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在本地验证工作流程定义
在调用之前，您可以使用工作流语言自己的工具验证工作流程定义 CreateWorkflow 要么 CreateWorkflowVersion。它可以捕获语法错误和引用等无法解决的问题。
本地验证会根据工作流程语言检查您的定义，而不是根据工作流程语言检查您的定义 HealthOmics 要求。对于 linters 来说 HealthOmics 在工作流程创建期间运行，请参阅 工作流程提示器已输入 HealthOmics。
安装验证器
验证器是第三方软件 AWS 无法维护。
注意
你的运行版本可以使用比你使用的 Lint 版本更旧的 Nextflow 版本。这个 nextflow lint 命令使用严格的语法进行解析，您的运行可能不会使用该语法。因此，在重写定义以满足语法查找条件之前，请检查您的运行使用了哪个语法版本，如中所述 指定 Nextflow 语法版本。看怎么样 HealthOmics 选择 Nextflow 版本进行运行，请参阅 Nextflow版本。
运行验证器
对主定义文件运行验证器，对于 Nextflow，对包含该文件的目录运行验证器。
对于多文件包，使用与您上传到的 ZIP 存档中相同的相对路径将文件布局在磁盘上 HealthOmics。引用是根据声明它们的文件解析的，而不是你运行命令的目录来解析的。有关主文件要求，请参见 HealthOmics 工作流程定义要求。
通行证 nextflow lint 目录而不是主文件，因此它还会检查 nextflow.config，它无法从主文件中访问。
注意
当你通过时 -format， nextflow lint 重写没有错误的定义文件。使用 v25.10 或更高版本进行格式化可能会生成早期 Nextflow 版本拒绝的语法，因此，除非您的运行使用格式化的版本，否则不要进行格式化。
读取验证结果
miniwdl 和 nextflow lint 当他们报告错误时以非零状态退出，但当他们仅报告警告时以零状态退出，因此请阅读输出而不是依赖退出状态。
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WDL — miniwdl 要么报告它无法恢复的第一个错误，要么是它加载的每份文档的概述，其中包含任何 lint 发现的内容。
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Nextflow — Nextflow 使用其文件、行和列报告每个错误和警告，并引用违规行。它以计数有错误的文件和没有错误的文件数结尾，因此，带有警告但没有错误的文件被视为没有错误。要更改报告格式，请传递
-o，例如-o json。 -
CWL — cwltool 要么报告文件是有效的 CWL，要么报告每个问题的文件、行和列的验证失败。
注意
Nextflow 版本的报告量有所不同。Nextflow v26.04 将警告计入其摘要并将其包含在 -o json 输出。Nextflow v25.10 仅在默认输出中打印警告，并在其摘要或其摘要中不报告任何警告 -o json 输出。
