View a markdown version of this page

Sumber daya tugas dalam definisi HealthOmics alur kerja - AWS HealthOmics

Terjemahan disediakan oleh mesin penerjemah. Jika konten terjemahan yang diberikan bertentangan dengan versi bahasa Inggris aslinya, utamakan versi bahasa Inggris.

Sumber daya tugas dalam definisi HealthOmics alur kerja

Dalam definisi alur kerja, tentukan hal berikut untuk setiap tugas:

HealthOmics mengabaikan spesifikasi penyimpanan per tugas. HealthOmics menyediakan penyimpanan run yang dapat diakses oleh semua tugas dalam proses. Untuk informasi selengkapnya, lihat Jalankan jenis penyimpanan dalam HealthOmics alur kerja.

WDL
task my_task {
   runtime {
      container: "<aws-account-id>.dkr.ecr.<aws-region>.amazonaws.com/<image-name>"
      cpu: 2
      memory: "4 GB"
   }
   ...
}

Untuk alur kerja WDL, HealthOmics coba hingga dua kali percobaan ulang untuk tugas yang gagal karena kesalahan layanan (permintaan API mengembalikan kode status HTTP 5XX). Untuk informasi selengkapnya tentang percobaan ulang tugas, lihatTugas Mencoba Ulang.

Anda dapat memilih keluar dari perilaku coba lagi dengan menentukan konfigurasi berikut untuk tugas dalam file definisi WDL:

runtime {
   preemptible: 0
}
NextFlow
process my_task {
   container "<aws-account-id>.dkr.ecr.<aws-region>.amazonaws.com/<image-name>"
   cpus 2
   memory "4 GiB"
   ...
}
CWL
cwlVersion: v1.2
class: CommandLineTool
requirements:
    DockerRequirement:
        dockerPull: "<aws-account-id>.dkr.ecr.<aws-region>.amazonaws.com/<image-name>"
    ResourceRequirement:
        coresMax: 2
        ramMax: 4000 # specified in mebibytes