200",
    "uuid": "64c9a39e-8302-cc45-0262-2ea7116d854f"   
  }

Você pode iniciar uma execução usando esse fluxo de trabalho após a transição do status paraACTIVE.

nota

Para fluxos de trabalho Nextflow DSL2, HealthOmics executa o linter estrito integrado durante a criação. Se o linter detectar erros ou avisos, o fluxo de trabalho ainda fará a transição para ATIVO, com o statusMessage campo contendo resultados de lint estruturados. Se você iniciar uma execução em um fluxo de trabalho com erros de linter, sua execução poderá falhar devido a uma definição incorreta do fluxo de trabalho. Para obter um exemplo da GetWorkflow resposta com as descobertas do lint, consulteFluxo de trabalho intermitente em HealthOmics.